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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_005461
当前版本: OH-1004 染色体: Chr01 坐标: 164589493-164590993 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1104 bp · LXL04_005461|LXL04_005461|OH1004|cDNA

ATGGATCGTCAATGTCGCCGCCTTGATCGCCATCGTCGCCGGAGACAATCTTCTTCCCCGTCATCGGATAGAAAAACAACAGCCTTGCTGACGTCCTCTTCCTCCGTCCACCACCTCATGTTGTTTATCTTATGTGTCGTTAATACTAATCCTATAAATTCCGCCATCGCTTTTGATTTGAACACCATAACCTTCGATCAAGGCTACGCAACTCTCTTCAGCGACTTCAATATCGATCGATCCGATGACGACCAGAGCGT...

CDS

下载 CDS FASTA

1104 bp · LXL04_005461|LXL04_005461|OH1004|CDS

ATGGATCGTCAATGTCGCCGCCTTGATCGCCATCGTCGCCGGAGACAATCTTCTTCCCCGTCATCGGATAGAAAAACAACAGCCTTGCTGACGTCCTCTTCCTCCGTCCACCACCTCATGTTGTTTATCTTATGTGTCGTTAATACTAATCCTATAAATTCCGCCATCGCTTTTGATTTGAACACCATAACCTTCGATCAAGGCTACGCAACTCTCTTCAGCGACTTCAATATCGATCGATCCGATGACGACCAGAGCGT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

367 aa · LXL04_005461|LXL04_005461|OH1004|PROTEIN

MDRQCRRLDRHRRRRQSSSPSSDRKTTALLTSSSSVHHLMLFILCVVNTNPINSAIAFDLNTITFDQGYATLFSDFNIDRSDDDQSVRLILNRQSGSGIISTDYYNYGFFSAKIKLPTKYTAGIVVAFYTSNIDMFSKTHDELDLEFLGNVRGKPWRFQTNFYGNGSTIRGREERYRLWFDPSKEFHRYSILWARNKIIFYVDEIPIREVLRDDNMGGDYPSKPMSSYATVWDASSWATNGGRNKVDYRFEPFAAEFRDL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_005461
TK1151 IDTkA03G453050
OH-1004 IDLXL04_005461
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Probable
蛋白一致性 (%)99.400
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 89.373
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_005461
位置Chr01:164589493-164590993 (-)
描述Similar to XTH30: Probable xyloglucan endotransglucosylase/hydrolase protein 30
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g32170 催化木葡聚糖内水解 (XEH) 和/或内转糖基化 (XET)。 暂无已核实直接文献
At4g18990 催化木葡聚糖内水解 (XEH) 和/或内转糖基化 (XET)。 暂无已核实直接文献
At2g01850 催化木葡聚糖内水解 (XEH) 和/或内转糖基化 (XET)。
AtXTH27 plays an essential role in cell wall modification during the development of tracheary elements.2005 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2005.02395.x
At1g14720 催化木葡聚糖内水解 (XEH) 和/或内转糖基化 (XET)。 暂无已核实直接文献
At1g10550 催化木葡聚糖内水解 (XEH) 和/或内转糖基化 (XET)。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_005461 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009831 plant-type cell wall modification involved in multidimensional cell growth 生物过程
GO:0010087 phloem or xylem histogenesis 生物过程
GO:0010154 fruit development 生物过程
GO:0010411 xyloglucan metabolic process 生物过程
GO:0042546 cell wall biogenesis 生物过程
GO:0071555 cell wall organization 生物过程
GO:0080086 stamen filament development 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0048046 apoplast 细胞组分
GO:0004553 hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds 分子功能
GO:0016762 xyloglucan:xyloglucosyl transferase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G10550
ath:AT1G14720
ath:AT1G32170
ath:AT2G01850
ath:AT4G18990
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

高尔基体0.294
排名 1 · LXL04_005461 · OH-1004
细胞膜0.154
排名 2 · LXL04_005461 · OH-1004
细胞外0.143
排名 3 · LXL04_005461 · OH-1004
内质网0.094
排名 4 · LXL04_005461 · OH-1004
细胞质0.057
排名 5 · LXL04_005461 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00722.29Glyco_hydro_1667-249 aa
PF06955.20XET_C290-326 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_005461PF00722.29Glyco_hydro_16672492.2e-54184.3
LXL04_005461PF06955.20XET_C2903261.9e-1453.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q38908拟南芥Probable xyloglucan endotransglucosylase/hydrolase protein 3061.342%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q8L7H3拟南芥Probable xyloglucan endotransglucosylase/hydrolase protein 2959.797%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q8LDS2拟南芥Probable xyloglucan endotransglucosylase/hydrolase protein 2749.689%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q38909拟南芥Probable xyloglucan endotransglucosylase/hydrolase protein 2853.846%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q8LC45拟南芥Probable xyloglucan endotransglucosylase/hydrolase protein 3338.944%Swiss-Prot中等数据库同源证据

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