TkA06G368490 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA06G368490

当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 91259038-91262471 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

2328 bp · TkA06G368490|TK1151|cDNA

CGTGGATGGTGTGGTGTCGAAGCACTCTATGTATCATGTATGTTAGCCCATACCCGTCTCTTGTTCACCGTTTCTTTCTCTTCGCCTTGGGGTAGTGCTTGATTACAAAAGCAAAATTCGCACAAAAAATGCAAATGCTCTGTAGATCACTAGTACCTTCTGCCATGGCTGCTCTCCCTTCTTCCGAGGTTTCCTCCCTTTTCCCTCTTCACTCCTCACCCTTTCTAGTTTATCTCCTGTGTTAATTTGGTATATACTCT...

CDS

下载 CDS FASTA

1077 bp · TkA06G368490|TK1151|CDS

ATGAGGGAGGAAAAGTTGAAAGGAAAAGGAACTCATATAGAAAAGTTAGGGGAAAGATCAGGAAGAATTTGTCAAAACTGGAAAAAAGCTGAATCAATCAACTTAGAAACCATGTCTCTCCATGACAATGTTTGGGAAAAGAAGGCAAGAAGAATGGTCTGTGTATGGCCAGGTATAAGGCAACTATGCCTTAGGAAACACCTTATGTATGGCTTTATGCAGTTGTTTTCATTTCCATTCAAAACCTTGAGAGGAGTCAG...

蛋白

下载蛋白 FASTA

358 aa · TkA06G368490|TK1151|PROTEIN

MREEKLKGKGTHIEKLGERSGRICQNWKKAESINLETMSLHDNVWEKKARRMVCVWPGIRQLCLRKHLMYGFMQLFSFPFKTLRGVSRSLGVSHLCSISNMSTSLQIELVPCLKDNYAYLLHDLDTGTVGVVDPSESLPIIDALSKNNRNLTYILNTHHHYDHTGGNMDLKARYGAKVIGSNVDRDRIPGIDISLNDGDTWMFAGHEVHVIATPGHTKGHISFYFPASGAIFTGDTLFSLSCGKLFEGTPEQMHASLEKL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA06G368490`
TK1151 ID	TkA06G368490
OH-1004 ID	LXL04_023324
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)	100.000
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA06G368490

位置 Chr06:91259038-91262471 (-)

描述 Similar to GLX2-4: Probable hydroxyacylglutathione hydrolase 2, chloroplastic

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At1g06130`	巯酯酶，催化S-D-乳酸-谷胱甘肽的水解反应，形成谷胱甘肽和D-乳酸。	暂无已核实直接文献
`At2g31350`	巯酯酶，催化S-D-乳酸-谷胱甘肽的水解反应，形成谷胱甘肽和D-乳酸。	暂无已核实直接文献
`At2g43430`	巯酯酶，催化S-D-乳酸-谷胱甘肽的水解反应，形成谷胱甘肽和D-乳酸。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_023324 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0009651 response to salt stress 生物过程

GO:0017001 antibiotic catabolic process 生物过程

GO:0019243 methylglyoxal catabolic process to D-lactate via S-lactoyl-glutathione 生物过程

GO:0034059 response to anoxia 生物过程

GO:0043200 response to amino acid 生物过程

GO:0005737 cytoplasm 细胞组分

GO:0005739 mitochondrion 细胞组分

GO:0009507 chloroplast 细胞组分

GO:0004416 hydroxyacylglutathione hydrolase activity 分子功能

GO:0005506 iron ion binding 分子功能

GO:0008270 zinc ion binding 分子功能

GO:0008800 beta-lactamase activity 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G06130

ath:AT2G31350

ath:AT2G43430

cya:CYA_1132

mmr:Mmar10_2381

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

线粒体0.603

排名 1 · TkA06G368490 · TK1151

细胞质0.249

排名 2 · TkA06G368490 · TK1151

细胞核0.114

排名 3 · TkA06G368490 · TK1151

过氧化物酶体0.098

排名 4 · TkA06G368490 · TK1151

质体0.080

排名 5 · TkA06G368490 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF16707CagS80-145 aa

PF00753Lactamase_B118-273 aa

PF23023Anti-Pycsar_Apyc1144-166 aa

PF12706Lactamase_B_2145-173 aa

PF19583ODP194-242 aa

PF23023Anti-Pycsar_Apyc1249-266 aa

PF16123HAGH_C274-358 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA06G368490	`PF16707`	CagS	80	145	0.096	13.4
TkA06G368490	`PF00753`	Lactamase_B	118	273	1.5e-22	81.3
TkA06G368490	`PF23023`	Anti-Pycsar_Apyc1	144	166	0.036	14.5
TkA06G368490	`PF12706`	Lactamase_B_2	145	173	0.0016	18.8
TkA06G368490	`PF19583`	ODP	194	242	0.054	14.1
TkA06G368490	`PF23023`	Anti-Pycsar_Apyc1	249	266	0.036	14.5
TkA06G368490	`PF16123`	HAGH_C	274	358	7e-26	91.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q8LDW8`	拟南芥	sp\|Q8LDW8\|GLO2D_ARATH Probable hydroxyacylglutathione hydrolase 2, chloroplastic	71.800%	Swiss-Prot	高置信
`Q9SID3`	拟南芥	sp\|Q9SID3\|GLO2N_ARATH Hydroxyacylglutathione hydrolase 2, mitochondrial	70.700%	Swiss-Prot	高置信
`O24495`	拟南芥	sp\|O24495\|GLO2M_ARATH Hydroxyacylglutathione hydrolase 1, mitochondrial	68.000%	Swiss-Prot	高置信

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