ID 对照

本站保留 TK1151 与 OH-1004 的原始基因 ID，列出 TK1151 与 OH-1004 两个 Taraxacum kok-saghyz 参考基因组之间的基因级对应关系。二者是同一物种不同材料，不是同一品种的版本升级。完整收录的对照不代表所有关系都能一对一转换；复杂映射需按类别和证据复核。

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版本	组装/注释 accession	来源数据库	论文	DOI / PMID	下载日期
TK1151 Taraxacum kok-saghyz	GWHBCHF00000000 GWHBCHF00000000 GFF/RNA/CDS/Protein	NGDC Genome Warehouse (GWH)	Extensive sequence divergence between the reference genomes of Taraxacum kok-saghyz and Taraxacum mongolicum Tao Lin, Xia Xu, Huilong Du, Xiuli Fan, Qingwen Chen, et al.; Science China Life Sciences; 2022	10.1007/s11427-021-2033-2 PMID: 34939160	2026-08-14
OH-1004 / OSU_TarKok_2.0 Taraxacum kok-saghyz	GCA_047496595.1 GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 GenBank GFF	NCBI Assembly / NGDC integrated NCBI Assembly	NCBI/NGDC 组装记录未关联发表论文（截至 2026-08-17）未发现	未发现	2026-08-14

完整基因 ID 对照表

参考基因集：TK1151；45224 个基因；当前筛选 12 条。当前显示第 1 / 1 页。

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示例 TkA01G624900 LXL04_000258

全部严格 1:1: 6347 较可信 1:1: 1703 一对多: 826 多对一: 24458 未映射: 2782 注释冲突: 9108

严格 1:1 需要同时满足双向最佳命中、高序列一致性、查询和对象覆盖度、CDS 支持和 JCVI 共线性；较可信 1:1 也必须是 RBH 且覆盖度达标。低覆盖、多源命中、注释拆分/合并和未定位序列不会进入 1:1 对照。蛋白与 CDS 覆盖度均按最高分单个比对片段的实际序列跨度除以对应代表序列长度计算；查询侧为 TK1151，对象侧为 OH-1004。本表不展示蛋白、CDS 或不同转录本。

TK1151 基因 ID	OH-1004 基因 ID	类别	关系 / 置信度	相似度 / 覆盖度	说明
TkA01G166930 Chr01:42666941-42671242 (-) GWHBCHF00000002	LXL04_017140 Chr03:141907843-141920247 (+) CM104801.1	注释冲突	双向最佳命中，但覆盖度或共线性未达高可信阈值需复核	57.600 查询 49.622 / 对象 43.478	TkA01G166930
TkA02G008640 Chr02:1881120-1882700 (+) GWHBCHF00000003	LXL04_017140 Chr03:141907843-141920247 (+) CM104801.1	多对一	non reciprocal best hit 复杂	33.800 查询 100.000 / 对象 27.826	TkA02G008640
TkA02G441110 Chr02:112122511-112125577 (-) GWHBCHF00000003	LXL04_017140 Chr03:141907843-141920247 (+) CM104801.1	多对一	non reciprocal best hit 复杂	42.800 查询 54.808 / 对象 20.474	TkA02G441110
TkA02G505320 Chr02:129645054-129645934 (-) GWHBCHF00000003	LXL04_017140 Chr03:141907843-141920247 (+) CM104801.1	多对一	non reciprocal best hit 复杂	87.800 查询 64.062 / 对象 9.328	TkA02G505320
TkA03G112820 Chr03:28890275-28891848 (+) GWHBCHF00000004	LXL04_017140 Chr03:141907843-141920247 (+) CM104801.1	一对多	multi candidate from TK1151 复杂	43.500 查询 74.545 / 对象 10.356	TkA03G112820
TkA03G362740 Chr03:89428283-89431633 (-) GWHBCHF00000004	LXL04_017140 Chr03:141907843-141920247 (+) CM104801.1	多对一	non reciprocal best hit 复杂	59.700 查询 48.625 / 对象 30.751	TkA03G362740
TkA04G248160 Chr04:62805518-62809542 (+) GWHBCHF00000005	LXL04_017140 Chr03:141907843-141920247 (+) CM104801.1	多对一	non reciprocal best hit 复杂	54.600 查询 76.660 / 对象 28.538	TkA04G248160
TkA05G050010 Chr05:13203898-13210592 (+) GWHBCHF00000006	LXL04_017140 Chr03:141907843-141920247 (+) CM104801.1	多对一	non reciprocal best hit 复杂	56.200 查询 51.330 / 对象 15.336	TkA05G050010
TkA07G012730 Chr07:3469905-3474358 (-) GWHBCHF00000008	LXL04_017140 Chr03:141907843-141920247 (+) CM104801.1	多对一	non reciprocal best hit 复杂	43.200 查询 98.540 / 对象 44.111	TkA07G012730
TkA07G156800 Chr07:40246049-40255347 (+) GWHBCHF00000008	LXL04_017140 Chr03:141907843-141920247 (+) CM104801.1	多对一	non reciprocal best hit 复杂	49.800 查询 99.472 / 对象 32.490	TkA07G156800
TkA07G414210 Chr07:104667983-104678300 (-) GWHBCHF00000008	LXL04_017140 Chr03:141907843-141920247 (+) CM104801.1	多对一	non reciprocal best hit 复杂	53.100 查询 46.655 / 对象 43.320	TkA07G414210
TkA08G115910 Chr08:30189526-30191064 (-) GWHBCHF00000009	LXL04_017140 Chr03:141907843-141920247 (+) CM104801.1	多对一	non reciprocal best hit 复杂	40.900 查询 93.122 / 对象 13.913	TkA08G115910

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