同源/共线性证据

跨参考基因组查看同源关系与共线性区块证据。

TkA01G624900 LXL04_000258 JCVI_TKOH_00001 基因 ID 对照

证据边界：TK1151 和 OH-1004 是同一物种的不同材料，本页展示两个参考基因组之间的同源与共线性 ID 对照，不是同一品种/同一基因组版本升级。区块来自 DIAMOND RBH 与坐标顺序锚点，后续仍可用 MCScanX/JCVI 继续复核。也支持直接输入 JCVI_TKOH_ 开头的区块 ID。

全局区块概览

共线性区块

427

ID 对照记录

84884

高置信区块

302

中置信区块

125

参考材料	组装	基因数	gap 数	端粒扫描
TK1151	`TK1151_GWHBCHF00000000`	45224	1917	0/9
OH-1004	`OH1004_GCA_047496595.1`	40057	131	0/711

查询解析

输入 ID

JCVI_TKOH_00270

解析类型

区块 ID

ID 对照 + 共线性联合证据

解析到的基因

无

未能直接匹配到橡胶草基因目录

关联结果

0 / 1 / 18

对照 / 区块 / 锚点

最佳区块: JCVI_TKOH_00270

当前输入已解析为共线性区块 ID，下面优先展示区块范围和锚点基因。

基因 ID 对照下载当前结果

线性共线性图

当前查询的最佳共线性区块以线性 ribbon 形式展示。

JCVI_TKOH_00270 Chr06 17164389-17877534 Chr05 109890511-110772704 mixed High 18 anchors

High Medium Other 仅绘制前 12 条锚点

锚点表按页展示，TSV 下载包含当前查询的全部锚点；上方 ribbon 仅展示当前区块的部分线性共线性骨架。

当前查询证据

当前查询没有可展示的 ID 对照记录。

共线性证据

区块	查询位置	目标位置	方向	当前映射锚点数	置信等级	备注
`JCVI_TKOH_00270`	Chr06:17164389-17877534	Chr05:109890511-110772704	mixed	18	高置信	Formal JCVI synteny block from rebuilt ID map pipeline.

区块锚点基因

锚点总数: 18 · 当前范围 1–18 · 页码 1/1

下载全部锚点 TSV

TkA06G063610 → LXL04_025328

93.5%

TkA06G063640 → LXL04_025331

83.2%

TkA06G063960 → LXL04_025333

96.0%

TkA06G063970 → LXL04_025334

100.0%

TkA06G064150 → LXL04_025336

100.0%

TkA06G064250 → LXL04_025337

98.8%

TkA06G064270 → LXL04_025339

81.2%

TkA06G064430 → LXL04_025343

100.0%

TkA06G064630 → LXL04_025345

99.6%

TkA06G065040 → LXL04_025348

98.2%

TkA06G065050 → LXL04_025349

90.6%

TkA06G065060 → LXL04_025350

100.0%

TK1151 基因	OH-1004 基因	区块	一致性	覆盖度	置信等级
`TkA06G063610`	`LXL04_025328`	`JCVI_TKOH_00270`	93.5	84.466 / 33.333	待复核
`TkA06G063640`	`LXL04_025331`	`JCVI_TKOH_00270`	83.2	100.0 / 70.74	待复核
`TkA06G063960`	`LXL04_025333`	`JCVI_TKOH_00270`	96.0	100.0 / 100.0	Strict
`TkA06G063970`	`LXL04_025334`	`JCVI_TKOH_00270`	100.0	100.0 / 100.0	Strict
`TkA06G064150`	`LXL04_025336`	`JCVI_TKOH_00270`	100.0	86.17 / 74.654	Probable
`TkA06G064250`	`LXL04_025337`	`JCVI_TKOH_00270`	98.8	32.762 / 26.3	待复核
`TkA06G064270`	`LXL04_025339`	`JCVI_TKOH_00270`	81.2	100.0 / 100.0	待复核
`TkA06G064430`	`LXL04_025343`	`JCVI_TKOH_00270`	100.0	77.344 / 37.643	待复核
`TkA06G064630`	`LXL04_025345`	`JCVI_TKOH_00270`	99.6	100.0 / 100.0	Strict
`TkA06G065040`	`LXL04_025348`	`JCVI_TKOH_00270`	98.2	100.0 / 97.126	Complex
`TkA06G065050`	`LXL04_025349`	`JCVI_TKOH_00270`	90.6	100.0 / 100.0	Complex
`TkA06G065060`	`LXL04_025350`	`JCVI_TKOH_00270`	100.0	100.0 / 100.0	Complex
`TkA06G065080`	`LXL04_025351`	`JCVI_TKOH_00270`	98.1	100.0 / 100.0	Strict
`TkA06G065090`	`LXL04_025355`	`JCVI_TKOH_00270`	100.0	96.178 / 24.121	待复核
`TkA06G065220`	`LXL04_025355`	`JCVI_TKOH_00270`	99.5	100.0 / 100.0	Complex
`TkA06G066550`	`LXL04_025366`	`JCVI_TKOH_00270`	91.9	100.0 / 100.0	Probable
`TkA06G066560`	`LXL04_025367`	`JCVI_TKOH_00270`	100.0	100.0 / 100.0	Strict
`TkA06G066620`	`LXL04_025376`	`JCVI_TKOH_00270`	74.4	59.722 / 98.851	待复核