基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
TkA05G005220
当前版本: TK1151
染色体: Chr05
坐标: 1542875-1546441
链方向: +
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA1143 bp · TkA05G005220|TK1151|cDNA
CAATACTGAAAGCAAAGCAAAGCGCTGCACTCGTTTCGTTTCGTAAATGGAAAATGAATTAGAAACCATGACTGTTGTTTTCTGTTAGAAACTACATCGGAATCGCAATCCTGAAACCCTCCAACATTCCTTGCTGGAAGAAGACTCCGTTTTTCTTTTCAGCGAGCTCTGTAATTCATTTCCTGGGTTGAAGCTTTATAGGCTCCATGGCGAGGATTAAACCCCAAGCTCTGCTACAGCAAAGCAAAAAGAAGAAAGCA...
CDS
下载 CDS FASTA705 bp · TkA05G005220|TK1151|CDS
ATGGCGAGGATTAAACCCCAAGCTCTGCTACAGCAAAGCAAAAAGAAGAAAGCACCCAGAAGTATCAGTATTCCCACAATTGCGTTGTACAGCGTAGTTACTGTTGTTATGGTGTTTTTCCTGTTTGCTACTTACAGACACTGGTCTCAAAGGTCAGTATTGCAGATAGAGGAGGGAACATCAAACTTTCAGGTGGAAGATGACTTTTCAGATTCAAAGAAGTCTGACGTTCCTAGATATGCTATTTTTAACACGTCAAA...
234 aa · TkA05G005220|TK1151|PROTEIN
MARIKPQALLQQSKKKKAPRSISIPTIALYSVVTVVMVFFLFATYRHWSQRSVLQIEEGTSNFQVEDDFSDSKKSDVPRYAIFNTSKGLITVELYKEGSPEVVDEFIDACQKGHFKGMLFQRVVKHFVIQGGDSENHAVIEDWTSREKHYNQLEKRLKHEAFMLGTSNVKQEKSGFDIFITTAPIPDLNAKLNVFGRVIKGEDIVQEIEEVDTDEHYRPKSRIGIIDVTLKHNI
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | TkA05G005220 |
|---|---|
| TK1151 ID | TkA05G005220 |
| OH-1004 ID | LXL04_018951 |
| 关系 / 置信度 | 跨参考版本对应关系 / Strict |
| 蛋白一致性 (%) | 100.000 |
| 蛋白覆盖度 (%) | TK1151 100.000 / OH-1004 100.000覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。 |
| 版本 | TK1151 / GWHBCHF00000000 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | TkA05G005220 | |||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr05:1542875-1546441 (+) | |||||||||||||||
| 描述 | Similar to CYP21-4: Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CYP21-4 | |||||||||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥
水稻当前来源表未检出该物种的同源命中。 | |||||||||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | |||||||||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0000398 mRNA splicing, via spliceosome 生物过程 GO:0006338 chromatin remodeling 生物过程 GO:0006457 protein folding 生物过程 GO:0009909 regulation of flower development 生物过程 GO:0009933 meristem structural organization 生物过程 GO:0010082 regulation of root meristem growth 生物过程 GO:0010305 leaf vascular tissue pattern formation 生物过程 GO:0010338 leaf formation 生物过程 GO:0010358 leaf shaping 生物过程 GO:0031507 heterochromatin formation 生物过程 GO:0045814 negative regulation of gene expression, epigenetic 生物过程 GO:0048440 carpel development 生物过程 | |||||||||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT2G36130 ath:AT2G47320 ath:AT3G44600 ath:AT3G66654 cnb:CNBC5760 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
高尔基体0.556
内质网0.296
细胞质0.093
细胞核0.067
细胞膜0.053
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF05751FixH16-49 aaPF26566PH_4026-80 aaPF15957Comm26-83 aaPF00160Pro_isomerase82-229 aaPF05751FixH133-219 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| TkA05G005220 | PF05751 | FixH | 16 | 49 | 0.05 | 14.3 |
| TkA05G005220 | PF26566 | PH_40 | 26 | 80 | 0.0053 | 17.5 |
| TkA05G005220 | PF15957 | Comm | 26 | 83 | 0.17 | 12.8 |
| TkA05G005220 | PF00160 | Pro_isomerase | 82 | 229 | 1.4e-32 | 113.9 |
| TkA05G005220 | PF05751 | FixH | 133 | 219 | 0.05 | 14.3 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
Q9C835 | 拟南芥 | sp|Q9C835|CP21D_ARATH Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CYP21-4 | 59.200% | Swiss-Prot | 高置信 |
Q94A16 | 拟南芥 | sp|Q94A16|CP21C_ARATH Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CYP21-3, mitochondrial | 52.600% | Swiss-Prot | 高置信 |
Q8W4D0 | 拟南芥 | sp|Q8W4D0|CPY71_ARATH Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CYP71 | 33.100% | Swiss-Prot | 中等置信 |
Q9SIH1 | 拟南芥 | sp|Q9SIH1|CP18B_ARATH Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CYP18-2 | 33.300% | Swiss-Prot | 中等置信 |