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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G544250
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 136523042-136527703 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1094 bp · TkA01G544250|TK1151|cDNA

GGGGGTGGGATTGTGTAGTGTTACGATGCTAGTAAGATAAGAAATGGGTCCGGGTCGGGGTCAACCGGTCAAGGGTCATTGTCAATAGAATTTGTAAATGGCCACTCTTCTACACCACTCATTTTGCACCTTGTCACATGAAAATACAAAAACATCAATGCATTAAAGGTCCTCTCATAACAACACAATTCTTCATCAATATCACATGGAATAATTCCAAAGGACCACCATCACAACCACCACCACAATCTCCATCGTCA...

CDS

下载 CDS FASTA

2523 bp · TkA01G544250|TK1151|CDS

ATGGAAACAAAGCAACCAAAGTTCACAACGGTGTACAACACCTTGCATGCTACCGTATCAGACAATCAAAAAATGAAAGATCGATATAAAGATTCAAGGAAAGAGGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAACAACATATCAATTTGAGGAGCTTGTCAAAGATTATGATCCCTCCGTTGGGTGCTTCATATATACAAAACCATATTCCCTCAAGATCCACCATCATCATATCACCCATGGACTCCAAATATAGGTATTGGCAGAC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

840 aa · TkA01G544250|TK1151|PROTEIN

METKQPKFTTVYNTLHATVSDNQKMKDRYKDSRKEEEEEEEEQHINLRSLSKIMIPPLGASYIQNHIPSRSTIIISPMDSKYRYWQTLMVVMVAYSAWTYPFEVAFLKSSAQTHKQLYIADSIVDLFFTADIILTFFVAYVDPITHLLVRDPKSIATRYLSTWFVMDLASTLPFELISYLFTGKHRMGLPYTVLGLLRFWRLRRVKQFFTRIEKDIRFNYFWVRCARLLCVTLFLVHCAGCIYYLLAVLYPHEGRTWIAT...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G544250
TK1151 IDTkA01G544250
OH-1004 IDLXL04_001355
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.500
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G544250
位置Chr01:136523042-136527703 (+)
描述Similar to AKT2: Potassium channel AKT2/3
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g22200 高选择性弱内向整流钾通道。
Loss of the AKT2/3 potassium channel affects sugar loading into the phloem of Arabidopsis.2002 · DOI: 10.1007/s00425-002-0895-1
Regulated expression of Arabidopsis shaker K+ channel genes involved in K+ uptake and distribution in the plant.2003 · DOI: 10.1023/a:1022597102282
At2g26650 可能作为高选择性内向整流钾通道，介导低 K⁺ 条件下植物根部的钾吸收。
Regulated expression of Arabidopsis shaker K+ channel genes involved in K+ uptake and distribution in the plant.2003 · DOI: 10.1023/a:1022597102282
A protein kinase, interacting with two calcineurin B-like proteins, regulates K+ transporter AKT1 in Arabidopsis.2006 · DOI: 10.1016/j.cell.2006.06.011
A Ca(2)+ signaling pathway regulates a K(+) channel for low-K response in Arabidopsis.2006 · DOI: 10.1073/pnas.0605129103
A protein phosphorylation/dephosphorylation network regulates a plant potassium channel.2007 · DOI: 10.1073/pnas.0707912104
High-affinity K(+) transport in Arabidopsis: AtHAK5 and AKT1 are vital for seedling establishment and postgermination growth under low-potassium conditions.2010 · DOI: 10.1104/pp.110.154369
A role for the AKT1 potassium channel in plant nutrition.1998 · DOI: 10.1126/science.280.5365.918
At4g32500 可能的钾通道。 暂无已核实直接文献
At2g25600 高度选择性的内向整流钾通道，可能介导花粉膜中的钾摄取。
Pollen tube development and competitive ability are impaired by disruption of a Shaker K(+) channel in Arabidopsis.2002 · DOI: 10.1101/gad.213902

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os05g0428700 推测的内向整流钾通道。 暂无已核实直接文献
UniProt: P0C550 高选择性内向整流钾通道，介导植物根部钾的吸收。 暂无已核实直接文献
Os02g0245800 推测的内向整流钾通道。 暂无已核实直接文献
Os01g0210700 推测的内向整流钾通道。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_001355 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006813 potassium ion transport 生物过程
GO:0009414 response to water deprivation 生物过程
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程
GO:0042391 regulation of membrane potential 生物过程
GO:0048767 root hair elongation 生物过程
GO:0090333 regulation of stomatal closure 生物过程
GO:1990573 potassium ion import across plasma membrane 生物过程
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005789 endoplasmic reticulum membrane 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009506 plasmodesma 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G26650
ath:AT4G22200
ath:AT4G32500
dosa:Os01g0648000
dosa:Os05g0428700
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.731
排名 1 · TkA01G544250 · TK1151
细胞质0.160
排名 2 · TkA01G544250 · TK1151
内质网0.107
排名 3 · TkA01G544250 · TK1151
溶酶体／液泡0.059
排名 4 · TkA01G544250 · TK1151
高尔基体0.057
排名 5 · TkA01G544250 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF01007IRK76-100 aa
PF00520Ion_trans82-333 aa
PF01007IRK239-322 aa
PF07885Ion_trans_2242-327 aa
PF00027cNMP_binding425-509 aa
PF12796Ank_2499-519 aa
PF00023Ank501-524 aa
PF24521Ank_KRIT1553-637 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G544250PF01007IRK761003.48.2
TkA01G544250PF00520Ion_trans823331.9e-45155.7
TkA01G544250PF01007IRK2393223.48.2
TkA01G544250PF07885Ion_trans_22423277e-1349.0
TkA01G544250PF00027cNMP_binding4255093.7e-1659.6
TkA01G544250PF12796Ank_24995191.6e-2590.2
TkA01G544250PF00023Ank5015242.6e-2072.1
TkA01G544250PF24521Ank_KRIT15536370.04514.2
TkA01G544250PF13606Ank_35555777.6e-1348.0
TkA01G544250PF12796Ank_25596381.6e-2590.2
TkA01G544250PF00023Ank5615812.6e-2072.1
TkA01G544250PF13637Ank_45676044.8e-1556.0
TkA01G544250PF13857Ank_55706211.1e-1764.6
TkA01G544250PF23745ANK_LRRK25746060.1113.1
TkA01G544250PF00023Ank5846142.6e-2072.1
TkA01G544250PF13606Ank_35846117.6e-1348.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q38898拟南芥sp|Q38898|AKT2_ARATH Potassium channel AKT2/364.700%Swiss-Prot高置信
Q38998拟南芥sp|Q38998|AKT1_ARATH Potassium channel AKT141.500%Swiss-Prot中等置信
Q9SCX5拟南芥sp|Q9SCX5|AKT5_ARATH Probable potassium channel AKT538.200%Swiss-Prot中等置信
Q8GXE6拟南芥sp|Q8GXE6|AKT6_ARATH Potassium channel AKT649.600%Swiss-Prot中等置信
Q75HP9水稻sp|Q75HP9|AKT2_ORYSJ Potassium channel AKT253.900%Swiss-Prot高置信
P0C550水稻sp|P0C550|AKT1_ORYSI Potassium channel AKT143.100%Swiss-Prot中等置信
Q6K3T2水稻sp|Q6K3T2|KAT1_ORYSJ Potassium channel KAT151.400%Swiss-Prot中等置信
Q5QNI1水稻sp|Q5QNI1|KAT2_ORYSJ Potassium channel KAT250.500%Swiss-Prot中等置信

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