同源/共线性证据

跨参考基因组查看同源关系与共线性区块证据。

证据边界:TK1151 和 OH-1004 是同一物种的不同材料,本页展示两个参考基因组之间的同源与共线性 ID 对照,不是同一品种/同一基因组版本升级。区块来自 DIAMOND RBH 与坐标顺序锚点,后续仍可用 MCScanX/JCVI 继续复核。也支持直接输入 JCVI_TKOH_ 开头的区块 ID。

全局区块概览

共线性区块
427
ID 对照记录
84884
高置信区块
302
中置信区块
125
参考材料组装基因数gap 数端粒扫描
TK1151 TK1151_GWHBCHF00000000 45224 1917 0/9
OH-1004 OH1004_GCA_047496595.1 40057 131 0/711

查询解析

输入 ID
JCVI_TKOH_00108
解析类型
区块 ID
ID 对照 + 共线性联合证据
解析到的基因
无
未能直接匹配到橡胶草基因目录
关联结果
0 / 1 / 2
对照 / 区块 / 锚点
最佳区块: JCVI_TKOH_00108

当前输入已解析为共线性区块 ID,下面优先展示区块范围和锚点基因。

线性共线性图

当前查询的最佳共线性区块以线性 ribbon 形式展示。

JCVI_TKOH_00108 Chr02 110053613-110788283 Chr07 31479342-31574509 mixed Medium 2 anchors
Chr02 110053613-110788283 Chr07 31479342-31574509 JCVI_TKOH_00108 · 2 gene pairs TkA02G433200 | LXL04_032903 | 88.3% | non_reciprocal_best_hit | Complex TkA02G435930 | LXL04_032915 | 74.2% | non_reciprocal_best_hit | Complex
High Medium Other 仅绘制前 12 条锚点
锚点表按页展示,TSV 下载包含当前查询的全部锚点;上方 ribbon 仅展示当前区块的部分线性共线性骨架。

当前查询证据

当前查询没有可展示的 ID 对照记录。

共线性证据

区块查询位置目标位置方向当前映射锚点数置信等级备注
JCVI_TKOH_00108 Chr02:110053613-110788283 Chr07:31479342-31574509 mixed 2 中等置信 Formal JCVI synteny block from rebuilt ID map pipeline.

区块锚点基因

锚点总数: 2 · 当前范围 1–2 · 页码 1/1

TkA02G433200 → LXL04_032903
88.3%
TkA02G435930 → LXL04_032915
74.2%
TK1151 基因OH-1004 基因区块一致性覆盖度置信等级
TkA02G433200LXL04_032903JCVI_TKOH_0010888.398.67 / 90.722Complex
TkA02G435930LXL04_032915JCVI_TKOH_0010874.298.745 / 82.857Complex