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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_025852
当前版本: OH-1004 染色体: Chr05 坐标: 117638539-117641616 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3078 bp · LXL04_025852|LXL04_025852|OH1004|cDNA

ATGGTTGCTGTATCGAAGATATGGGTGCTTGTGATTGTACTTCTGGTTTCTCTTCAAAATCAGATTCTAGTGAGTTCACAGAATCCGACATGCAATTCCGATGACCTGAGAGGATTGCAGGGTTTCATGGACGGAGTGGAATCGTCTGTTGTCCGGTGGTGGCCAACGAATTCGTCATCTTCAGCCTCTCTTAATTGCTGCAACTGGGTAGGGATCACATGCAATAACACTTCTGGTAGGGTTGTTGGATTAGAACTTCC...

CDS

下载 CDS FASTA

3078 bp · LXL04_025852|LXL04_025852|OH1004|CDS

ATGGTTGCTGTATCGAAGATATGGGTGCTTGTGATTGTACTTCTGGTTTCTCTTCAAAATCAGATTCTAGTGAGTTCACAGAATCCGACATGCAATTCCGATGACCTGAGAGGATTGCAGGGTTTCATGGACGGAGTGGAATCGTCTGTTGTCCGGTGGTGGCCAACGAATTCGTCATCTTCAGCCTCTCTTAATTGCTGCAACTGGGTAGGGATCACATGCAATAACACTTCTGGTAGGGTTGTTGGATTAGAACTTCC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

1025 aa · LXL04_025852|LXL04_025852|OH1004|PROTEIN

MVAVSKIWVLVIVLLVSLQNQILVSSQNPTCNSDDLRGLQGFMDGVESSVVRWWPTNSSSSASLNCCNWVGITCNNTSGRVVGLELPKKRLTGSLSDSISNLGQLRTLNLSRNFLNGPLPISLFHLPHLEVIDLSRNKFNGVLPVNINLPALKQLHISDNTFSGVLPSGLCVNSTGVRVLRFAMNYFNGTIPSEFGNCTLLEHLCVAANFLSGNIPGFLFRLPRLQELTLQDNQFTVIEGIGNSSSRLVRLDISSNGLSG...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_025852
版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_025852
位置Chr05:117638539-117641616 (+)
描述Similar to PSKR: Phytosulfokine receptor 1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g02220 植物磺肽受体，具有丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶活性和鸟苷酸环化酶活性。
Disruption and overexpression of Arabidopsis phytosulfokine receptor gene affects cellular longevity and potential for growth.2006 · DOI: 10.1104/pp.106.081109
The phytosulfokine (PSK) receptor is capable of guanylate cyclase activity and enabling cyclic GMP-dependent signaling in plants.2011 · DOI: 10.1074/jbc.m110.168823
The tyrosine-sulfated peptide receptors PSKR1 and PSY1R modify the immunity of Arabidopsis to biotrophic and necrotrophic pathogens in an antagonistic manner.2013 · DOI: 10.1111/tpj.12050
At5g53890 具有丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶活性的植物硫肽受体。 暂无已核实直接文献
At1g72300 酪氨酸硫酸化糖肽受体，具有丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶活性。
Tyrosine-sulfated glycopeptide involved in cellular proliferation and expansion in Arabidopsis.2007 · DOI: 10.1073/pnas.0706403104
The tyrosine-sulfated peptide receptors PSKR1 and PSY1R modify the immunity of Arabidopsis to biotrophic and necrotrophic pathogens in an antagonistic manner.2013 · DOI: 10.1111/tpj.12050
Receptor kinase-mediated control of primary active proton pumping at the plasma membrane.2014 · DOI: 10.1111/tpj.12680
At1g55610 具有丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶活性的受体。
BRL1, a leucine-rich repeat receptor-like protein kinase, is functionally redundant with BRI1 in regulating Arabidopsis brassinosteroid signaling.2004 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2004.02214.x
BRL1 and BRL3 are novel brassinosteroid receptors that function in vascular differentiation in Arabidopsis.2004 · DOI: 10.1242/dev.01403

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_025852 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0009414 response to water deprivation 生物过程
GO:0009416 response to light stimulus 生物过程
GO:0009617 response to bacterium 生物过程
GO:0009729 detection of brassinosteroid stimulus 生物过程
GO:0009742 brassinosteroid mediated signaling pathway 生物过程
GO:0009755 hormone-mediated signaling pathway 生物过程
GO:0009791 post-embryonic development 生物过程
GO:0009826 unidimensional cell growth 生物过程
GO:0031347 regulation of defense response 生物过程
GO:0045087 innate immune response 生物过程
GO:0045851 pH reduction 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G55610
ath:AT1G72300
ath:AT2G02220
ath:AT5G53890
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.887
排名 1 · LXL04_025852 · OH-1004
内质网0.081
排名 2 · LXL04_025852 · OH-1004
细胞质0.058
排名 3 · LXL04_025852 · OH-1004
细胞核0.038
排名 4 · LXL04_025852 · OH-1004
溶酶体／液泡0.025
排名 5 · LXL04_025852 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF13855.13LRR_886-139 aa
PF23598.2LRR_1490-276 aa
PF13855.13LRR_8104-160 aa
PF12799.14LRR_4223-264 aa
PF13855.13LRR_8319-378 aa
PF24758.2LRR_At5g56370332-402 aa
PF12799.14LRR_4343-382 aa
PF12799.14LRR_4366-408 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_025852PF13855.13LRR_8861393.1e-40136.4
LXL04_025852PF23598.2LRR_14902761.6e-2280.4
LXL04_025852PF13855.13LRR_81041603.1e-40136.4
LXL04_025852PF12799.14LRR_42232643.9e-33113.4
LXL04_025852PF13855.13LRR_83193783.1e-40136.4
LXL04_025852PF24758.2LRR_At5g563703324027.8e-0936.2
LXL04_025852PF12799.14LRR_43433823.9e-33113.4
LXL04_025852PF12799.14LRR_43664083.9e-33113.4
LXL04_025852PF13855.13LRR_84194773.1e-40136.4
LXL04_025852PF13855.13LRR_85325873.1e-40136.4
LXL04_025852PF12799.14LRR_45325683.9e-33113.4
LXL04_025852PF23598.2LRR_145416061.6e-2280.4
LXL04_025852PF00069.32Pkinase73810056.2e-44151.1
LXL04_025852PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr7409622.3e-38132.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9ZVR7拟南芥Phytosulfokine receptor 160.594%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q9FN37拟南芥Phytosulfokine receptor 246.520%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q9C7S5拟南芥Tyrosine-sulfated glycopeptide receptor 142.924%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q9ZWC8拟南芥Serine/threonine-protein kinase BRI1-like 135.165%Swiss-Prot中等数据库同源证据

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