同源/共线性证据
跨参考基因组查看同源关系与共线性区块证据。
证据边界：TK1151 和 OH-1004 是同一物种的不同材料，本页展示两个参考基因组之间的同源与共线性 ID 对照，不是同一品种/同一基因组版本升级。区块来自 DIAMOND RBH 与坐标顺序锚点，后续仍可用 MCScanX/JCVI 继续复核。也支持直接输入 JCVI_TKOH_ 开头的区块 ID。
全局区块概览
共线性区块
427
ID 对照记录
84884
高置信区块
302
中置信区块
125
| 参考材料 | 组装 | 基因数 | gap 数 | 端粒扫描 |
|---|---|---|---|---|
| TK1151 | TK1151_GWHBCHF00000000 |
45224 | 1917 | 0/9 |
| OH-1004 | OH1004_GCA_047496595.1 |
40057 | 131 | 0/711 |
查询解析
输入 ID
JCVI_TKOH_00013
解析类型
区块 ID
ID 对照 + 共线性联合证据
解析到的基因
无
未能直接匹配到橡胶草基因目录
关联结果
0 / 1 / 11
对照 / 区块 / 锚点
最佳区块:
JCVI_TKOH_00013当前输入已解析为共线性区块 ID，下面优先展示区块范围和锚点基因。
线性共线性图
当前查询的最佳共线性区块以线性 ribbon 形式展示。
High
Medium
Other
仅绘制前 12 条锚点
锚点表按页展示，TSV 下载包含当前查询的全部锚点；上方 ribbon 仅展示当前区块的部分线性共线性骨架。
当前查询证据
当前查询没有可展示的 ID 对照记录。
共线性证据
| 区块 | 查询位置 | 目标位置 | 方向 | 当前映射锚点数 | 置信等级 | 备注 |
|---|---|---|---|---|---|---|
JCVI_TKOH_00013 |
Chr01:57040558-60414460 | Chr01:113989563-118381404 | mixed | 11 | 高置信 | Formal JCVI synteny block from rebuilt ID map pipeline. |
区块锚点基因
锚点总数: 11 · 当前范围 1–11 · 页码 1/1
| TK1151 基因 | OH-1004 基因 | 区块 | 一致性 | 覆盖度 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
TkA01G224350 | LXL04_003959 | JCVI_TKOH_00013 | 62.1 | 100.0 / 100.0 | Complex |
TkA01G225500 | LXL04_003963 | JCVI_TKOH_00013 | 100.0 | 100.0 / 100.0 | Strict |
TkA01G225900 | LXL04_003944 | JCVI_TKOH_00013 | 100.0 | 100.0 / 88.136 | Strict |
TkA01G226280 | LXL04_003943 | JCVI_TKOH_00013 | 100.0 | 100.0 / 100.0 | Strict |
TkA01G227170 | LXL04_003936 | JCVI_TKOH_00013 | 100.0 | 90.391 / 84.95 | Strict |
TkA01G233570 | LXL04_003912 | JCVI_TKOH_00013 | 97.5 | 93.077 / 32.44 | 待复核 |
TkA01G235280 | LXL04_003916 | JCVI_TKOH_00013 | 96.9 | 92.308 / 83.063 | Complex |
TkA01G235300 | LXL04_003917 | JCVI_TKOH_00013 | 74.9 | 100.0 / 98.953 | Complex |
TkA01G235310 | LXL04_003918 | JCVI_TKOH_00013 | 94.1 | 100.0 / 67.937 | Complex |
TkA01G238440 | LXL04_003910 | JCVI_TKOH_00013 | 97.6 | 100.0 / 53.39 | 待复核 |
TkA01G238790 | LXL04_003908 | JCVI_TKOH_00013 | 99.6 | 92.089 / 77.355 | Probable |