RubberDandelionOmics 橡胶草多组学网站
更多
转录组数据查询 注释 橡胶合成 转录因子预测 靶基因 蛋白关联网络 重测序 工具 下载
ZH EN

本页使用教程

基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA07G269960
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 67495123-67497363 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1787 bp · TkA07G269960|TK1151|cDNA

GAAAGCCGCAACTGGCATTCTATATTAAGACCGTGCATAAGTTTCTTGCTGATGGAATCTCATTGTTGGGTCTGGTGTTACTCAATGATGTCTGAATGTTTCGTATTAAAGAAGAAGCCTAGGGCTTGGATTTTTCGTATTTCAAAATTTAAAGATGAATTGGTTTTTTAGTTGCTCCAATTCCAAAGACGACGAAACTGATTTGAGAGTCAATCTTCTTGCAGCTCATGAAAAGGGAGAAACATGCGACGATGTTACAA...

CDS

下载 CDS FASTA

987 bp · TkA07G269960|TK1151|CDS

ATGAATTGGTTTTTTAGTTGCTCCAATTCCAAAGACGACGAAACTGATTTGAGAGTCAATCTTCTTGCAGCTCATGAAAAGGGAGAAACATGCGACGATGTTACAAAGTCCATGATCGGGAAAAGGTTTACACATAGTGAGCTTGCTTCTGCAACACGAAATTTCAAGAATCTGATAGGAGAAGGGAACTTCGGATGTGTTTATAAGGGTGTACTAAAATCCGGAGAAATGGTCGCTGTAAAGCAGCTAAAGGAAAAATA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

328 aa · TkA07G269960|TK1151|PROTEIN

MNWFFSCSNSKDDETDLRVNLLAAHEKGETCDDVTKSMIGKRFTHSELASATRNFKNLIGEGNFGCVYKGVLKSGEMVAVKQLKEKYNLKFNVDAHALMFSHSNLVTLIDYCTDGDKKFLVSEYMPLGSLQNHLFDLKPKQKPIDWSTRLKIAVGVARGLEYLHCKTNPPVIYRYMRSSNILLDNDFNPKLSDFGVVEDESNARHYVPVLGYCTPEYLGAFKWTLKSDIYSFGVVLLELITGRKAFDDTKKQEERCLVDW...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G269960
TK1151 IDTkA07G269960
OH-1004 IDLXL04_029075
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)98.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G269960
位置Chr07:67495123-67497363 (+)
描述Similar to PBL21: Probable serine/threonine-protein kinase PBL21
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g20650 可能参与植物防御信号传导。 暂无已核实直接文献
At5g02800 参与正向调控油菜素甾醇（BR）信号转导和植物生长的丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶。 暂无已核实直接文献
At5g18610 可能作为受体样胞质激酶，参与几丁质诱导的免疫信号转导。
Selective regulation of the chitin-induced defense response by the Arabidopsis receptor-like cytoplasmic kinase PBL27.2014 · DOI: 10.1111/tpj.12535
The Arabidopsis CERK1-associated kinase PBL27 connects chitin perception to MAPK activation.2016 · DOI: 10.15252/embj.201694248
At1g76370 可能参与植物防御信号传导。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os05g0372100 在介导先天免疫的微生物肽聚糖 和真菌几丁质信号通路中充当 CERK1 的直接下游信号传导伴侣。
A receptor-like cytoplasmic kinase targeted by a plant pathogen effector is directly phosphorylated by the chitin receptor and mediates rice immunity.2013 · DOI: 10.1016/j.chom.2013.02.007
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_029075 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0002758 innate immune response-activating signaling pathway 生物过程
GO:0006468 protein phosphorylation 生物过程
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0009742 brassinosteroid mediated signaling pathway 生物过程
GO:0010183 pollen tube guidance 生物过程
GO:0043410 positive regulation of MAPK cascade 生物过程
GO:0045087 innate immune response 生物过程
GO:0045088 regulation of innate immune response 生物过程
GO:0050832 defense response to fungus 生物过程
GO:0071323 cellular response to chitin 生物过程
GO:1900150 regulation of defense response to fungus 生物过程
GO:1900426 positive regulation of defense response to bacterium 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G20650
ath:AT1G76370
ath:AT5G02800
ath:AT5G18610
dosa:Os05g0372100
osa:4338592
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.693
排名 1 · TkA07G269960 · TK1151
细胞质0.228
排名 2 · TkA07G269960 · TK1151
细胞核0.201
排名 3 · TkA07G269960 · TK1151
内质网0.043
排名 4 · TkA07G269960 · TK1151
高尔基体0.026
排名 5 · TkA07G269960 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF07714PK_Tyr_Ser-Thr55-313 aa
PF00069Pkinase56-255 aa
PF03109ABC159-102 aa
PF03109ABC1178-201 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G269960PF07714PK_Tyr_Ser-Thr553139.7e-37127.4
TkA07G269960PF00069Pkinase562556.3e-37128.1
TkA07G269960PF03109ABC1591020.001918.1
TkA07G269960PF03109ABC11782010.001918.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LDZ5拟南芥sp|Q9LDZ5|PBL21_ARATH Probable serine/threonine-protein kinase PBL2154.600%Swiss-Prot高置信
Q0WRY5拟南芥sp|Q0WRY5|PBL7_ARATH Probable serine/threonine-protein kinase PBL750.300%Swiss-Prot高置信
Q1PDV6拟南芥sp|Q1PDV6|PBL27_ARATH Serine/threonine-protein kinase PBL2752.700%Swiss-Prot高置信
Q9SFX0拟南芥sp|Q9SFX0|PBL22_ARATH Probable serine/threonine-protein kinase PBL2252.900%Swiss-Prot高置信
Q6I5Q6水稻sp|Q6I5Q6|RK185_ORYSJ Receptor-like cytoplasmic kinase 18552.900%Swiss-Prot高置信

JBrowse

在基因组浏览器中查看