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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G270350
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 70445011-70448291 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2024 bp · TkA08G270350|TK1151|cDNA

TTTTTTACCTTACCATGTACATGTAGTCATGTACCGTCTGTGACTCCAACTTCCAATTGTGAGAGTACCAAGTACCAGACCTTCAACGTGGAAGTGAAACCACCACATCCACATCCAAATCCACCTTCTTCTTCTTCCTCCAGCTCTTCTTGCCGTCTCTTCTCTCTACCGATTGTACAAATGGCATATCTAAATGCCGCTGCCGCCGCCTCCCTATCTGCTTCAGCAGTCCTCGCTCCTCTCAACCGTACATTTGTTCA...

CDS

下载 CDS FASTA

1767 bp · TkA08G270350|TK1151|CDS

TTTTTTACCTTACCATGTACATGTAGTCATGTACCGTCTGTGACTCCAACTTCCAATTGTGAGAGTACCAAGTACCAGACCTTCAACGTGGAAGTGAAACCACCACATCCACATCCAAATCCACCTTCTTCTTCTTCCTCCAGCTCTTCTTGCCGTCTCTTCTCTCTACCGATTGTACAAATGGCATATCTAAATGCCGCTGCCGCCGCCTCCCTATCTGCTTCAGCAGTCCTCGCTCCTCTCAACCGTACATTTGTTCA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

588 aa · TkA08G270350|TK1151|PROTEIN

FFTLPCTCSHVPSVTPTSNCESTKYQTFNVEVKPPHPHPNPPSSSSSSSSCRLFSLPIVQMAYLNAAAAASLSASAVLAPLNRTFVHWGKLFQGSSCVKFHSNSLFFGSTPRSRQLRLVSSAMDGKNLRSNELSQEEAMKSYSWPDKKRPRVCILGGGFGGLYTALRLDSLTWPDDKKPQVILVDQSERFVFKPMLYELLTGEVDAWEIAPRFSDLLVNTAVQFVKDRVKVLSPCDHVGMNGQAVSGHGGSVQLESGVVI...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G270350
TK1151 IDTkA08G270350
OH-1004 IDLXL04_033524
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Probable
蛋白一致性 (%)98.100
蛋白覆盖度 (%)TK1151 98.639 / OH-1004 76.416
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G270350
位置Chr08:70445011-70448291 (-)
描述Similar to NDC1: Alternative NAD(P)H-ubiquinone oxidoreductase C1, chloroplastic/mitochondrial
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g08740 双功能氧化还原酶既能作用于异戊二烯基萘醌，也能作用于异戊二烯基苯醌。
Arabidopsis genes encoding mitochondrial type II NAD(P)H dehydrogenases have different evolutionary origin and show distinct responses to light.2003 · DOI: 10.1104/pp.103.024208
A Dedicated Type II NADPH Dehydrogenase Performs the Penultimate Step in the Biosynthesis of Vitamin K1 in Synechocystis and Arabidopsis.2015 · DOI: 10.1105/tpc.15.00103

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_033524 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0019646 aerobic electron transport chain 生物过程
GO:0042372 phylloquinone biosynthetic process 生物过程
GO:0071482 cellular response to light stimulus 生物过程
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005743 mitochondrial inner membrane 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009505 plant-type cell wall 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0009534 chloroplast thylakoid 细胞组分
GO:0010287 plastoglobule 细胞组分
GO:0003955 NAD(P)H dehydrogenase (quinone) activity 分子功能
GO:0008137 NADH dehydrogenase (ubiquinone) activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT5G08740
bsu:BSU32100
hin:HI_0747
ssp:SSP1834
syn:slr1743
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

质体0.974
排名 1 · TkA08G270350 · TK1151
线粒体0.041
排名 2 · TkA08G270350 · TK1151
细胞质0.022
排名 3 · TkA08G270350 · TK1151
细胞核0.019
排名 4 · TkA08G270350 · TK1151
细胞膜0.014
排名 5 · TkA08G270350 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF07992Pyr_redox_2151-488 aa
PF00070Pyr_redox151-169 aa
PF01266DAO151-187 aa
PF13454NAD_binding_9154-189 aa
PF13450NAD_binding_8154-188 aa
PF13454NAD_binding_9248-270 aa
PF13434Lys_Orn_oxgnase265-352 aa
PF04430DUF498279-343 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G270350PF07992Pyr_redox_21514886.3e-36125.0
TkA08G270350PF00070Pyr_redox1511699e-0626.8
TkA08G270350PF01266DAO1511870.1112.8
TkA08G270350PF13454NAD_binding_91541890.02415.3
TkA08G270350PF13450NAD_binding_81541880.1413.2
TkA08G270350PF13454NAD_binding_92482700.02415.3
TkA08G270350PF13434Lys_Orn_oxgnase2653520.02114.7
TkA08G270350PF04430DUF4982793430.2911.9
TkA08G270350PF13660DUF41472803450.1712.0
TkA08G270350PF00070Pyr_redox3163989e-0626.8
TkA08G270350PF01266DAO3163360.1112.8
TkA08G270350PF13454NAD_binding_93183390.02415.3
TkA08G270350PF13450NAD_binding_83193360.1413.2
TkA08G270350PF13434Lys_Orn_oxgnase3794290.02114.7
TkA08G270350PF04430DUF4983934080.2911.9
TkA08G270350PF13450NAD_binding_85555690.1413.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8GXR9拟南芥sp|Q8GXR9|NDC1_ARATH Alternative NAD(P)H-ubiquinone oxidoreductase C1, chloroplastic/mitochondrial73.100%Swiss-Prot高置信

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