同源/共线性证据

跨参考基因组查看同源关系与共线性区块证据。

TkA01G624900 LXL04_000258 JCVI_TKOH_00001 基因 ID 对照

证据边界：TK1151 和 OH-1004 是同一物种的不同材料，本页展示两个参考基因组之间的同源与共线性 ID 对照，不是同一品种/同一基因组版本升级。区块来自 DIAMOND RBH 与坐标顺序锚点，后续仍可用 MCScanX/JCVI 继续复核。也支持直接输入 JCVI_TKOH_ 开头的区块 ID。

全局区块概览

共线性区块

427

ID 对照记录

84884

高置信区块

302

中置信区块

125

参考材料	组装	基因数	gap 数	端粒扫描
TK1151	`TK1151_GWHBCHF00000000`	45224	1917	0/9
OH-1004	`OH1004_GCA_047496595.1`	40057	131	0/711

查询解析

输入 ID

JCVI_TKOH_00121

解析类型

区块 ID

ID 对照 + 共线性联合证据

解析到的基因

无

未能直接匹配到橡胶草基因目录

关联结果

0 / 1 / 18

对照 / 区块 / 锚点

最佳区块: JCVI_TKOH_00121

当前输入已解析为共线性区块 ID，下面优先展示区块范围和锚点基因。

基因 ID 对照下载当前结果

线性共线性图

当前查询的最佳共线性区块以线性 ribbon 形式展示。

JCVI_TKOH_00121 Chr03 353132-1116709 Chr02 382267-1093659 mixed High 18 anchors

High Medium Other 仅绘制前 12 条锚点

锚点表按页展示，TSV 下载包含当前查询的全部锚点；上方 ribbon 仅展示当前区块的部分线性共线性骨架。

当前查询证据

当前查询没有可展示的 ID 对照记录。

共线性证据

区块	查询位置	目标位置	方向	当前映射锚点数	置信等级	备注
`JCVI_TKOH_00121`	Chr03:353132-1116709	Chr02:382267-1093659	mixed	18	高置信	Formal JCVI synteny block from rebuilt ID map pipeline.

区块锚点基因

锚点总数: 18 · 当前范围 1–18 · 页码 1/1

下载全部锚点 TSV

TkA03G001310 → LXL04_006018

99.0%

TkA03G001870 → LXL04_006023

99.9%

TkA03G001880 → LXL04_006024

97.7%

TkA03G002440 → LXL04_006031

100.0%

TkA03G002460 → LXL04_006032

100.0%

TkA03G003060 → LXL04_006034

100.0%

TkA03G003170 → LXL04_006035

100.0%

TkA03G003190 → LXL04_006036

89.9%

TkA03G003270 → LXL04_006037

99.7%

TkA03G003280 → LXL04_006038

81.1%

TkA03G003380 → LXL04_006040

98.7%

TkA03G003780 → LXL04_006042

100.0%

TK1151 基因	OH-1004 基因	区块	一致性	覆盖度	置信等级
`TkA03G001310`	`LXL04_006018`	`JCVI_TKOH_00121`	99.0	100.0 / 100.0	待复核
`TkA03G001870`	`LXL04_006023`	`JCVI_TKOH_00121`	99.9	100.0 / 100.0	Strict
`TkA03G001880`	`LXL04_006024`	`JCVI_TKOH_00121`	97.7	100.0 / 100.0	Strict
`TkA03G002440`	`LXL04_006031`	`JCVI_TKOH_00121`	100.0	64.0 / 64.0	待复核
`TkA03G002460`	`LXL04_006032`	`JCVI_TKOH_00121`	100.0	88.971 / 94.902	Strict
`TkA03G003060`	`LXL04_006034`	`JCVI_TKOH_00121`	100.0	23.153 / 28.659	待复核
`TkA03G003170`	`LXL04_006035`	`JCVI_TKOH_00121`	100.0	100.0 / 95.944	Strict
`TkA03G003190`	`LXL04_006036`	`JCVI_TKOH_00121`	89.9	100.0 / 88.449	待复核
`TkA03G003270`	`LXL04_006037`	`JCVI_TKOH_00121`	99.7	100.0 / 100.0	Strict
`TkA03G003280`	`LXL04_006038`	`JCVI_TKOH_00121`	81.1	76.923 / 29.371	待复核
`TkA03G003380`	`LXL04_006040`	`JCVI_TKOH_00121`	98.7	100.0 / 100.0	Strict
`TkA03G003780`	`LXL04_006042`	`JCVI_TKOH_00121`	100.0	100.0 / 100.0	Strict
`TkA03G003830`	`LXL04_006043`	`JCVI_TKOH_00121`	100.0	100.0 / 100.0	Strict
`TkA03G003850`	`LXL04_006045`	`JCVI_TKOH_00121`	99.6	99.194 / 95.72	Strict
`TkA03G003980`	`LXL04_006046`	`JCVI_TKOH_00121`	100.0	100.0 / 100.0	Strict
`TkA03G004460`	`LXL04_006049`	`JCVI_TKOH_00121`	99.5	100.0 / 75.686	Complex
`TkA03G004720`	`LXL04_006050`	`JCVI_TKOH_00121`	98.0	100.0 / 99.674	Complex
`TkA03G004730`	`LXL04_006051`	`JCVI_TKOH_00121`	100.0	100.0 / 100.0	Complex