同源/共线性证据

跨参考基因组查看同源关系与共线性区块证据。

TkA01G624900 LXL04_000258 JCVI_TKOH_00001 基因 ID 对照

证据边界：TK1151 和 OH-1004 是同一物种的不同材料，本页展示两个参考基因组之间的同源与共线性 ID 对照，不是同一品种/同一基因组版本升级。区块来自 DIAMOND RBH 与坐标顺序锚点，后续仍可用 MCScanX/JCVI 继续复核。也支持直接输入 JCVI_TKOH_ 开头的区块 ID。

全局区块概览

共线性区块

427

ID 对照记录

84884

高置信区块

302

中置信区块

125

参考材料	组装	基因数	gap 数	端粒扫描
TK1151	`TK1151_GWHBCHF00000000`	45224	1917	0/9
OH-1004	`OH1004_GCA_047496595.1`	40057	131	0/711

查询解析

输入 ID

JCVI_TKOH_00266

解析类型

区块 ID

ID 对照 + 共线性联合证据

解析到的基因

无

未能直接匹配到橡胶草基因目录

关联结果

0 / 1 / 19

对照 / 区块 / 锚点

最佳区块: JCVI_TKOH_00266

当前输入已解析为共线性区块 ID，下面优先展示区块范围和锚点基因。

基因 ID 对照下载当前结果

线性共线性图

当前查询的最佳共线性区块以线性 ribbon 形式展示。

JCVI_TKOH_00266 Chr06 10733627-11025980 Chr05 117334427-117690135 mixed High 19 anchors

High Medium Other 仅绘制前 12 条锚点

锚点表按页展示，TSV 下载包含当前查询的全部锚点；上方 ribbon 仅展示当前区块的部分线性共线性骨架。

当前查询证据

当前查询没有可展示的 ID 对照记录。

共线性证据

区块	查询位置	目标位置	方向	当前映射锚点数	置信等级	备注
`JCVI_TKOH_00266`	Chr06:10733627-11025980	Chr05:117334427-117690135	mixed	19	高置信	Formal JCVI synteny block from rebuilt ID map pipeline.

区块锚点基因

锚点总数: 19 · 当前范围 1–19 · 页码 1/1

下载全部锚点 TSV

TkA06G039750 → LXL04_025854

76.2%

TkA06G039810 → LXL04_025853

100.0%

TkA06G039830 → LXL04_025853

93.8%

TkA06G039900 → LXL04_025852

100.0%

TkA06G039920 → LXL04_025851

46.1%

TkA06G039930 → LXL04_025849

95.2%

TkA06G039940 → LXL04_025848

93.0%

TkA06G039990 → LXL04_025846

99.7%

TkA06G040090 → LXL04_025842

64.1%

TkA06G040130 → LXL04_025841

99.8%

TkA06G040140 → LXL04_025841

100.0%

TkA06G040160 → LXL04_025840

99.9%

TK1151 基因	OH-1004 基因	区块	一致性	覆盖度	置信等级
`TkA06G039750`	`LXL04_025854`	`JCVI_TKOH_00266`	76.2	98.696 / 69.846	Complex
`TkA06G039810`	`LXL04_025853`	`JCVI_TKOH_00266`	100.0	11.94 / 5.634	Complex
`TkA06G039830`	`LXL04_025853`	`JCVI_TKOH_00266`	93.8	100.0 / 40.053	待复核
`TkA06G039900`	`LXL04_025852`	`JCVI_TKOH_00266`	100.0	100.0 / 100.0	Strict
`TkA06G039920`	`LXL04_025851`	`JCVI_TKOH_00266`	46.1	100.0 / 94.07	Complex
`TkA06G039930`	`LXL04_025849`	`JCVI_TKOH_00266`	95.2	64.615 / 83.444	Complex
`TkA06G039940`	`LXL04_025848`	`JCVI_TKOH_00266`	93.0	100.0 / 94.273	Probable
`TkA06G039990`	`LXL04_025846`	`JCVI_TKOH_00266`	99.7	100.0 / 100.0	Complex
`TkA06G040090`	`LXL04_025842`	`JCVI_TKOH_00266`	64.1	100.0 / 100.0	Complex
`TkA06G040130`	`LXL04_025841`	`JCVI_TKOH_00266`	99.8	100.0 / 53.173	待复核
`TkA06G040140`	`LXL04_025841`	`JCVI_TKOH_00266`	100.0	100.0 / 22.429	待复核
`TkA06G040160`	`LXL04_025840`	`JCVI_TKOH_00266`	99.9	100.0 / 100.0	Strict
`TkA06G040170`	`LXL04_025839`	`JCVI_TKOH_00266`	100.0	100.0 / 100.0	Complex
`TkA06G040180`	`LXL04_025838`	`JCVI_TKOH_00266`	100.0	96.907 / 54.493	待复核
`TkA06G040240`	`LXL04_025835`	`JCVI_TKOH_00266`	89.3	100.0 / 92.484	Complex
`TkA06G040460`	`LXL04_025834`	`JCVI_TKOH_00266`	100.0	100.0 / 100.0	Complex
`TkA06G040470`	`LXL04_025832`	`JCVI_TKOH_00266`	94.2	98.646 / 67.874	待复核
`TkA06G040480`	`LXL04_025832`	`JCVI_TKOH_00266`	96.5	80.427 / 27.295	Complex
`TkA06G040750`	`LXL04_025830`	`JCVI_TKOH_00266`	99.8	100.0 / 100.0	Strict