TkA01G602300 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA01G602300

当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 151748615-151751920 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

2838 bp · TkA01G602300|TK1151|cDNA

TGTAAATCTCGTCCGGTTCAAGCGAGTAATCTGGACTCACCTACTCACTCATAAACCCCTTCCTCTCTCTAGCTCTTATCTCCAATGGCGTCCTTCGCCGCCGGCTCGGGGCAATTCCTCAGCCTCATCCAACTCGCTCCCGCTCCCGCTCCCGCTCCGTTCAAAATTACCCCGTACTTCGTCATCTGCCTCTATACCACCAACACTATCAGATGCGAACAAATTTCGTCTCAAAACCCTAACAAACCCTCAAACACCCG...

CDS

下载 CDS FASTA

783 bp · TkA01G602300|TK1151|CDS

ATGGAGGAAATAACAACACGCGATGAAAGCAGTCACATTTCTTCAAACGGTCAACGGGTTTTGCCAAGTGGCGGGATCAGTGCGGATGGCCCACCAACAACACTGAGTGGAACGGGTATTGACCGGATGGTATTCGCACAAGCAAATATTACACGAGACAACACCAAGTTTGTAAACGGTGCAATTGTGGGAGAAAGGAATGTGTTTCAGGTGGATCAAGGGCTGGGGATCGGGAGTAAGTTTCCGTTTTTCAACCGACA...

蛋白

下载蛋白 FASTA

260 aa · TkA01G602300|TK1151|PROTEIN

MEEITTRDESSHISSNGQRVLPSGGISADGPPTTLSGTGIDRMVFAQANITRDNTKFVNGAIVGERNVFQVDQGLGIGSKFPFFNRHQLTLTKFIQLKEVEEGAGKSPPPVLVLHGHYGGCVGDLPSYDAFTLGGPYSVRGYNMGEIGAARNILEVAAEIRVPVRNTHVYAFAEHGNDLGSSKDVKGNPTEVYRRMGQGSSYGVGAKLGLVRAEYAVDHNSGLVLCFSGLERDFELDFCFTILVFVAILFFAISVDGYLT

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA01G602300`
TK1151 ID	TkA01G602300
OH-1004 ID	LXL04_000570
关系 / 置信度	序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)	100.000
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 85.385 / OH-1004 27.139 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA01G602300

位置 Chr01:151748615-151751920 (-)

描述 Similar to TOC75-3: Protein TOC75-3, chloroplastic

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At3g46740`	必需蛋白质。	A molecular-genetic study of the Arabidopsis Toc75 gene family.2005 · DOI: 10.1104/pp.105.063289
`At4g09080`	介导靶向叶绿体外膜的蛋白插入。	暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`Os03g0271200`	介导靶向叶绿体外膜的蛋白插入。	暂无已核实直接文献

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_000570 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006886 intracellular protein transport 生物过程

GO:0009658 chloroplast organization 生物过程

GO:0009662 etioplast organization 生物过程

GO:0009793 embryo development ending in seed dormancy 生物过程

GO:0045036 protein targeting to chloroplast 生物过程

GO:0045037 protein import into chloroplast stroma 生物过程

GO:0048598 embryonic morphogenesis 生物过程

GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分

GO:0005829 cytosol 细胞组分

GO:0009507 chloroplast 细胞组分

GO:0009536 plastid 细胞组分

GO:0009707 chloroplast outer membrane 细胞组分

KEGG 基因交叉引用

ath:AT3G46740

ath:AT4G09080

dosa:Os03g0271200

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

质体0.630

排名 1 · TkA01G602300 · TK1151

溶酶体／液泡0.127

排名 2 · TkA01G602300 · TK1151

细胞质0.092

排名 3 · TkA01G602300 · TK1151

内质网0.077

排名 4 · TkA01G602300 · TK1151

线粒体0.061

排名 5 · TkA01G602300 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF01103Omp8518-216 aa

PF03865ShlB124-151 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA01G602300	`PF01103`	Omp85	18	216	5.5e-14	53.1
TkA01G602300	`PF03865`	ShlB	124	151	0.018	15.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9STE8`	拟南芥	sp\|Q9STE8\|TC753_ARATH Protein TOC75-3, chloroplastic	89.200%	Swiss-Prot	高置信
`Q5IZC8`	拟南芥	sp\|Q5IZC8\|TC754_ARATH Protein TOC75-4, chloroplastic	76.000%	Swiss-Prot	高置信
`Q84Q83`	水稻	sp\|Q84Q83\|TOC75_ORYSJ Protein TOC75, chloroplastic	76.600%	Swiss-Prot	高置信

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