LXL04_030590 | RubberDandelionOmics

基因概览

LXL04_030590

当前版本: OH-1004 染色体: Chr06 坐标: 119307993-119310038 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1539 bp · LXL04_030590|LXL04_030590|OH1004|cDNA

ATGTTTTGTATAACCTCCATTATCTATGCCAGTATCATTGTTCTCGTAGTCTATGTGTTCTATAAATTAGACACCCGTTATCCTAACGGCCTCCCTCCCGGCCCAACCCCATGGCCCATAGTCGGAAACCTACCTCACCTCGGTCCAATTCCACACCACTCACTGGCAACTTTAGCTACACAATATGGACCTTTGATGCACCTCCGGTTCGGCTTTGTTAATGTGGTGGTGGCGGCATCAGCGTCTGTAGCCAAACAATT...

CDS

下载 CDS FASTA

1539 bp · LXL04_030590|LXL04_030590|OH1004|CDS

ATGTTTTGTATAACCTCCATTATCTATGCCAGTATCATTGTTCTCGTAGTCTATGTGTTCTATAAATTAGACACCCGTTATCCTAACGGCCTCCCTCCCGGCCCAACCCCATGGCCCATAGTCGGAAACCTACCTCACCTCGGTCCAATTCCACACCACTCACTGGCAACTTTAGCTACACAATATGGACCTTTGATGCACCTCCGGTTCGGCTTTGTTAATGTGGTGGTGGCGGCATCAGCGTCTGTAGCCAAACAATT...

蛋白

下载蛋白 FASTA

512 aa · LXL04_030590|LXL04_030590|OH1004|PROTEIN

MFCITSIIYASIIVLVVYVFYKLDTRYPNGLPPGPTPWPIVGNLPHLGPIPHHSLATLATQYGPLMHLRFGFVNVVVAASASVAKQFLKDHDAKFSSRPPSSGGKHIAYNYQDLVFAPYGPRWRMLRKICSVHLFSNKALDDFVHVRQEEVAILTRTLFGAGQSPVKLGQLLSICTTNALARVTIGIRVVGNGSRGGDPKADVVNDMVVELIQLAGEFNIGDFIPVLDWLDLQGVAGKMKKLHKRFDSFLNSILEEHKSG...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`LXL04_030590`
版本	OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID LXL04_030590

位置 Chr06:119307993-119310038 (+)

描述 Similar to CYP75B1: Flavonoid 3'-monooxygenase

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At5g07990`	催化类黄酮 B 环的 3'-羟基化为 3',4'-羟基化状态。	暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`Os10g0320100`	催化黄酮B环的3'-羟基化至3',4'-羟基化状态。	暂无已核实直接文献

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_030590 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0009411 response to UV 生物过程

GO:0009733 response to auxin 生物过程

GO:0009813 flavonoid biosynthetic process 生物过程

GO:0080027 response to herbivore 生物过程

GO:0005576 extracellular region 细胞组分

GO:0005789 endoplasmic reticulum membrane 细胞组分

GO:0016020 membrane 细胞组分

GO:0005506 iron ion binding 分子功能

GO:0010333 terpene synthase activity 分子功能

GO:0016491 oxidoreductase activity 分子功能

GO:0016709 oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen, NAD(P)H as one donor, and incorporation of one atom of oxygen 分子功能

GO:0016711 flavonoid 3'-monooxygenase activity 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ag:AAD56282

ath:AT5G07990

dosa:Os10g0320100

osa:4348304

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

内质网0.920

排名 1 · LXL04_030590 · OH-1004

细胞膜0.038

排名 2 · LXL04_030590 · OH-1004

质体0.034

排名 3 · LXL04_030590 · OH-1004

细胞质0.032

排名 4 · LXL04_030590 · OH-1004

高尔基体0.026

排名 5 · LXL04_030590 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00067.28p45032-488 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
LXL04_030590	`PF00067.28`	p450	32	488	1.9e-102	344.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9SD85`	拟南芥	Flavonoid 3'-monooxygenase	66.471%	Swiss-Prot	强数据库同源证据
`Q7G602`	水稻	Flavonoid 3'-monooxygenase CYP75B3	61.350%	Swiss-Prot	强数据库同源证据

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