同源/共线性证据

跨参考基因组查看同源关系与共线性区块证据。

TkA01G624900 LXL04_000258 JCVI_TKOH_00001 基因 ID 对照

证据边界：TK1151 和 OH-1004 是同一物种的不同材料，本页展示两个参考基因组之间的同源与共线性 ID 对照，不是同一品种/同一基因组版本升级。区块来自 DIAMOND RBH 与坐标顺序锚点，后续仍可用 MCScanX/JCVI 继续复核。也支持直接输入 JCVI_TKOH_ 开头的区块 ID。

全局区块概览

共线性区块

427

ID 对照记录

84884

高置信区块

302

中置信区块

125

参考材料	组装	基因数	gap 数	端粒扫描
TK1151	`TK1151_GWHBCHF00000000`	45224	1917	0/9
OH-1004	`OH1004_GCA_047496595.1`	40057	131	0/711

查询解析

输入 ID

JCVI_TKOH_00021

解析类型

区块 ID

ID 对照 + 共线性联合证据

解析到的基因

无

未能直接匹配到橡胶草基因目录

关联结果

0 / 1 / 18

对照 / 区块 / 锚点

最佳区块: JCVI_TKOH_00021

当前输入已解析为共线性区块 ID，下面优先展示区块范围和锚点基因。

基因 ID 对照下载当前结果

线性共线性图

当前查询的最佳共线性区块以线性 ribbon 形式展示。

JCVI_TKOH_00021 Chr01 80288685-83233608 Chr01 86285056-89975884 mixed High 18 anchors

High Medium Other 仅绘制前 12 条锚点

锚点表按页展示，TSV 下载包含当前查询的全部锚点；上方 ribbon 仅展示当前区块的部分线性共线性骨架。

当前查询证据

当前查询没有可展示的 ID 对照记录。

共线性证据

区块	查询位置	目标位置	方向	当前映射锚点数	置信等级	备注
`JCVI_TKOH_00021`	Chr01:80288685-83233608	Chr01:86285056-89975884	mixed	18	高置信	Formal JCVI synteny block from rebuilt ID map pipeline.

区块锚点基因

锚点总数: 18 · 当前范围 1–18 · 页码 1/1

下载全部锚点 TSV

TkA01G322930 → LXL04_003633

99.4%

TkA01G322990 → LXL04_003633

99.3%

TkA01G324510 → LXL04_003614

100.0%

TkA01G324550 → LXL04_003612

97.0%

TkA01G324610 → LXL04_003611

100.0%

TkA01G325430 → LXL04_003609

100.0%

TkA01G325620 → LXL04_003608

100.0%

TkA01G327580 → LXL04_003605

98.8%

TkA01G331540 → LXL04_003591

100.0%

TkA01G332340 → LXL04_003588

98.4%

TkA01G333210 → LXL04_003582

98.8%

TkA01G333250 → LXL04_003580

94.3%

TK1151 基因	OH-1004 基因	区块	一致性	覆盖度	置信等级
`TkA01G322930`	`LXL04_003633`	`JCVI_TKOH_00021`	99.4	100.0 / 100.0	Complex
`TkA01G322990`	`LXL04_003633`	`JCVI_TKOH_00021`	99.3	100.0 / 100.0	Complex
`TkA01G324510`	`LXL04_003614`	`JCVI_TKOH_00021`	100.0	98.701 / 24.281	待复核
`TkA01G324550`	`LXL04_003612`	`JCVI_TKOH_00021`	97.0	100.0 / 100.0	Complex
`TkA01G324610`	`LXL04_003611`	`JCVI_TKOH_00021`	100.0	100.0 / 92.25	Strict
`TkA01G325430`	`LXL04_003609`	`JCVI_TKOH_00021`	100.0	100.0 / 86.357	Complex
`TkA01G325620`	`LXL04_003608`	`JCVI_TKOH_00021`	100.0	100.0 / 100.0	Strict
`TkA01G327580`	`LXL04_003605`	`JCVI_TKOH_00021`	98.8	100.0 / 75.771	Complex
`TkA01G331540`	`LXL04_003591`	`JCVI_TKOH_00021`	100.0	100.0 / 71.642	Complex
`TkA01G332340`	`LXL04_003588`	`JCVI_TKOH_00021`	98.4	100.0 / 100.0	Strict
`TkA01G333210`	`LXL04_003582`	`JCVI_TKOH_00021`	98.8	100.0 / 100.0	Strict
`TkA01G333250`	`LXL04_003580`	`JCVI_TKOH_00021`	94.3	99.496 / 99.329	Complex
`TkA01G333350`	`LXL04_003580`	`JCVI_TKOH_00021`	96.5	100.0 / 100.0	Complex
`TkA01G334440`	`LXL04_003575`	`JCVI_TKOH_00021`	94.1	100.0 / 100.0	Complex
`TkA01G334450`	`LXL04_003574`	`JCVI_TKOH_00021`	91.4	55.311 / 35.782	待复核
`TkA01G334940`	`LXL04_003571`	`JCVI_TKOH_00021`	100.0	100.0 / 98.284	Strict
`TkA01G334950`	`LXL04_003570`	`JCVI_TKOH_00021`	99.3	100.0 / 100.0	Strict
`TkA01G335080`	`LXL04_003567`	`JCVI_TKOH_00021`	78.1	100.0 / 100.0	待复核