ID 对照
本站保留 TK1151 与 OH-1004 的原始基因 ID,列出 TK1151 与 OH-1004 两个 Taraxacum kok-saghyz 参考基因组之间的基因级对应关系。二者是同一物种不同材料,不是同一品种的版本升级。完整收录的对照不代表所有关系都能一对一转换;复杂映射需按类别和证据复核。
版本来源
| 版本 | 组装/注释 accession | 来源数据库 | 论文 | DOI / PMID | 下载日期 |
|---|---|---|---|---|---|
| TK1151 Taraxacum kok-saghyz |
GWHBCHF00000000 GWHBCHF00000000 GFF/RNA/CDS/Protein |
NGDC Genome Warehouse (GWH) |
Extensive sequence divergence between the reference genomes of Taraxacum kok-saghyz and Taraxacum mongolicum Tao Lin, Xia Xu, Huilong Du, Xiuli Fan, Qingwen Chen, et al.; Science China Life Sciences; 2022 |
10.1007/s11427-021-2033-2 PMID: 34939160 |
2026-08-14 |
| OH-1004 / OSU_TarKok_2.0 Taraxacum kok-saghyz |
GCA_047496595.1 GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 GenBank GFF |
NCBI Assembly / NGDC integrated NCBI Assembly |
NCBI/NGDC 组装记录未关联发表论文(截至 2026-08-17) 未发现 |
未发现 | 2026-08-14 |
完整基因 ID 对照表
参考基因集:TK1151;45224 个基因;当前筛选 9108 条。当前显示第 47 / 92 页。
严格 1:1 需要同时满足双向最佳命中、高序列一致性、查询和对象覆盖度、CDS 支持和 JCVI 共线性;较可信 1:1 也必须是 RBH 且覆盖度达标。低覆盖、多源命中、注释拆分/合并和未定位序列不会进入 1:1 对照。蛋白与 CDS 覆盖度均按最高分单个比对片段的实际序列跨度除以对应代表序列长度计算;查询侧为 TK1151,对象侧为 OH-1004。本表不展示蛋白、CDS 或不同转录本。
| TK1151 基因 ID | OH-1004 基因 ID | 类别 | 关系 / 置信度 | 相似度 / 覆盖度 | 共线性区块 | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|
|
TkA04G227120
Chr04:57778205-57779181 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_032326
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CM104805.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
81.100 查询 84.106 / 对象 97.692 |
TkA04G227120 | |
|
TkA04G229200
Chr04:58251218-58252438 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_006022
Chr02:511342-511682 (+)
CM104800.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
73.300 查询 17.964 / 对象 39.474 |
TkA04G229200 | |
|
TkA04G229750
Chr04:58368132-58369478 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_039359
ChrUn:4155271-4156617 (-)
JAJTUU010000010.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
89.600 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00211 | TkA04G229750 |
|
TkA04G231350
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GWHBCHF00000005
|
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|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 99.329 / 对象 34.579 |
TkA04G231350 | |
|
TkA04G231590
Chr04:58807814-58811722 (-)
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|
LXL04_039925
ChrUn:77966-88268 (+)
JAJTUU010000090.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
98.800 查询 99.523 / 对象 48.715 |
TkA04G231590 | |
|
TkA04G232220
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|
LXL04_039644
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JAJTUU010000020.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
98.800 查询 100.000 / 对象 100.000 |
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|
TkA04G232390
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|
LXL04_039640
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JAJTUU010000020.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
99.500 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00212 | TkA04G232390 |
|
TkA04G232510
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|
LXL04_039329
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JAJTUU010000010.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
69.100 查询 100.000 / 对象 99.393 |
JCVI_TKOH_00211 | TkA04G232510 |
|
TkA04G233270
Chr04:59216140-59218065 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_039324
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JAJTUU010000010.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
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|
TkA04G233780
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|
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JAJTUU010000010.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
93.300 查询 100.000 / 对象 91.703 |
JCVI_TKOH_00211 | TkA04G233780 |
|
TkA04G233890
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|
LXL04_039332
ChrUn:3242489-3246866 (-)
JAJTUU010000010.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00211 | TkA04G233890 |
|
TkA04G233910
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|
LXL04_039642
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JAJTUU010000020.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.700 查询 95.833 / 对象 37.485 |
JCVI_TKOH_00212 | TkA04G233910 |
|
TkA04G234390
Chr04:59507745-59510450 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_039328
ChrUn:3148258-3150208 (-)
JAJTUU010000010.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00211 | TkA04G234390 |
|
TkA04G235010
Chr04:59661685-59664279 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_039634
ChrUn:215003-218023 (+)
JAJTUU010000020.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.300 查询 92.453 / 对象 53.261 |
TkA04G235010 | |
|
TkA04G235670
Chr04:59886934-59889324 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_003074
Chr01:66592093-66593075 (-)
CM104799.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
84.000 查询 99.242 / 对象 82.390 |
TkA04G235670 | |
|
TkA04G237380
Chr04:60276277-60276716 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_039500
ChrUn:1002848-1006584 (-)
JAJTUU010000012.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
95.500 查询 100.000 / 对象 49.774 |
TkA04G237380 | |
|
TkA04G238120
Chr04:60459924-60468610 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_039315
ChrUn:2136469-2144967 (-)
JAJTUU010000010.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
97.200 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00211 | TkA04G238120 |
|
TkA04G239790
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GWHBCHF00000005
|
LXL04_035381
Chr08:21491645-21492181 (-)
CM104806.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
82.400 查询 51.802 / 对象 100.000 |
TkA04G239790 | |
|
TkA04G241570
Chr04:61234197-61237122 (-)
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|
LXL04_018557
Chr04:14646290-14649974 (+)
CM104802.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
86.800 查询 99.642 / 对象 96.050 |
TkA04G241570 | |
|
TkA04G244980
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|
LXL04_039490
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JAJTUU010000012.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.200 查询 90.972 / 对象 86.755 |
TkA04G244980 | |
|
TkA04G246590
Chr04:62362258-62363573 (-)
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|
LXL04_039495
ChrUn:782148-783874 (-)
JAJTUU010000012.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
67.700 查询 100.000 / 对象 97.619 |
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|
TkA04G246900
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|
LXL04_039496
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JAJTUU010000012.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 79.558 |
JCVI_TKOH_00213 | TkA04G246900 |
|
TkA04G247420
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|
LXL04_039504
ChrUn:1048432-1050310 (+)
JAJTUU010000012.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00213 | TkA04G247420 |
|
TkA04G247790
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|
LXL04_001672
Chr01:31045365-31046994 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 45.390 / 对象 74.419 |
TkA04G247790 | |
|
TkA04G248090
Chr04:62784556-62786662 (+)
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|
LXL04_039810
ChrUn:54501-61658 (-)
JAJTUU010000048.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
92.400 查询 99.676 / 对象 48.768 |
TkA04G248090 | |
|
TkA04G248190
Chr04:62819012-62834976 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_039510
ChrUn:1255307-1266968 (-)
JAJTUU010000012.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
95.700 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00214 | TkA04G248190 |
|
TkA04G249210
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GWHBCHF00000005
|
LXL04_028986
Chr06:77001557-77008279 (-)
CM104804.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
67.500 查询 96.733 / 对象 100.000 |
TkA04G249210 | |
|
TkA04G249500
Chr04:63123317-63123895 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_034028
Chr07:75830746-75835191 (-)
CM104805.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 76.042 / 对象 38.830 |
TkA04G249500 | |
|
TkA04G250860
Chr04:63462033-63462798 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_039521
ChrUn:1880238-1881003 (-)
JAJTUU010000012.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.300 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00214 | TkA04G250860 |
|
TkA04G252860
Chr04:63949965-63962405 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_037153
Chr09:454957-473725 (+)
CM104807.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.900 查询 98.419 / 对象 54.337 |
JCVI_TKOH_00197 | TkA04G252860 |
|
TkA04G252870
Chr04:63962900-63963420 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_002598
Chr01:52636810-52638493 (-)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
96.600 查询 88.000 / 对象 42.105 |
TkA04G252870 | |
|
TkA04G252910
Chr04:63975404-63976732 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_037156
Chr09:480997-488839 (-)
CM104807.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 25.978 |
JCVI_TKOH_00197 | TkA04G252910 |
|
TkA04G253080
Chr04:64015471-64017545 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_037160
Chr09:529472-534997 (+)
CM104807.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
93.300 查询 99.774 / 对象 72.214 |
JCVI_TKOH_00197 | TkA04G253080 |
|
TkA04G253310
Chr04:64088167-64090618 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_027545
Chr06:18611471-18615141 (-)
CM104804.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
87.300 查询 99.838 / 对象 56.503 |
TkA04G253310 | |
|
TkA04G254680
Chr04:64390950-64391980 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_030777
Chr06:122428365-122436396 (+)
CM104804.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
95.700 查询 60.526 / 对象 20.846 |
TkA04G254680 | |
|
TkA04G255280
Chr04:64546608-64548097 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_039894
ChrUn:4238-7744 (+)
JAJTUU010000071.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 91.518 / 对象 47.564 |
TkA04G255280 | |
|
TkA04G255520
Chr04:64620354-64623040 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_011422
Chr02:164030655-164031225 (-)
CM104800.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
TkA04G255520 | |
|
TkA04G255650
Chr04:64657526-64657956 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_038517
Chr09:43040001-43042330 (+)
CM104807.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.100 查询 99.115 / 对象 24.779 |
TkA04G255650 | |
|
TkA04G255730
Chr04:64681759-64682160 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_028481
Chr06:43270782-43273380 (+)
CM104804.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
62.200 查询 60.150 / 对象 41.546 |
TkA04G255730 | |
|
TkA04G255780
Chr04:64694671-64695345 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_037182
Chr09:1131825-1137098 (+)
CM104807.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.400 查询 100.000 / 对象 52.492 |
JCVI_TKOH_00197 | TkA04G255780 |
|
TkA04G256090
Chr04:64779545-64780672 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_029597
Chr06:95116968-95120874 (-)
CM104804.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
96.600 查询 48.954 / 对象 35.030 |
TkA04G256090 | |
|
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CM104800.1
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注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
98.800 查询 100.000 / 对象 41.505 |
TkA04G256670 | |
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CM104807.1
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注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
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注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
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注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
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注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
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注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
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85.100 查询 100.000 / 对象 100.000 |
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注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
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81.400 查询 98.214 / 对象 37.524 |
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注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
84.500 查询 100.000 / 对象 100.000 |
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注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
81.800 查询 100.000 / 对象 100.000 |
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91.700 查询 98.856 / 对象 81.787 |
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|
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注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
63.000 查询 91.878 / 对象 49.315 |
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77.100 查询 56.150 / 对象 44.589 |
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100.000 查询 100.000 / 对象 61.682 |
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96.300 查询 93.064 / 对象 69.869 |
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