ID 对照
本站保留 TK1151 与 OH-1004 的原始基因 ID,列出 TK1151 与 OH-1004 两个 Taraxacum kok-saghyz 参考基因组之间的基因级对应关系。二者是同一物种不同材料,不是同一品种的版本升级。完整收录的对照不代表所有关系都能一对一转换;复杂映射需按类别和证据复核。
版本来源
| 版本 | 组装/注释 accession | 来源数据库 | 论文 | DOI / PMID | 下载日期 |
|---|---|---|---|---|---|
| TK1151 Taraxacum kok-saghyz |
GWHBCHF00000000 GWHBCHF00000000 GFF/RNA/CDS/Protein |
NGDC Genome Warehouse (GWH) |
Extensive sequence divergence between the reference genomes of Taraxacum kok-saghyz and Taraxacum mongolicum Tao Lin, Xia Xu, Huilong Du, Xiuli Fan, Qingwen Chen, et al.; Science China Life Sciences; 2022 |
10.1007/s11427-021-2033-2 PMID: 34939160 |
2026-08-14 |
| OH-1004 / OSU_TarKok_2.0 Taraxacum kok-saghyz |
GCA_047496595.1 GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 GenBank GFF |
NCBI Assembly / NGDC integrated NCBI Assembly |
NCBI/NGDC 组装记录未关联发表论文(截至 2026-08-17) 未发现 |
未发现 | 2026-08-14 |
完整基因 ID 对照表
参考基因集:TK1151;45224 个基因;当前筛选 9108 条。当前显示第 63 / 92 页。
严格 1:1 需要同时满足双向最佳命中、高序列一致性、查询和对象覆盖度、CDS 支持和 JCVI 共线性;较可信 1:1 也必须是 RBH 且覆盖度达标。低覆盖、多源命中、注释拆分/合并和未定位序列不会进入 1:1 对照。蛋白与 CDS 覆盖度均按最高分单个比对片段的实际序列跨度除以对应代表序列长度计算;查询侧为 TK1151,对象侧为 OH-1004。本表不展示蛋白、CDS 或不同转录本。
| TK1151 基因 ID | OH-1004 基因 ID | 类别 | 关系 / 置信度 | 相似度 / 覆盖度 | 共线性区块 | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|
|
TkA06G081210
Chr06:21801051-21803801 (-)
GWHBCHF00000007
|
LXL04_025088
Chr05:105771009-105773414 (+)
CM104803.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
99.100 查询 92.197 / 对象 60.887 |
JCVI_TKOH_00272 | TkA06G081210 |
|
TkA06G081570
Chr06:21883538-21884059 (-)
GWHBCHF00000007
|
LXL04_025083
Chr05:105677977-105678498 (+)
CM104803.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
97.800 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00272 | TkA06G081570 |
|
TkA06G081630
Chr06:21900183-21905792 (+)
GWHBCHF00000007
|
LXL04_025082
Chr05:105665373-105670422 (-)
CM104803.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
96.800 查询 98.734 / 对象 50.649 |
JCVI_TKOH_00272 | TkA06G081630 |
|
TkA06G081670
Chr06:21922991-21923842 (-)
GWHBCHF00000007
|
LXL04_025079
Chr05:105607699-105608302 (+)
CM104803.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
79.500 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00272 | TkA06G081670 |
|
TkA06G082120
Chr06:22041316-22042022 (-)
GWHBCHF00000007
|
LXL04_007488
Chr02:50385300-50391248 (-)
CM104800.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.300 查询 100.000 / 对象 45.370 |
TkA06G082120 | |
|
TkA06G082150
Chr06:22046109-22047951 (-)
GWHBCHF00000007
|
LXL04_021241
Chr04:125303884-125307387 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 47.689 |
TkA06G082150 | |
|
TkA06G084600
Chr06:22594325-22594765 (-)
GWHBCHF00000007
|
LXL04_025054
Chr05:104850242-104850697 (+)
CM104803.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
79.900 查询 100.000 / 对象 95.364 |
JCVI_TKOH_00272 | TkA06G084600 |
|
TkA06G084700
Chr06:22607716-22608190 (-)
GWHBCHF00000007
|
LXL04_025051
Chr05:104828214-104828637 (+)
CM104803.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
83.500 查询 99.254 / 对象 99.130 |
JCVI_TKOH_00272 | TkA06G084700 |
|
TkA06G084740
Chr06:22620385-22621424 (-)
GWHBCHF00000007
|
LXL04_025050
Chr05:104824765-104825808 (+)
CM104803.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
61.600 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00272 | TkA06G084740 |
|
TkA06G085940
Chr06:23007704-23010493 (-)
GWHBCHF00000007
|
LXL04_025041
Chr05:104480717-104484053 (+)
CM104803.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
98.100 查询 98.585 / 对象 55.585 |
JCVI_TKOH_00272 | TkA06G085940 |
|
TkA06G086130
Chr06:23045678-23047491 (-)
GWHBCHF00000007
|
LXL04_025036
Chr05:104463919-104466101 (+)
CM104803.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 86.070 / 对象 49.856 |
JCVI_TKOH_00272 | TkA06G086130 |
|
TkA06G087400
Chr06:23335380-23337316 (+)
GWHBCHF00000007
|
LXL04_025022
Chr05:104126567-104136853 (-)
CM104803.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
97.100 查询 98.551 / 对象 41.463 |
JCVI_TKOH_00272 | TkA06G087400 |
|
TkA06G087420
Chr06:23340935-23341504 (-)
GWHBCHF00000007
|
LXL04_025023
Chr05:104133255-104133757 (+)
CM104803.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
97.100 查询 67.327 / 对象 89.333 |
JCVI_TKOH_00272 | TkA06G087420 |
|
TkA06G087530
Chr06:23364932-23366410 (-)
GWHBCHF00000007
|
LXL04_025020
Chr05:104114390-104115151 (+)
CM104803.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
82.200 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00272 | TkA06G087530 |
|
TkA06G087840
Chr06:23432240-23432739 (+)
GWHBCHF00000007
|
LXL04_025012
Chr05:104040458-104040957 (-)
CM104803.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
96.500 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00272 | TkA06G087840 |
|
TkA06G088030
Chr06:23476840-23477271 (+)
GWHBCHF00000007
|
LXL04_011456
Chr02:164421294-164421605 (-)
CM104800.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
75.500 查询 71.329 / 对象 98.058 |
TkA06G088030 | |
|
TkA06G088090
Chr06:23490675-23492062 (-)
GWHBCHF00000007
|
LXL04_025009
Chr05:103997369-103997998 (+)
CM104803.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
98.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00272 | TkA06G088090 |
|
TkA06G088100
Chr06:23495241-23497439 (+)
GWHBCHF00000007
|
LXL04_025008
Chr05:103992073-103994565 (-)
CM104803.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
97.400 查询 100.000 / 对象 66.964 |
JCVI_TKOH_00272 | TkA06G088100 |
|
TkA06G089570
Chr06:23821725-23824503 (-)
GWHBCHF00000007
|
LXL04_024998
Chr05:103775111-103780372 (+)
CM104803.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.100 查询 99.083 / 对象 50.665 |
JCVI_TKOH_00272 | TkA06G089570 |
|
TkA06G089610
Chr06:23827867-23830226 (-)
GWHBCHF00000007
|
LXL04_024997
Chr05:103769216-103771742 (+)
CM104803.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 43.508 |
JCVI_TKOH_00272 | TkA06G089610 |
|
TkA06G089810
Chr06:23872031-23872959 (-)
GWHBCHF00000007
|
LXL04_007857
Chr02:67656929-67659241 (-)
CM104800.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
88.700 查询 100.000 / 对象 54.854 |
TkA06G089810 | |
|
TkA06G090160
Chr06:23989749-23990054 (-)
GWHBCHF00000007
|
LXL04_032977
Chr07:32606449-32608541 (-)
CM104805.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
97.100 查询 67.327 / 对象 45.946 |
TkA06G090160 | |
|
TkA06G090510
Chr06:24106067-24106994 (-)
GWHBCHF00000007
|
LXL04_024984
Chr05:103518643-103519570 (+)
CM104803.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.100 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00272 | TkA06G090510 |
|
TkA06G090930
Chr06:24209833-24211306 (-)
GWHBCHF00000007
|
LXL04_024981
Chr05:103435532-103437893 (+)
CM104803.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 91.045 / 对象 51.549 |
JCVI_TKOH_00272 | TkA06G090930 |
|
TkA06G092960
Chr06:24753165-24754457 (-)
GWHBCHF00000007
|
LXL04_024966
Chr05:103014086-103015447 (+)
CM104803.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
80.900 查询 100.000 / 对象 94.923 |
JCVI_TKOH_00272 | TkA06G092960 |
|
TkA06G093010
Chr06:24762096-24767761 (+)
GWHBCHF00000007
|
LXL04_034580
Chr07:107839972-107842322 (-)
CM104805.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
96.700 查询 99.554 / 对象 91.907 |
TkA06G093010 | |
|
TkA06G094270
Chr06:25050259-25054353 (+)
GWHBCHF00000007
|
LXL04_024954
Chr05:102714567-102717387 (-)
CM104803.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 33.049 / 对象 33.049 |
JCVI_TKOH_00272 | TkA06G094270 |
|
TkA06G094760
Chr06:25196178-25198555 (-)
GWHBCHF00000007
|
LXL04_024942
Chr05:102524728-102529659 (+)
CM104803.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
92.400 查询 98.851 / 对象 17.269 |
JCVI_TKOH_00272 | TkA06G094760 |
|
TkA06G094860
Chr06:25223967-25225408 (+)
GWHBCHF00000007
|
LXL04_024938
Chr05:102489988-102491296 (-)
CM104803.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
99.700 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00272 | TkA06G094860 |
|
TkA06G094880
Chr06:25226550-25230015 (-)
GWHBCHF00000007
|
LXL04_024937
Chr05:102485492-102488369 (+)
CM104803.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
80.600 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00272 | TkA06G094880 |
|
TkA06G095180
Chr06:25310623-25314631 (-)
GWHBCHF00000007
|
LXL04_024931
Chr05:102364106-102365851 (+)
CM104803.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.400 查询 45.897 / 对象 95.376 |
JCVI_TKOH_00272 | TkA06G095180 |
|
TkA06G095550
Chr06:25413808-25415834 (-)
GWHBCHF00000007
|
LXL04_024922
Chr05:102204213-102209979 (+)
CM104803.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
98.500 查询 100.000 / 对象 48.715 |
JCVI_TKOH_00272 | TkA06G095550 |
|
TkA06G095620
Chr06:25436109-25437591 (-)
GWHBCHF00000007
|
LXL04_024922
Chr05:102204213-102209979 (+)
CM104803.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
97.200 查询 99.246 / 对象 48.348 |
JCVI_TKOH_00272 | TkA06G095620 |
|
TkA06G095840
Chr06:25474281-25478285 (-)
GWHBCHF00000007
|
LXL04_024920
Chr05:102180015-102181434 (+)
CM104803.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.300 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00272 | TkA06G095840 |
|
TkA06G095920
Chr06:25522434-25524293 (+)
GWHBCHF00000007
|
LXL04_024914
Chr05:102100691-102102381 (-)
CM104803.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00272 | TkA06G095920 |
|
TkA06G096300
Chr06:25607389-25607751 (+)
GWHBCHF00000007
|
LXL04_024911
Chr05:102025897-102026259 (-)
CM104803.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.200 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00272 | TkA06G096300 |
|
TkA06G096310
Chr06:25609086-25611031 (+)
GWHBCHF00000007
|
LXL04_028475
Chr06:43008627-43010311 (-)
CM104804.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 97.351 / 对象 59.394 |
TkA06G096310 | |
|
TkA06G096350
Chr06:25632328-25636081 (+)
GWHBCHF00000007
|
LXL04_024909
Chr05:101997980-101999620 (-)
CM104803.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
90.100 查询 82.065 / 对象 55.159 |
JCVI_TKOH_00272 | TkA06G096350 |
|
TkA06G096400
Chr06:25650350-25652292 (+)
GWHBCHF00000007
|
LXL04_024907
Chr05:101969009-101970691 (+)
CM104803.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
99.200 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00272 | TkA06G096400 |
|
TkA06G096560
Chr06:25702245-25706090 (-)
GWHBCHF00000007
|
LXL04_024903
Chr05:101922711-101926040 (+)
CM104803.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 92.742 / 对象 21.375 |
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|
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81.100 查询 100.000 / 对象 97.059 |
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94.100 查询 47.222 / 对象 19.615 |
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注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
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