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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID,查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度,最大 10000 bp

基因概览

TkA05G432660
当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 107942223-107944716 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

2116 bp · TkA05G432660|TK1151|cDNA

GCCCGCGATACACATCAACAGAACTCGCGCCAATTTGTGTAGGAGCTGTAACCTTCTGCATATCTTTTCGGATCTAAATTGTGCTGGTGAATAGTGTTTGAGGATGGCCGGGAAAGGTGAAGGTCCGGCGATCGGAATTGATCTAGGTACGACGTATTCATGCGTCGGAGTGTGGCAGCATGATCGAGTTGAGATCATCGCGAATGATCAAGGCAACAGGACGACTCCTTCTTATGTTGCGTTTACGGATTCCGAGCGTC...

1950 bp · TkA05G432660|TK1151|CDS

ATGGCCGGGAAAGGTGAAGGTCCGGCGATCGGAATTGATCTAGGTACGACGTATTCATGCGTCGGAGTGTGGCAGCATGATCGAGTTGAGATCATCGCGAATGATCAAGGCAACAGGACGACTCCTTCTTATGTTGCGTTTACGGATTCCGAGCGTCTAATTGGTGATGCTGCTAAGAATCAGGTCGCCATGAATCCTATGAACACGGTCTTCGATGCAAAGCGACTAATTGGAAGGAGATTCAGCGACGCATCTGTTCA...

649 aa · TkA05G432660|TK1151|PROTEIN

MAGKGEGPAIGIDLGTTYSCVGVWQHDRVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDSERLIGDAAKNQVAMNPMNTVFDAKRLIGRRFSDASVQDDMKLWPFKITPGPAEKPMIGVDYKGESKQFAAEEISSMVLIKMREIAEAFVGSTVKNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVMRIINEPTAAAIAYGLDKKAASVGEKNVLIFDLGGGTFDVSILTIEEGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFVQEFKRKHKKDIT...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA05G432660
TK1151 IDTkA05G432660
OH-1004 IDLXL04_021942
关系 / 置信度序列支持,注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 25.622
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA05G432660
位置Chr05:107942223-107944716 (+)
描述Similar to HSP70-1: Heat shock 70 kDa protein 1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g12580 与其他伴侣蛋白合作,Hsp70 是关键组分,可促进新合成蛋白的折叠,协助前体蛋白转运进入细胞器,并负责在应激条件下降解受损蛋白(可能)。
At5g02490 在其他分子伴侣的协作下,Hsp70s 是促进新合成蛋白折叠、协助前体蛋白转运到细胞器,并在应激条件下负责损伤蛋白降解的关键成分。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源:OH1004 · LXL04_021942 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释(OH1004 来源)
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006457 protein folding 生物过程
GO:0006950 response to stress 生物过程
GO:0009408 response to heat 生物过程
GO:0009615 response to virus 生物过程
GO:0009617 response to bacterium 生物过程
GO:0010187 negative regulation of seed germination 生物过程
GO:0010286 heat acclimation 生物过程
GO:0042026 protein refolding 生物过程
GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程
GO:0050832 defense response to fungus 生物过程
GO:0090332 stomatal closure 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT5G02490
ath:AT5G02500
sly:101247772
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号,不代表本基因已获得通路功能验证。

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究;参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时,不自动选择表达记录;缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释,不能替代定位实验。

细胞质0.610
排名 1 · TkA05G432660 · TK1151
细胞核0.403
排名 2 · TkA05G432660 · TK1151
细胞膜0.124
排名 3 · TkA05G432660 · TK1151
线粒体0.089
排名 4 · TkA05G432660 · TK1151
内质网0.079
排名 5 · TkA05G432660 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测,非定位实验结果

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF01968Hydantoinase_A5-31 aa
PF00012HSP709-618 aa
PF06723MreB_Mbl9-67 aa
PF06723MreB_Mbl142-380 aa
PF01968Hydantoinase_A179-217 aa
PF02782FGGY_C317-385 aa
PF06723MreB_Mbl533-570 aa
PF01968Hydantoinase_A558-586 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA05G432660PF01968Hydantoinase_A5316.46.6
TkA05G432660PF00012HSP7096182.6e-260865.5
TkA05G432660PF06723MreB_Mbl9671e-1454.8
TkA05G432660PF06723MreB_Mbl1423801e-1454.8
TkA05G432660PF01968Hydantoinase_A1792176.46.6
TkA05G432660PF02782FGGY_C3173850.0414.5
TkA05G432660PF06723MreB_Mbl5335701e-1454.8
TkA05G432660PF01968Hydantoinase_A5585866.46.6
TkA05G432660PF15590Imm275766040.1812.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻;Swiss-Prot 为人工审校条目,TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LHA8拟南芥sp|Q9LHA8|HS704_ARATH Heat shock 70 kDa protein 487.700%Swiss-Prot高置信
P22954拟南芥sp|P22954|HS702_ARATH Heat shock 70 kDa protein 287.900%Swiss-Prot高置信

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