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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G093750
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 23714479-23715492 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

628 bp · TkA01G093750|TK1151|cDNA

GTGAGGAGGGAGGTAGCGATCATGAAGCACTTGCCGGAGAATTCGAGTATCGTGACGTTACGAGAGGCTTGCGAGGATGAGAATGCTGTGCATTTGGTGATGGAGTTGTGTGAGGGCGGGGAACTTTTCGATCAGATCGTTGCTCGGGGGCATTACACGGAGCGTGCGGCTGCTACCGTTACCAGGACGATGGTAGAGGTTGTGCAGCTTTGCCATAAGCATGGAGTGATTCACAGAGACTTAAAACCAGAAAACTTTTT...

CDS

下载 CDS FASTA

477 bp · TkA01G093750|TK1151|CDS

ATGAAGCACTTGCCGGAGAATTCGAGTATCGTGACGTTACGAGAGGCTTGCGAGGATGAGAATGCTGTGCATTTGGTGATGGAGTTGTGTGAGGGCGGGGAACTTTTCGATCAGATCGTTGCTCGGGGGCATTACACGGAGCGTGCGGCTGCTACCGTTACCAGGACGATGGTAGAGGTTGTGCAGCTTTGCCATAAGCATGGAGTGATTCACAGAGACTTAAAACCAGAAAACTTTTTGTTTGCCAACAAGAAGGAGAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

158 aa · TkA01G093750|TK1151|PROTEIN

MKHLPENSSIVTLREACEDENAVHLVMELCEGGELFDQIVARGHYTERAAATVTRTMVEVVQLCHKHGVIHRDLKPENFLFANKKENSSLKAIDFGLSIFFKPGEKFSEIVGSPYYMAPEVLKRSYGPEIDIWSAGVILYILLCGVPPFWAESEQGVA

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G093750
TK1151 IDTkA01G093750
OH-1004 IDLXL04_036119
关系 / 置信度序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)98.100
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 29.868
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G093750
位置Chr01:23714479-23715492 (+)
描述Similar to CPK13: Calcium-dependent protein kinase 13
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g51850 可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用。 暂无已核实直接文献
At3g57530 可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用。
Arabidopsis calcium-dependent protein kinase AtCPK32 interacts with ABF4, a transcriptional regulator of abscisic acid-responsive gene expression, and modulates its activity.2005 · DOI: 10.1104/pp.105.069757

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os01g0832300 可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用。 暂无已核实直接文献
Os05g0467000 可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用。 暂无已核实直接文献
Os07g0568600 可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_036119 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0035556 intracellular signal transduction 生物过程
GO:0046777 protein autophosphorylation 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009536 plastid 细胞组分
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0004683 calcium/calmodulin-dependent protein kinase activity 分子功能
GO:0005509 calcium ion binding 分子功能
GO:0005516 calmodulin binding 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G51850
ath:AT5G12480
ath:AT5G19450
dosa:Os01g0832300
dosa:Os05g0467000
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.575
排名 1 · TkA01G093750 · TK1151
细胞核0.464
排名 2 · TkA01G093750 · TK1151
细胞膜0.093
排名 3 · TkA01G093750 · TK1151
线粒体0.084
排名 4 · TkA01G093750 · TK1151
内质网0.062
排名 5 · TkA01G093750 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF07714PK_Tyr_Ser-Thr1-151 aa
PF00069Pkinase7-155 aa
PF06293Kdo24-95 aa
PF03109ABC125-104 aa
PF01163RIO125-84 aa
PF14531Kinase-like41-151 aa
PF01636APH49-96 aa
PF19218CoV_NSP3_C54-99 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G093750PF07714PK_Tyr_Ser-Thr11515.7e-1659.3
TkA01G093750PF00069Pkinase71551.1e-48166.7
TkA01G093750PF06293Kdo24950.0007919.6
TkA01G093750PF03109ABC1251049.7e-0625.6
TkA01G093750PF01163RIO125840.05213.9
TkA01G093750PF14531Kinase-like411510.0006619.7
TkA01G093750PF01636APH49960.04814.1
TkA01G093750PF19218CoV_NSP3_C54990.211.4
TkA01G093750PF17667Pkinase_fungal621250.002217.5
TkA01G093750PF07914DUF1679631090.1711.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8W4I7拟南芥sp|Q8W4I7|CDPKD_ARATH Calcium-dependent protein kinase 1393.700%Swiss-Prot高置信
Q6NLQ6拟南芥sp|Q6NLQ6|CDPKW_ARATH Calcium-dependent protein kinase 3282.900%Swiss-Prot高置信
Q8LPZ7水稻sp|Q8LPZ7|CDPK3_ORYSJ Calcium-dependent protein kinase 391.800%Swiss-Prot高置信
Q6I5I8水稻sp|Q6I5I8|CDPKG_ORYSJ Calcium-dependent protein kinase 1691.100%Swiss-Prot高置信
Q84SL0水稻sp|Q84SL0|CDPKK_ORYSJ Calcium-dependent protein kinase 2084.200%Swiss-Prot高置信

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