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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA04G314630
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 79299290-79301722 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2433 bp · TkA04G314630|TK1151|cDNA

ATGAGGAAGCTTCTGGAAATCTTGATTGGTGATGATGTCGGAAGGACTGCGGTGTGGGGTAAGGGTGGGATAGGGAAGACGACTTTAGTCAAGAATTTGGTCAATCATTTGTGTAAATCATCTCCAAGTTGTTTTAATCTTGTGATATGGGTCCAAGTCACTCGCAATCTGGATCTGAATGCCATTCAGATCCAAATTGCGAAGAGGATTCATGTAAAAGTGGAAGCAGAAGACACGACTCACATCTTAGGTAACAAAAT...

CDS

下载 CDS FASTA

2433 bp · TkA04G314630|TK1151|CDS

ATGAGGAAGCTTCTGGAAATCTTGATTGGTGATGATGTCGGAAGGACTGCGGTGTGGGGTAAGGGTGGGATAGGGAAGACGACTTTAGTCAAGAATTTGGTCAATCATTTGTGTAAATCATCTCCAAGTTGTTTTAATCTTGTGATATGGGTCCAAGTCACTCGCAATCTGGATCTGAATGCCATTCAGATCCAAATTGCGAAGAGGATTCATGTAAAAGTGGAAGCAGAAGACACGACTCACATCTTAGGTAACAAAAT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

810 aa · TkA04G314630|TK1151|PROTEIN

MRKLLEILIGDDVGRTAVWGKGGIGKTTLVKNLVNHLCKSSPSCFNLVIWVQVTRNLDLNAIQIQIAKRIHVKVEAEDTTHILGNKILRRLKTRLDANRCGKILLILDDVWEKIDLYAVGIPSVCKILLTTRSFDVCRDMSVDVPFELNLMSEEDAWNLFVQSAGTILSLDNGKQSPARKIVASCRGLPLAIKTLGKSLRDTPQTAIWRNTYLRWRCSSPLFKNIEKDIFRPLSLSYHSLPSKILQQCFLYCSLYPASFQ...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G314630
TK1151 IDTkA04G314630
OH-1004 IDLXL04_037510
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.500
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 84.200
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G314630
位置Chr04:79299290-79301722 (+)
描述Similar to At4g27190: Disease resistance protein At4g27190
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g27190 抗病蛋白。 暂无已核实直接文献
At4g27220 可能的疾病抗性蛋白。 暂无已核实直接文献
At4g26090 疾病抗性（R）蛋白，能特异性识别来自铜绿假单胞菌（Pseudomonas syringae）的AvrRpt2 III型效应子致病蛋白。 暂无已核实直接文献
At1g12220 抗病 蛋白，特异性识别来自丁香假单胞菌的 avrPphB III 型效应无毒蛋白。 暂无已核实直接文献
At1g61180 通过水杨酸（SA）信号通路参与病害抵抗。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_037510 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0002220 innate immune response activating cell surface receptor signaling pathway 生物过程
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0009626 plant-type hypersensitive response 生物过程
GO:0012501 programmed cell death 生物过程
GO:0016045 detection of bacterium 生物过程
GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程
GO:0098542 defense response to other organism 生物过程
GO:2000377 regulation of reactive oxygen species metabolic process 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G12220
ath:AT1G12280
ath:AT4G26090
ath:AT4G27190
ath:AT4G27220
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.426
排名 1 · TkA04G314630 · TK1151
细胞核0.313
排名 2 · TkA04G314630 · TK1151
细胞膜0.301
排名 3 · TkA04G314630 · TK1151
内质网0.084
排名 4 · TkA04G314630 · TK1151
溶酶体／液泡0.040
排名 5 · TkA04G314630 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00931NB-ARC2-164 aa
PF01637ATPase_215-114 aa
PF13401AAA_2216-110 aa
PF13479AAA_2416-37 aa
PF00142Fer4_NifH16-39 aa
PF13191AAA_1617-110 aa
PF05729NACHT17-72 aa
PF25201nSTAND617-77 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G314630PF00931NB-ARC21646.3e-30104.7
TkA04G314630PF01637ATPase_2151140.004117.7
TkA04G314630PF13401AAA_22161103.6e-0628.0
TkA04G314630PF13479AAA_2416370.1912.1
TkA04G314630PF00142Fer4_NifH16390.2211.7
TkA04G314630PF13191AAA_16171100.0005121.3
TkA04G314630PF05729NACHT17720.001419.2
TkA04G314630PF25201nSTAND617770.2212.2
TkA04G314630PF00910RNA_helicase18420.1413.4
TkA04G314630PF01637ATPase_21471940.004117.7
TkA04G314630PF23559WHD_DRP2543211.1e-0835.7
TkA04G314630PF25201nSTAND63103290.2212.2
TkA04G314630PF23952LRR_EndoS3503720.0004121.3
TkA04G314630PF12799LRR_43523846.2e-1349.2
TkA04G314630PF23598LRR_143685478e-1142.0
TkA04G314630PF13516LRR_63683810.3511.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9T048拟南芥sp|Q9T048|DRL27_ARATH Disease resistance protein At4g2719036.600%Swiss-Prot中等置信
O81825拟南芥sp|O81825|DRL28_ARATH Probable disease resistance protein At4g2722035.200%Swiss-Prot中等置信
Q42484拟南芥sp|Q42484|RPS2_ARATH Disease resistance protein RPS226.300%Swiss-Prot低置信
O64973拟南芥sp|O64973|RPS5_ARATH Disease resistance protein RPS529.100%Swiss-Prot低置信
Q940K0拟南芥sp|Q940K0|UNI_ARATH Disease resistance protein UNI28.600%Swiss-Prot低置信

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