TkA05G402050 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA05G402050

当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 100068976-100071317 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

2026 bp · TkA05G402050|TK1151|cDNA

ATTTGATTCGCTCGCTCCCTACTGTTTTGACTGTTTGTAGGCAGACCCACTGAATTACCCTCTGGACTCACCTCCCTACTCTTTCCCTTCATCAAATTCTCCAATTCCCCCAAATTCTTGTCTCTTAGATGCGCATTTTGTCGATCAAACCCTTTTATAATGTTCCCATCAACGCTCTTCGATCTGCTCTCTTTAATATAAGAAGCTATAACCACCCAGCAAGAATCACAATCACAACCAATCCCAATTTCAGACTTTCT...

CDS

下载 CDS FASTA

543 bp · TkA05G402050|TK1151|CDS

ATGCATGGCTCTTTTTGCCAAGAATGGGGTTTTGATGTATCCAAAGAAACAATCCCAAACTCTGCAACTCTGAAATACACCGACTTCTTGTTCGCAACAGCGTCTGGGAAGATCGACGGCATAAATTGCTCTTCAAATCTAACTCCCCATTTTGAAAAAGCAAAAATTGCCGCATTCACTATAAGCGCAATGGTCCCTTGCATGAAGCTTTACGCTTTTCTCGGGAAAGGAGCTCAATTTCTGGTTGATGTAAATAACAA...

蛋白

下载蛋白 FASTA

180 aa · TkA05G402050|TK1151|PROTEIN

MHGSFCQEWGFDVSKETIPNSATLKYTDFLFATASGKIDGINCSSNLTPHFEKAKIAAFTISAMVPCMKLYAFLGKGAQFLVDVNNNRHPYKKWIDNYSSEAFQAAARQIEELLDKLSVDLTVEDLNVMQKLYNQAMKLEMEFFLSQPLNQPTVVPLLEWHNRNCKETKSMVLRFSLILI

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA05G402050`
TK1151 ID	TkA05G402050
OH-1004 ID	LXL04_021530
关系 / 置信度	序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)	98.800
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 93.889 / OH-1004 27.614 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA05G402050

位置 Chr05:100068976-100071317 (+)

描述 Similar to TH2: Bifunctional TH2 protein, mitochondrial

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At5g32470`	可能参与硫胺素分解产物的回收。	Arabidopsis TH2 Encodes the Orphan Enzyme Thiamin Monophosphate Phosphatase.2016 · DOI: 10.1105/tpc.16.00600

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_021530 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006772 thiamine metabolic process 生物过程

GO:0009228 thiamine biosynthetic process 生物过程

GO:0009229 thiamine diphosphate biosynthetic process 生物过程

GO:0005739 mitochondrion 细胞组分

GO:0005829 cytosol 细胞组分

GO:0009507 chloroplast 细胞组分

GO:0000287 magnesium ion binding 分子功能

GO:0004789 thiamine-phosphate diphosphorylase activity 分子功能

GO:0005524 ATP binding 分子功能

GO:0008902 hydroxymethylpyrimidine kinase activity 分子功能

GO:0008972 phosphomethylpyrimidine kinase activity 分子功能

GO:0042131 thiamine phosphate phosphatase activity 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT5G32470

cef:CE1591

cgb:cg1654

cgl:Cgl1463

hin:HI_0358

spo:2541373

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.411

排名 1 · TkA05G402050 · TK1151

质体0.190

排名 2 · TkA05G402050 · TK1151

细胞核0.166

排名 3 · TkA05G402050 · TK1151

过氧化物酶体0.149

排名 4 · TkA05G402050 · TK1151

线粒体0.131

排名 5 · TkA05G402050 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF22651OBP47_like27-83 aa

PF01390SEA37-60 aa

PF03070TENA_THI-455-144 aa

PF01390SEA89-117 aa

PF11338DUF3140100-134 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA05G402050	`PF22651`	OBP47_like	27	83	0.076	13.4
TkA05G402050	`PF01390`	SEA	37	60	0.02	15.7
TkA05G402050	`PF03070`	TENA_THI-4	55	144	1.4e-09	38.7
TkA05G402050	`PF01390`	SEA	89	117	0.02	15.7
TkA05G402050	`PF11338`	DUF3140	100	134	0.24	12.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`F4KFT7`	拟南芥	sp\|F4KFT7\|TENAC_ARATH Bifunctional TH2 protein, mitochondrial	59.100%	Swiss-Prot	高置信

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