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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA06G012730
当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 3304795-3305634 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

840 bp · TkA06G012730|TK1151|cDNA

ATGATTTTGCCTCTTAGTGGCAGAGATTCACCTTCTGCAATCGCTACAACACCATACGGGTCAGTCCACGTCTCTCATGGCAGCAAAATTACATCTTTCGATTGGTCTTTACAACGAAAGTCAACGACTTTGACCCAATTCACGGCTATTGATTCTTTATTAGCTTTATCATCAAATGTTGTGGCAGCTGGTGCCACTGATTTTTCAGGTTTGCAAATTATTGATCTTGAATTGGGTCATGTTAGACAGACTATAAATTG...

CDS

下载 CDS FASTA

840 bp · TkA06G012730|TK1151|CDS

ATGATTTTGCCTCTTAGTGGCAGAGATTCACCTTCTGCAATCGCTACAACACCATACGGGTCAGTCCACGTCTCTCATGGCAGCAAAATTACATCTTTCGATTGGTCTTTACAACGAAAGTCAACGACTTTGACCCAATTCACGGCTATTGATTCTTTATTAGCTTTATCATCAAATGTTGTGGCAGCTGGTGCCACTGATTTTTCAGGTTTGCAAATTATTGATCTTGAATTGGGTCATGTTAGACAGACTATAAATTG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

279 aa · TkA06G012730|TK1151|PROTEIN

MILPLSGRDSPSAIATTPYGSVHVSHGSKITSFDWSLQRKSTTLTQFTAIDSLLALSSNVVAAGATDFSGLQIIDLELGHVRQTINWENVTKSGSTVQAIGASPELLFTSFESSRRNSNSVLVYDLNDSFKVVSELGHNEIFGADLDSAIPSTKLNWIPSLKLLMASGSHSGPSGVSGNIKFWDIRSGNLVTEIKEKVNCFSDITVSDTLSAVFKIGTNSGEVSYIDFRNILSDNSWNCLGDSRKVMNVKKKGLVVRLKV...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA06G012730
TK1151 IDTkA06G012730
OH-1004 IDLXL04_026428
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)94.400
蛋白覆盖度 (%)TK1151 96.774 / OH-1004 56.367
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA06G012730
位置Chr06:3304795-3305634 (+)
描述Similar to At5g41330: BTB/POZ domain-containing protein At5g41330
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g41330 可能作为 E3 泛素-蛋白连接酶复合物 (CUL3-RBX1-BTB) 的底物特异性适配子，介导靶蛋白的泛素化及随后的蛋白酶体降解。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_026428 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006511 ubiquitin-dependent protein catabolic process 生物过程
GO:0006886 intracellular protein transport 生物过程
GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程
GO:0016567 protein ubiquitination 生物过程
GO:0035024 negative regulation of Rho protein signal transduction 生物过程
GO:0043161 proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process 生物过程
GO:0045746 negative regulation of Notch signaling pathway 生物过程
GO:0050832 defense response to fungus 生物过程
GO:0051260 protein homooligomerization 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005654 nucleoplasm 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G24240
ath:AT3G09030
ath:AT4G30940
ath:AT5G41330
mmu:330171
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.537
排名 1 · TkA06G012730 · TK1151
细胞质0.466
排名 2 · TkA06G012730 · TK1151
线粒体0.045
排名 3 · TkA06G012730 · TK1151
过氧化物酶体0.040
排名 4 · TkA06G012730 · TK1151
溶酶体／液泡0.040
排名 5 · TkA06G012730 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF25279Beta_prop_At2g2424011-268 aa
PF25171Beta-prop_WDR36-Utp21_1st20-89 aa
PF24814WD40_Prp1928-89 aa
PF24807WD40_CDC20-Fz30-196 aa
PF24796WDR5545-67 aa
PF25174Beta-prop_THOC358-88 aa
PF25171Beta-prop_WDR36-Utp21_1st117-168 aa
PF24807WD40_CDC20-Fz154-232 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA06G012730PF25279Beta_prop_At2g24240112682.2e-0834.1
TkA06G012730PF25171Beta-prop_WDR36-Utp21_1st20890.003117.7
TkA06G012730PF24814WD40_Prp1928890.06313.1
TkA06G012730PF24807WD40_CDC20-Fz301960.0004520.3
TkA06G012730PF24796WDR5545670.001418.4
TkA06G012730PF25174Beta-prop_THOC358880.01315.3
TkA06G012730PF25171Beta-prop_WDR36-Utp21_1st1171680.003117.7
TkA06G012730PF24807WD40_CDC20-Fz1542320.0004520.3
TkA06G012730PF25174Beta-prop_THOC31542310.01315.3
TkA06G012730PF24814WD40_Prp191752090.06313.1
TkA06G012730PF24796WDR551772290.001418.4
TkA06G012730PF25171Beta-prop_WDR36-Utp21_1st1772290.003117.7
TkA06G012730PF24807WD40_CDC20-Fz2132550.0004520.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9FN67拟南芥sp|Q9FN67|Y5133_ARATH BTB/POZ domain-containing protein At5g4133062.000%Swiss-Prot高置信

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