同源/共线性证据

跨参考基因组查看同源关系与共线性区块证据。

TkA01G624900 LXL04_000258 JCVI_TKOH_00001 基因 ID 对照

证据边界：TK1151 和 OH-1004 是同一物种的不同材料，本页展示两个参考基因组之间的同源与共线性 ID 对照，不是同一品种/同一基因组版本升级。区块来自 DIAMOND RBH 与坐标顺序锚点，后续仍可用 MCScanX/JCVI 继续复核。也支持直接输入 JCVI_TKOH_ 开头的区块 ID。

全局区块概览

共线性区块

427

ID 对照记录

84884

高置信区块

302

中置信区块

125

参考材料	组装	基因数	gap 数	端粒扫描
TK1151	`TK1151_GWHBCHF00000000`	45224	1917	0/9
OH-1004	`OH1004_GCA_047496595.1`	40057	131	0/711

查询解析

输入 ID

JCVI_TKOH_00099

解析类型

区块 ID

ID 对照 + 共线性联合证据

解析到的基因

无

未能直接匹配到橡胶草基因目录

关联结果

0 / 1 / 22

对照 / 区块 / 锚点

最佳区块: JCVI_TKOH_00099

当前输入已解析为共线性区块 ID，下面优先展示区块范围和锚点基因。

基因 ID 对照下载当前结果

线性共线性图

当前查询的最佳共线性区块以线性 ribbon 形式展示。

JCVI_TKOH_00099 Chr02 158454419-158957576 Chr03 14149-679210 mixed High 22 anchors

High Medium Other 仅绘制前 12 条锚点

锚点表按页展示，TSV 下载包含当前查询的全部锚点；上方 ribbon 仅展示当前区块的部分线性共线性骨架。

当前查询证据

当前查询没有可展示的 ID 对照记录。

共线性证据

区块	查询位置	目标位置	方向	当前映射锚点数	置信等级	备注
`JCVI_TKOH_00099`	Chr02:158454419-158957576	Chr03:14149-679210	mixed	22	高置信	Formal JCVI synteny block from rebuilt ID map pipeline.

区块锚点基因

锚点总数: 22 · 当前范围 1–22 · 页码 1/1

下载全部锚点 TSV

TkA02G614480 → LXL04_011797

100.0%

TkA02G614490 → LXL04_011798

93.8%

TkA02G614690 → LXL04_011801

99.7%

TkA02G614730 → LXL04_011803

99.1%

TkA02G614930 → LXL04_011805

100.0%

TkA02G615080 → LXL04_011796

98.3%

TkA02G615310 → LXL04_011792

100.0%

TkA02G615790 → LXL04_011790

84.1%

TkA02G615810 → LXL04_011789

93.9%

TkA02G615920 → LXL04_011786

100.0%

TkA02G616140 → LXL04_011783

97.5%

TkA02G616150 → LXL04_011784

98.2%

TK1151 基因	OH-1004 基因	区块	一致性	覆盖度	置信等级
`TkA02G614480`	`LXL04_011797`	`JCVI_TKOH_00099`	100.0	100.0 / 100.0	Strict
`TkA02G614490`	`LXL04_011798`	`JCVI_TKOH_00099`	93.8	57.312 / 71.429	待复核
`TkA02G614690`	`LXL04_011801`	`JCVI_TKOH_00099`	99.7	100.0 / 99.564	Strict
`TkA02G614730`	`LXL04_011803`	`JCVI_TKOH_00099`	99.1	90.598 / 72.603	Probable
`TkA02G614930`	`LXL04_011805`	`JCVI_TKOH_00099`	100.0	100.0 / 100.0	Strict
`TkA02G615080`	`LXL04_011796`	`JCVI_TKOH_00099`	98.3	66.473 / 76.222	待复核
`TkA02G615310`	`LXL04_011792`	`JCVI_TKOH_00099`	100.0	100.0 / 100.0	待复核
`TkA02G615790`	`LXL04_011790`	`JCVI_TKOH_00099`	84.1	97.938 / 94.273	待复核
`TkA02G615810`	`LXL04_011789`	`JCVI_TKOH_00099`	93.9	95.142 / 70.772	Probable
`TkA02G615920`	`LXL04_011786`	`JCVI_TKOH_00099`	100.0	33.813 / 36.434	待复核
`TkA02G616140`	`LXL04_011783`	`JCVI_TKOH_00099`	97.5	100.0 / 100.0	Strict
`TkA02G616150`	`LXL04_011784`	`JCVI_TKOH_00099`	98.2	92.135 / 100.0	Strict
`TkA02G616160`	`LXL04_011782`	`JCVI_TKOH_00099`	99.7	100.0 / 100.0	Strict
`TkA02G616170`	`LXL04_011781`	`JCVI_TKOH_00099`	99.7	100.0 / 100.0	Strict
`TkA02G616180`	`LXL04_011780`	`JCVI_TKOH_00099`	98.5	100.0 / 100.0	Complex
`TkA02G616230`	`LXL04_011779`	`JCVI_TKOH_00099`	100.0	100.0 / 100.0	Strict
`TkA02G616280`	`LXL04_011778`	`JCVI_TKOH_00099`	98.8	99.13 / 45.059	待复核
`TkA02G616320`	`LXL04_011777`	`JCVI_TKOH_00099`	100.0	100.0 / 100.0	Complex
`TkA02G616330`	`LXL04_011780`	`JCVI_TKOH_00099`	75.0	100.0 / 100.0	Complex
`TkA02G616520`	`LXL04_011776`	`JCVI_TKOH_00099`	100.0	100.0 / 48.425	待复核
`TkA02G616530`	`LXL04_011775`	`JCVI_TKOH_00099`	100.0	100.0 / 68.88	待复核
`TkA02G616570`	`LXL04_011773`	`JCVI_TKOH_00099`	100.0	100.0 / 100.0	Strict