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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA04G233890
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 59399407-59404966 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3881 bp · TkA04G233890|TK1151|cDNA

ATCAAAGAAAACACATAAATTTTATATTTTATAATCATATCACGTATGATAATCACTAAATTTAAAAAGTGTTATTCACAACCGAATAGTAAGAAAGAAGCCATTTTTTTCGTAAGAGATGAGTGAGGACTTCCATCGTTTGACTTAGATGAAGAACAAAAACCTCAAAAATCCCAAATTTAGCCTGCCCCCCAAAAAAGGCGATTCCAAGTTAATCCAAGATAGAGTGCAAATACGTATATTATCATTTATCAGTGTAG...

CDS

下载 CDS FASTA

2910 bp · TkA04G233890|TK1151|CDS

ATGGAACCCTCAAAAAGCGACAACAATCTTCAATACCATCCAATTCAATCTGAAAACAATGATCCTCTACCTGCTAGACCAACTTCCCTAAAACCCGTGTTAAATTACTCCATAAGAACAGGCGAAGAGTTTGCTCTAGAATTCATGCGGGACCGCGTGAACCCCAGAACACCATTCACCCAATTTCCCGCCAGTGACCCTACTCACACCACAAACTACCTCGAACTCAAGGGCATTTTAGGAATTTCCCATAATGGATC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

969 aa · TkA04G233890|TK1151|PROTEIN

MEPSKSDNNLQYHPIQSENNDPLPARPTSLKPVLNYSIRTGEEFALEFMRDRVNPRTPFTQFPASDPTHTTNYLELKGILGISHNGSESGSDISMINNTLERPVKDLEHNNNNTTRGGIMSIHDYASSSSVSDNSSKIKILCSFGGKILPRPSDGKLRYVGGSTRIIRIKRDIFWHELRQKVMEIYIETYAIKYQLPGEDLDALVSVSSDEDLQNMMEECSVIGIGEGSQKLRLFLFSLSDLDDSNSVHSNSGGDSEFQF...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G233890
TK1151 IDTkA04G233890
OH-1004 IDLXL04_039332
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G233890
位置Chr04:59399407-59404966 (+)
描述Similar to EDR1: Serine/threonine-protein kinase EDR1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g79570 类 RAF 蛋白激酶，与 RAF24 一起作为生长素快速反应通路的中央介质，该通路涉及蛋白质磷酸化，并导致快速的细胞反应，包括膜去极化和细胞质流动。 暂无已核实直接文献
At2g35050 类 RAF 蛋白激酶，与 RAF20 一起作用，作为生长素快速反应途径的核心介质，涉及蛋白质磷酸化，并导致包括膜去极化和胞质流动在内的快速细胞反应。 暂无已核实直接文献
At1g08720 参与调控MAP激酶级联的MAPKKK丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶；该级联可能包括MPK3和MPK6，负向调控水杨酸（SA）依赖的防御应答、脱落酸（ABA）信号及乙烯诱导的衰老。
Negative regulation of defense responses in plants by a conserved MAPKK kinase.2001 · DOI: 10.1073/pnas.98.1.373
Overexpression of a kinase-deficient form of the EDR1 gene enhances powdery mildew resistance and ethylene-induced senescence in Arabidopsis.2002 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.2002.01482.x
Regulation of plant disease resistance, stress responses, cell death, and ethylene signaling in Arabidopsis by the EDR1 protein kinase.2005 · DOI: 10.1104/pp.105.060400
Costs and benefits of priming for defense in Arabidopsis.2006 · DOI: 10.1073/pnas.0510213103
Powdery mildew resistance conferred by loss of the ENHANCED DISEASE RESISTANCE1 protein kinase is suppressed by a missense mutation in KEEP ON GOING, a regulator of abscisic acid signaling.2008 · DOI: 10.1104/pp.108.127605
Mitogen-activated protein kinases 3 and 6 are required for full priming of stress responses in Arabidopsis thaliana.2009 · DOI: 10.1105/tpc.108.062158
The KEEP ON GOING protein of Arabidopsis recruits the ENHANCED DISEASE RESISTANCE1 protein to trans-Golgi network/early endosome vesicles.2011 · DOI: 10.1104/pp.110.171785
Arabidopsis ENHANCED DISEASE RESISTANCE 1 is required for pathogen-induced expression of plant defensins in nonhost resistance, and acts through interference of MYC2-mediated repressor function.2011 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2011.04651.x
Negative regulation of defence signalling pathways by the EDR1 protein kinase.2011 · DOI: 10.1111/j.1364-3703.2011.00708.x
An Arabidopsis mutant with enhanced resistance to powdery mildew.1998 · DOI: 10.1105/tpc.10.6.947
At1g73660 作为耐盐负调节剂。
The genetic locus At1g73660 encodes a putative MAPKKK and negatively regulates salt tolerance in Arabidopsis.2008 · DOI: 10.1007/s11103-008-9306-8
SIS8, a putative mitogen-activated protein kinase kinase kinase, regulates sugar-resistant seedling development in Arabidopsis.2014 · DOI: 10.1111/tpj.12404

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_039332 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0005985 sucrose metabolic process 生物过程
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0009637 response to blue light 生物过程
GO:0009646 response to absence of light 生物过程
GO:0009733 response to auxin 生物过程
GO:0009734 auxin-activated signaling pathway 生物过程
GO:0010109 regulation of photosynthesis 生物过程
GO:0010114 response to red light 生物过程
GO:0010928 regulation of auxin mediated signaling pathway 生物过程
GO:0071365 cellular response to auxin stimulus 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G79570
ath:AT2G35050
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.460
排名 1 · TkA04G233890 · TK1151
细胞质0.432
排名 2 · TkA04G233890 · TK1151
细胞核0.308
排名 3 · TkA04G233890 · TK1151
高尔基体0.037
排名 4 · TkA04G233890 · TK1151
内质网0.035
排名 5 · TkA04G233890 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF26130PB1-like136-219 aa
PF00564PB1154-238 aa
PF21823MUCL1446-501 aa
PF00069Pkinase690-950 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr691-952 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G233890PF26130PB1-like1362190.0005420.9
TkA04G233890PF00564PB11542385.3e-1865.5
TkA04G233890PF21823MUCL14465010.9710.3
TkA04G233890PF00069Pkinase6909507.3e-49167.2
TkA04G233890PF07714PK_Tyr_Ser-Thr6919522e-62211.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9SAJ2拟南芥sp|Q9SAJ2|RAF20_ARATH RAF-like serine/threonine-protein kinase 2044.500%Swiss-Prot中等置信
O64768拟南芥sp|O64768|RAF24_ARATH RAF-like serine/threonine-protein kinase 2442.200%Swiss-Prot中等置信
Q9FPR3拟南芥sp|Q9FPR3|EDR1_ARATH Serine/threonine-protein kinase EDR142.100%Swiss-Prot低置信
Q9C9U5拟南芥sp|Q9C9U5|SIS8_ARATH Probable serine/threonine-protein kinase SIS840.700%Swiss-Prot低置信

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