ID 对照
本站保留 TK1151 与 OH-1004 的原始基因 ID,列出 TK1151 与 OH-1004 两个 Taraxacum kok-saghyz 参考基因组之间的基因级对应关系。二者是同一物种不同材料,不是同一品种的版本升级。完整收录的对照不代表所有关系都能一对一转换;复杂映射需按类别和证据复核。
版本来源
| 版本 | 组装/注释 accession | 来源数据库 | 论文 | DOI / PMID | 下载日期 |
|---|---|---|---|---|---|
| TK1151 Taraxacum kok-saghyz |
GWHBCHF00000000 GWHBCHF00000000 GFF/RNA/CDS/Protein |
NGDC Genome Warehouse (GWH) |
Extensive sequence divergence between the reference genomes of Taraxacum kok-saghyz and Taraxacum mongolicum Tao Lin, Xia Xu, Huilong Du, Xiuli Fan, Qingwen Chen, et al.; Science China Life Sciences; 2022 |
10.1007/s11427-021-2033-2 PMID: 34939160 |
2026-08-14 |
| OH-1004 / OSU_TarKok_2.0 Taraxacum kok-saghyz |
GCA_047496595.1 GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 GenBank GFF |
NCBI Assembly / NGDC integrated NCBI Assembly |
NCBI/NGDC 组装记录未关联发表论文(截至 2026-08-17) 未发现 |
未发现 | 2026-08-14 |
完整基因 ID 对照表
参考基因集:TK1151;45224 个基因;当前筛选 9108 条。当前显示第 40 / 92 页。
严格 1:1 需要同时满足双向最佳命中、高序列一致性、查询和对象覆盖度、CDS 支持和 JCVI 共线性;较可信 1:1 也必须是 RBH 且覆盖度达标。低覆盖、多源命中、注释拆分/合并和未定位序列不会进入 1:1 对照。蛋白与 CDS 覆盖度均按最高分单个比对片段的实际序列跨度除以对应代表序列长度计算;查询侧为 TK1151,对象侧为 OH-1004。本表不展示蛋白、CDS 或不同转录本。
| TK1151 基因 ID | OH-1004 基因 ID | 类别 | 关系 / 置信度 | 相似度 / 覆盖度 | 共线性区块 | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|
|
TkA03G570120
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GWHBCHF00000004
|
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CM104800.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.200 查询 93.005 / 对象 29.768 |
JCVI_TKOH_00147 | TkA03G570120 |
|
TkA03G570230
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GWHBCHF00000004
|
LXL04_011173
Chr02:159350221-159350652 (+)
CM104800.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 95.804 |
JCVI_TKOH_00147 | TkA03G570230 |
|
TkA03G570420
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GWHBCHF00000004
|
LXL04_011176
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CM104800.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 17.105 |
JCVI_TKOH_00147 | TkA03G570420 |
|
TkA03G570770
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GWHBCHF00000004
|
LXL04_011179
Chr02:159479577-159485665 (+)
CM104800.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
98.100 查询 91.329 / 对象 18.588 |
JCVI_TKOH_00147 | TkA03G570770 |
|
TkA03G571000
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GWHBCHF00000004
|
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CM104804.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 58.796 / 对象 100.000 |
TkA03G571000 | |
|
TkA03G571560
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GWHBCHF00000004
|
LXL04_011191
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CM104800.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
95.800 查询 94.040 / 对象 50.714 |
JCVI_TKOH_00147 | TkA03G571560 |
|
TkA03G571630
Chr03:144988490-144989708 (-)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_002314
Chr01:45937661-45938075 (-)
CM104799.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
48.800 查询 35.329 / 对象 61.940 |
TkA03G571630 | |
|
TkA03G571800
Chr03:145022056-145022466 (-)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_011195
Chr02:159780117-159780647 (-)
CM104800.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
96.900 查询 71.324 / 对象 55.114 |
JCVI_TKOH_00147 | TkA03G571800 |
|
TkA03G572000
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GWHBCHF00000004
|
LXL04_037768
Chr09:20636189-20638638 (-)
CM104807.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
62.300 查询 92.683 / 对象 79.503 |
TkA03G572000 | |
|
TkA03G572260
Chr03:145115534-145115860 (-)
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|
LXL04_011201
Chr02:159863260-159874486 (-)
CM104800.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
75.600 查询 41.667 / 对象 13.761 |
JCVI_TKOH_00147 | TkA03G572260 |
|
TkA03G572270
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GWHBCHF00000004
|
LXL04_011202
Chr02:159875818-159878129 (+)
CM104800.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 92.941 / 对象 42.473 |
JCVI_TKOH_00147 | TkA03G572270 |
|
TkA03G572780
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GWHBCHF00000004
|
LXL04_011209
Chr02:160017105-160019024 (-)
CM104800.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
96.600 查询 100.000 / 对象 46.795 |
JCVI_TKOH_00147 | TkA03G572780 |
|
TkA03G573460
Chr03:145395332-145397310 (+)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_011212
Chr02:160150635-160152340 (+)
CM104800.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 98.246 / 对象 62.050 |
JCVI_TKOH_00147 | TkA03G573460 |
|
TkA03G574590
Chr03:145650842-145655901 (-)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_011219
Chr02:160385690-160391531 (-)
CM104800.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 80.128 / 对象 25.510 |
JCVI_TKOH_00147 | TkA03G574590 |
|
TkA03G574920
Chr03:145760984-145763761 (+)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_011222
Chr02:160441706-160444456 (+)
CM104800.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
98.900 查询 88.158 / 对象 42.607 |
JCVI_TKOH_00147 | TkA03G574920 |
|
TkA03G575290
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GWHBCHF00000004
|
LXL04_011236
Chr02:160582220-160584447 (-)
CM104800.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
99.500 查询 33.901 / 对象 33.901 |
JCVI_TKOH_00147 | TkA03G575290 |
|
TkA03G575410
Chr03:145932422-145933422 (-)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_011237
Chr02:160601966-160602783 (-)
CM104800.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.100 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00147 | TkA03G575410 |
|
TkA03G575620
Chr03:145990961-145991556 (+)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_011239
Chr02:160674618-160675614 (+)
CM104800.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 91.279 / 对象 51.307 |
JCVI_TKOH_00147 | TkA03G575620 |
|
TkA03G576510
Chr03:146211589-146212007 (+)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_023737
Chr05:66051007-66057746 (+)
CM104803.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
75.400 查询 85.593 / 对象 26.350 |
TkA03G576510 | |
|
TkA03G577130
Chr03:146381704-146383512 (+)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_011252
Chr02:161147331-161148665 (+)
CM104800.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 74.803 / 对象 74.803 |
JCVI_TKOH_00147 | TkA03G577130 |
|
TkA03G577140
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GWHBCHF00000004
|
LXL04_011253
Chr02:161149031-161151121 (-)
CM104800.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
75.300 查询 100.000 / 对象 85.498 |
JCVI_TKOH_00147 | TkA03G577140 |
|
TkA03G577950
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GWHBCHF00000004
|
LXL04_011266
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CM104800.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.400 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00147 | TkA03G577950 |
|
TkA03G578550
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|
LXL04_007158
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CM104800.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
97.200 查询 100.000 / 对象 31.843 |
TkA03G578550 | |
|
TkA03G578730
Chr03:146815996-146816975 (+)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_007158
Chr02:37739088-37743547 (+)
CM104800.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
97.200 查询 100.000 / 对象 31.843 |
TkA03G578730 | |
|
TkA03G579400
Chr03:147009650-147011311 (-)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_011274
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CM104800.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
79.100 查询 98.571 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00147 | TkA03G579400 |
|
TkA03G580040
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|
LXL04_011278
Chr02:161860561-161861677 (-)
CM104800.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
98.800 查询 100.000 / 对象 54.072 |
JCVI_TKOH_00147 | TkA03G580040 |
|
TkA03G580180
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GWHBCHF00000004
|
LXL04_011282
Chr02:161891082-161891753 (-)
CM104800.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
84.300 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00147 | TkA03G580180 |
|
TkA03G581030
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GWHBCHF00000004
|
LXL04_011291
Chr02:162128766-162131363 (-)
CM104800.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
95.600 查询 99.432 / 对象 60.774 |
JCVI_TKOH_00147 | TkA03G581030 |
|
TkA03G581600
Chr03:147638244-147638555 (-)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_011307
Chr02:162299851-162300660 (-)
CM104800.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
98.500 查询 64.078 / 对象 97.059 |
JCVI_TKOH_00147 | TkA03G581600 |
|
TkA03G581860
Chr03:147702887-147705739 (+)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_011312
Chr02:162390144-162392793 (+)
CM104800.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 98.721 / 对象 65.983 |
JCVI_TKOH_00147 | TkA03G581860 |
|
TkA03G581890
Chr03:147715660-147718713 (-)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_011315
Chr02:162399642-162402317 (-)
CM104800.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00147 | TkA03G581890 |
|
TkA03G582030
Chr03:147763131-147766665 (+)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_011323
Chr02:162505713-162507097 (+)
CM104800.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
96.900 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00147 | TkA03G582030 |
|
TkA03G582050
Chr03:147772207-147773758 (+)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_011324
Chr02:162511760-162513311 (+)
CM104800.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
88.200 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00147 | TkA03G582050 |
|
TkA03G582070
Chr03:147776122-147778366 (+)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_011325
Chr02:162516142-162518068 (+)
CM104800.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
99.500 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00147 | TkA03G582070 |
|
TkA03G582280
Chr03:147836154-147837662 (+)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_011329
Chr02:162577974-162578719 (+)
CM104800.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00147 | TkA03G582280 |
|
TkA03G582300
Chr03:147842110-147842442 (+)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_011331
Chr02:162589648-162589995 (+)
CM104800.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
89.800 查询 89.091 / 对象 85.217 |
JCVI_TKOH_00147 | TkA03G582300 |
|
TkA03G582350
Chr03:147856721-147857458 (-)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_002638
Chr01:53539601-53540317 (-)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
97.200 查询 100.000 / 对象 100.000 |
TkA03G582350 | |
|
TkA03G583620
Chr03:148207154-148208799 (-)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_018313
Chr04:11330020-11334064 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
96.100 查询 59.375 / 对象 35.185 |
TkA03G583620 | |
|
TkA03G583830
Chr03:148265486-148266341 (+)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_011355
Chr02:163029139-163036341 (+)
CM104800.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 63.223 |
JCVI_TKOH_00147 | TkA03G583830 |
|
TkA03G584220
Chr03:148352528-148352959 (-)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_011358
Chr02:163140671-163143205 (-)
CM104800.1
|
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CM104800.1
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注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
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注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
52.200 查询 72.727 / 对象 79.310 |
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84.100 查询 100.000 / 对象 100.000 |
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79.900 查询 100.000 / 对象 100.000 |
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100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
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99.300 查询 100.000 / 对象 100.000 |
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100.000 查询 99.054 / 对象 28.314 |
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100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
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77.500 查询 82.184 / 对象 99.409 |
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98.700 查询 76.000 / 对象 55.882 |
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88.000 查询 89.109 / 对象 88.789 |
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45.200 查询 50.407 / 对象 48.819 |
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注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.800 查询 98.965 / 对象 59.305 |
JCVI_TKOH_00147 | TkA03G607480 |