同源/共线性证据
跨参考基因组查看同源关系与共线性区块证据。
证据边界:TK1151 和 OH-1004 是同一物种的不同材料,本页展示两个参考基因组之间的同源与共线性 ID 对照,不是同一品种/同一基因组版本升级。区块来自 DIAMOND RBH 与坐标顺序锚点,后续仍可用 MCScanX/JCVI 继续复核。也支持直接输入 JCVI_TKOH_ 开头的区块 ID。
全局区块概览
共线性区块
427
ID 对照记录
84884
高置信区块
302
中置信区块
125
| 参考材料 | 组装 | 基因数 | gap 数 | 端粒扫描 |
|---|---|---|---|---|
| TK1151 | TK1151_GWHBCHF00000000 |
45224 | 1917 | 0/9 |
| OH-1004 | OH1004_GCA_047496595.1 |
40057 | 131 | 0/711 |
查询解析
输入 ID
JCVI_TKOH_00033
解析类型
区块 ID
ID 对照 + 共线性联合证据
解析到的基因
无
未能直接匹配到橡胶草基因目录
关联结果
0 / 1 / 40
对照 / 区块 / 锚点
最佳区块:
JCVI_TKOH_00033当前输入已解析为共线性区块 ID,下面优先展示区块范围和锚点基因。
线性共线性图
当前查询的最佳共线性区块以线性 ribbon 形式展示。
High
Medium
Other
仅绘制前 12 条锚点
锚点表按页展示,TSV 下载包含当前查询的全部锚点;上方 ribbon 仅展示当前区块的部分线性共线性骨架。
当前查询证据
当前查询没有可展示的 ID 对照记录。
共线性证据
| 区块 | 查询位置 | 目标位置 | 方向 | 当前映射锚点数 | 置信等级 | 备注 |
|---|---|---|---|---|---|---|
JCVI_TKOH_00033 |
Chr01:114816376-116125925 | Chr01:49457621-50905232 | mixed | 40 | 高置信 | Formal JCVI synteny block from rebuilt ID map pipeline. |
区块锚点基因
锚点总数: 40 · 当前范围 1–40 · 页码 1/1
| TK1151 基因 | OH-1004 基因 | 区块 | 一致性 | 覆盖度 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
TkA01G458490 | LXL04_002532 | JCVI_TKOH_00033 | 99.5 | 100.0 / 100.0 | Strict |
TkA01G458700 | LXL04_002531 | JCVI_TKOH_00033 | 96.8 | 99.2 / 10.992 | 待复核 |
TkA01G458720 | LXL04_002531 | JCVI_TKOH_00033 | 100.0 | 89.241 / 12.601 | 待复核 |
TkA01G458750 | LXL04_002531 | JCVI_TKOH_00033 | 99.7 | 100.0 / 93.923 | Strict |
TkA01G458760 | LXL04_002530 | JCVI_TKOH_00033 | 96.9 | 100.0 / 100.0 | Complex |
TkA01G458770 | LXL04_002529 | JCVI_TKOH_00033 | 100.0 | 100.0 / 100.0 | Strict |
TkA01G458790 | LXL04_002528 | JCVI_TKOH_00033 | 99.9 | 98.446 / 100.0 | Strict |
TkA01G458800 | LXL04_002527 | JCVI_TKOH_00033 | 91.7 | 100.0 / 83.558 | Probable |
TkA01G458840 | LXL04_002526 | JCVI_TKOH_00033 | 99.0 | 100.0 / 100.0 | Complex |
TkA01G458950 | LXL04_002525 | JCVI_TKOH_00033 | 99.4 | 100.0 / 100.0 | Strict |
TkA01G459090 | LXL04_002524 | JCVI_TKOH_00033 | 100.0 | 100.0 / 100.0 | Strict |
TkA01G459190 | LXL04_002522 | JCVI_TKOH_00033 | 97.5 | 84.885 / 73.653 | Probable |
TkA01G459240 | LXL04_002521 | JCVI_TKOH_00033 | 98.1 | 9.012 / 6.574 | 待复核 |
TkA01G459420 | LXL04_002520 | JCVI_TKOH_00033 | 96.0 | 100.0 / 95.533 | Complex |
TkA01G459430 | LXL04_002519 | JCVI_TKOH_00033 | 99.3 | 100.0 / 100.0 | Strict |
TkA01G459440 | LXL04_002520 | JCVI_TKOH_00033 | 74.2 | 87.574 / 54.639 | Complex |
TkA01G459550 | LXL04_002515 | JCVI_TKOH_00033 | 83.4 | 100.0 / 100.0 | 待复核 |
TkA01G459640 | LXL04_002514 | JCVI_TKOH_00033 | 100.0 | 100.0 / 100.0 | Complex |
TkA01G459660 | LXL04_002513 | JCVI_TKOH_00033 | 99.0 | 99.414 / 44.454 | 待复核 |
TkA01G459680 | LXL04_002513 | JCVI_TKOH_00033 | 97.3 | 100.0 / 51.266 | 待复核 |
TkA01G459930 | LXL04_002509 | JCVI_TKOH_00033 | 90.1 | 98.182 / 72.36 | Probable |
TkA01G460860 | LXL04_002502 | JCVI_TKOH_00033 | 99.9 | 100.0 / 100.0 | Strict |
TkA01G460870 | LXL04_002501 | JCVI_TKOH_00033 | 99.7 | 91.733 / 98.006 | Strict |
TkA01G461100 | LXL04_002498 | JCVI_TKOH_00033 | 91.1 | 88.596 / 99.02 | Complex |
TkA01G461360 | LXL04_002494 | JCVI_TKOH_00033 | 94.9 | 100.0 / 100.0 | Probable |
TkA01G461410 | LXL04_002493 | JCVI_TKOH_00033 | 97.5 | 75.769 / 86.784 | Complex |
TkA01G461430 | LXL04_002490 | JCVI_TKOH_00033 | 100.0 | 82.967 / 56.767 | Complex |
TkA01G461740 | LXL04_002490 | JCVI_TKOH_00033 | 99.3 | 82.967 / 56.767 | Complex |
TkA01G461750 | LXL04_002487 | JCVI_TKOH_00033 | 99.1 | 96.328 / 99.706 | Strict |
TkA01G461770 | LXL04_002486 | JCVI_TKOH_00033 | 100.0 | 100.0 / 87.751 | Strict |
TkA01G462240 | LXL04_002485 | JCVI_TKOH_00033 | 100.0 | 100.0 / 100.0 | Complex |
TkA01G462330 | LXL04_002484 | JCVI_TKOH_00033 | 100.0 | 100.0 / 92.414 | 待复核 |
TkA01G462350 | LXL04_002482 | JCVI_TKOH_00033 | 99.5 | 100.0 / 100.0 | Complex |
TkA01G462710 | LXL04_002480 | JCVI_TKOH_00033 | 100.0 | 98.883 / 36.722 | 待复核 |
TkA01G462720 | LXL04_002480 | JCVI_TKOH_00033 | 100.0 | 66.854 / 24.689 | Complex |
TkA01G463010 | LXL04_002478 | JCVI_TKOH_00033 | 100.0 | 100.0 / 100.0 | Complex |
TkA01G463030 | LXL04_002477 | JCVI_TKOH_00033 | 99.6 | 100.0 / 100.0 | Strict |
TkA01G463050 | LXL04_002476 | JCVI_TKOH_00033 | 98.3 | 100.0 / 82.353 | Complex |
TkA01G463430 | LXL04_002474 | JCVI_TKOH_00033 | 95.0 | 99.371 / 34.632 | 待复核 |
TkA01G463440 | LXL04_002474 | JCVI_TKOH_00033 | 100.0 | 80.508 / 20.563 | Complex |