基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_033709
当前版本: OH-1004
染色体: Chr07
坐标: 53942524-53963159
链方向: -
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA9939 bp · LXL04_033709|LXL04_033709|OH1004|cDNA
ATGGCGTACCCTCGAAGGGCATCTGAGCAGCAGCCACCTGGCAAGCTGCTGAGAACTCAAACAGCTGGCAATTTGGGAGGGGAGGCGATGATGGATAGTGAAGTAGTGCCTTCATCTCTTGTTACAATTGCACCTATTCTTCGTGTTGCTAATGAAGTTGAACCTACCAATCCAAGGGTTGCCTATCTCTGTCGATTCTATGCCTTTGAGCAAGCTCACAAACTAGATCCAACATCAAGTGGTCGTGGTGTTCGTCAATT...
CDS
下载 CDS FASTA9939 bp · LXL04_033709|LXL04_033709|OH1004|CDS
ATGGCGTACCCTCGAAGGGCATCTGAGCAGCAGCCACCTGGCAAGCTGCTGAGAACTCAAACAGCTGGCAATTTGGGAGGGGAGGCGATGATGGATAGTGAAGTAGTGCCTTCATCTCTTGTTACAATTGCACCTATTCTTCGTGTTGCTAATGAAGTTGAACCTACCAATCCAAGGGTTGCCTATCTCTGTCGATTCTATGCCTTTGAGCAAGCTCACAAACTAGATCCAACATCAAGTGGTCGTGGTGTTCGTCAATT...
3312 aa · LXL04_033709|LXL04_033709|OH1004|PROTEIN
MAYPRRASEQQPPGKLLRTQTAGNLGGEAMMDSEVVPSSLVTIAPILRVANEVEPTNPRVAYLCRFYAFEQAHKLDPTSSGRGVRQFKTALLQRLEREDATTLIGRKNSDAREMQSYYRHFYGKYIQALQNADKADRTRLTKAYQTAAVLFEVLKAVNLGESVDVAEEILEAHKKVADKTEMYAPYNILPLDPDSSNQAIMRLPEIQASVTALRNTRGLPWPKGYKKKPDEDILDWLQTMFGFQKDSVSNQREHLILLLA...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_033709 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_033709 | ||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr07:53942524-53963159 (-) | ||||||||||||||||||
| 描述 | Similar to CALS3: Callose synthase 3 | ||||||||||||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥
水稻当前来源表未检出该物种的同源命中。 | ||||||||||||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | ||||||||||||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0006075 (1->3)-beta-D-glucan biosynthetic process 生物过程 GO:0008360 regulation of cell shape 生物过程 GO:0071555 cell wall organization 生物过程 GO:0000148 1,3-beta-D-glucan synthase complex 细胞组分 GO:0005739 mitochondrion 细胞组分 GO:0005886 plasma membrane 细胞组分 GO:0009504 cell plate 细胞组分 GO:0009506 plasmodesma 细胞组分 GO:0003843 1,3-beta-D-glucan synthase activity 分子功能 GO:0046527 glucosyltransferase activity 分子功能 | ||||||||||||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT1G05570 ath:AT2G31960 ath:AT5G13000 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞膜0.622
内质网0.199
高尔基体0.117
细胞质0.112
溶酶体／液泡0.089
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF04652.22Vta143-169 aaPF14288.12FKS1_dom1318-430 aaPF25968.1CALS1848-1035 aaPF02364.22Glucan_synthase1043-1130 aaPF02364.22Glucan_synthase1135-1752 aaPF25968.1CALS12218-2405 aaPF02364.22Glucan_synthase2413-2500 aaPF02364.22Glucan_synthase2505-3122 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_033709 | PF04652.22 | Vta1 | 43 | 169 | 2.5e-16 | 60.7 |
| LXL04_033709 | PF14288.12 | FKS1_dom1 | 318 | 430 | 2e-42 | 144.7 |
| LXL04_033709 | PF25968.1 | CALS1 | 848 | 1035 | 6.2e-126 | 417.6 |
| LXL04_033709 | PF02364.22 | Glucan_synthase | 1043 | 1130 | 1557.6 | |
| LXL04_033709 | PF02364.22 | Glucan_synthase | 1135 | 1752 | 1557.6 | |
| LXL04_033709 | PF25968.1 | CALS1 | 2218 | 2405 | 6.2e-126 | 417.6 |
| LXL04_033709 | PF02364.22 | Glucan_synthase | 2413 | 2500 | 1557.6 | |
| LXL04_033709 | PF02364.22 | Glucan_synthase | 2505 | 3122 | 1557.6 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。