TkA04G129690 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA04G129690

当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 33750517-33753478 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1857 bp · TkA04G129690|TK1151|cDNA

CTTGTAATTGCTTCAAAGATTTAATCCAGTAATATACCGGAGATTATACGTGCGACAGCGGCGGTGCTCGTGAGCGAAGACAGATAAAACTCAAAAACCTTTTTTTTTTTAATTGGAGGTGCCGGCGATGTCTTTGTGAAATCAATCCTTTAATCCTTTTCAAGAAACCAAATACACACATTTGATTTTCGCAAGATTGTTCCTTTTCGTCTTTTGTTTCCCCTTTGAATCTGTTCTCGATCCTTTTTATCTGATATTAG...

CDS

下载 CDS FASTA

1206 bp · TkA04G129690|TK1151|CDS

ATGGATGAGGTGAACATCAACACTACTTGTACCACCGTGACAGCAGATGATAGCTTAACATCCGCATCAGCATCAGTACCATGGAGTCCTAGACAGCTCGTCTTCCGACCTTATACGCCGACTTCTAACACTGATGCAAAGTCACAGAATCTGCGTGTTCACGTTAAAAGACCTTTGGTATCAAGATTAACGAAGGACATAGTCGACACATACCGTACATGCAACCCGCAGTTTTATTATCCAGAAGAATTATTAGTCCC...

蛋白

下载蛋白 FASTA

401 aa · TkA04G129690|TK1151|PROTEIN

MDEVNINTTCTTVTADDSLTSASASVPWSPRQLVFRPYTPTSNTDAKSQNLRVHVKRPLVSRLTKDIVDTYRTCNPQFYYPEELLVPKRFLTSPSAGVLNDGYDNENSDLVLSVNFALVNPDTHRRYIVKEMLGQGTFGQVAKCWVAELERFVAVKIIKNQPAYYQQALVEVTLLTTLNKKFDPEDKHHIVRIYDYFVYQRHLCIGFELLDSNLYEIIKLNHFRGLSLSIVQLFSKQILCGLSLMKDAAIIHCDLKPENI...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA04G129690`
TK1151 ID	TkA04G129690
OH-1004 ID	LXL04_035454
关系 / 置信度	序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)	99.500
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 99.252 / OH-1004 43.688 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA04G129690

位置 Chr04:33750517-33753478 (+)

描述 Similar to YAK1: Dual specificity protein kinase YAK1 homolog

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At5g35980`	双特异性蛋白激酶，可磷酸化 ANN1、ANN2 和 CP29B 的丝氨酸和苏氨酸残基以及 ANN1、ANN2 和 ANN4 的酪氨酸残基。	Arabidopsis Yak1 protein (AtYak1) is a dual specificity protein kinase.2015 · DOI: 10.1016/j.febslet.2015.09.025 Arabidopsis YAK1 regulates abscisic acid response and drought resistance.2016 · DOI: 10.1002/1873-3468.12234

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_035454 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006468 protein phosphorylation 生物过程

GO:0006935 chemotaxis 生物过程

GO:0006972 hyperosmotic response 生物过程

GO:0006979 response to oxidative stress 生物过程

GO:0007165 signal transduction 生物过程

GO:0007623 circadian rhythm 生物过程

GO:0008277 regulation of G protein-coupled receptor signaling pathway 生物过程

GO:0009789 positive regulation of abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程

GO:0010225 response to UV-C 生物过程

GO:0010468 regulation of gene expression 生物过程

GO:0010628 positive regulation of gene expression 生物过程

GO:0010629 negative regulation of gene expression 生物过程

KEGG 基因交叉引用

ath:AT5G35980

ddi:DDB_G0283605

dme:Dmel_CG42273

sce:YJL141C

spo:2542228

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.569

排名 1 · TkA04G129690 · TK1151

细胞核0.500

排名 2 · TkA04G129690 · TK1151

线粒体0.068

排名 3 · TkA04G129690 · TK1151

细胞膜0.050

排名 4 · TkA04G129690 · TK1151

内质网0.036

排名 5 · TkA04G129690 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00069Pkinase127-342 aa

PF07714PK_Tyr_Ser-Thr129-343 aa

PF03109ABC1131-161 aa

PF01163RIO1207-284 aa

PF03109ABC1234-285 aa

PF01636APH247-283 aa

PF19974TCAD9248-279 aa

PF10501Ribosomal_L50326-367 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA04G129690	`PF00069`	Pkinase	127	342	2.2e-43	149.3
TkA04G129690	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	129	343	8.1e-22	78.5
TkA04G129690	`PF03109`	ABC1	131	161	0.045	13.6
TkA04G129690	`PF01163`	RIO1	207	284	0.086	13.2
TkA04G129690	`PF03109`	ABC1	234	285	0.045	13.6
TkA04G129690	`PF01636`	APH	247	283	0.044	14.2
TkA04G129690	`PF19974`	TCAD9	248	279	0.21	11.4
TkA04G129690	`PF10501`	Ribosomal_L50	326	367	0.0029	18.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q8RWH3`	拟南芥	sp\|Q8RWH3\|YAK1_ARATH Dual specificity protein kinase YAK1 homolog	70.900%	Swiss-Prot	高置信

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