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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_000681
当前版本: OH-1004 染色体: Chr01 坐标: 12510590-12512452 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1863 bp · LXL04_000681|LXL04_000681|OH1004|cDNA

ATGGCTGAAACCGGCGAAGAGAAGCTCATCGCAGTGGCCCGTCATATAGCTAAGACCCTAGGTAACACCGATAATGCCATGGCCGATGATATACTCCAAATTTTCTCCAACTTCGATGGTAGATTGAGGGAAAAGCTACATGAAAATCTTTCCGGCAACGACGGCGGTGTTGCACTTGATCAGACTCTCAGAGCGATTGACCGACGGATCTCTAGATACCTCACTGTTGACCAACCGATATGGACTGACTCTGCCGATGC...

CDS

下载 CDS FASTA

1863 bp · LXL04_000681|LXL04_000681|OH1004|CDS

ATGGCTGAAACCGGCGAAGAGAAGCTCATCGCAGTGGCCCGTCATATAGCTAAGACCCTAGGTAACACCGATAATGCCATGGCCGATGATATACTCCAAATTTTCTCCAACTTCGATGGTAGATTGAGGGAAAAGCTACATGAAAATCTTTCCGGCAACGACGGCGGTGTTGCACTTGATCAGACTCTCAGAGCGATTGACCGACGGATCTCTAGATACCTCACTGTTGACCAACCGATATGGACTGACTCTGCCGATGC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

620 aa · LXL04_000681|LXL04_000681|OH1004|PROTEIN

MAETGEEKLIAVARHIAKTLGNTDNAMADDILQIFSNFDGRLREKLHENLSGNDGGVALDQTLRAIDRRISRYLTVDQPIWTDSADASSFLDDVDELVAVIREWSAMDDNTAVTAVLDRAEDLLQQCMFRLEEEFKLLIGRGSAESSDNAAGGGVGGYLDSDDEEDDEFDEVEIPVAHQVSDYNITIDALPSGTINDLHEIAKRMIAAGYGKECSLAYSTCRRDFLEESLSRLGFLGLQNSSKPLEDADDDVEIEKWIKA...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_000681
TK1151 IDTkA01G594250
OH-1004 IDLXL04_000681
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_000681
位置Chr01:12510590-12512452 (+)
描述Similar to EXO70B1: Exocyst complex component EXO70B1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g58430 胞吐复合体（exocyst）亚复合物的组分，特异性参与自噬相关且不依赖高尔基体的向液泡膜运输。
Arabidopsis exocyst subcomplex containing subunit EXO70B1 is involved in autophagy-related transport to the vacuole.2013 · DOI: 10.1111/tra.12101
The N-Terminal UND Motif of the Arabidopsis U-Box E3 Ligase PUB18 Is Critical for the Negative Regulation of ABA-Mediated Stomatal Movement and Determines Its Ubiquitination Specificity for Exocyst Subunit Exo70B1.2016 · DOI: 10.1105/tpc.16.00347
At1g07000 胞吐复合体（exocyst）亚复合物的组分，特异性参与自噬相关且不依赖高尔基体的向液泡膜运输。
The role for the exocyst complex subunits Exo70B2 and Exo70H1 in the plant-pathogen interaction.2011 · DOI: 10.1093/jxb/erq402
The ubiquitin ligase PUB22 targets a subunit of the exocyst complex required for PAMP-triggered responses in Arabidopsis.2012 · DOI: 10.1105/tpc.112.104463
The N-Terminal UND Motif of the Arabidopsis U-Box E3 Ligase PUB18 Is Critical for the Negative Regulation of ABA-Mediated Stomatal Movement and Determines Its Ubiquitination Specificity for Exocyst Subunit Exo70B1.2016 · DOI: 10.1105/tpc.16.00347
At5g13150 全球植物生长和雄性传播所需。
Expression and functional analyses of EXO70 genes in Arabidopsis implicate their roles in regulating cell type-specific exocytosis.2010 · DOI: 10.1104/pp.110.164178
EXO70C2 Is a Key Regulatory Factor for Optimal Tip Growth of Pollen.2017 · DOI: 10.1104/pp.16.01282
At5g13990 花粉管尖端最佳生长所需。
EXO70C2 Is a Key Regulatory Factor for Optimal Tip Growth of Pollen.2017 · DOI: 10.1104/pp.16.01282
Regulation of Exocyst Function in Pollen Tube Growth by Phosphorylation of Exocyst Subunit EXO70C2.2020 · DOI: 10.3389/fpls.2020.609600
At5g03540 胞吐复合体（exocyst）的组分，参与调控性或极性分泌过程中，胞吐囊泡与质膜融合位点的对接。
AtEXO70A1, a member of a family of putative exocyst subunits specifically expanded in land plants, is important for polar growth and plant development.2006 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2006.02854.x
Arabidopsis exocyst subunits SEC8 and EXO70A1 and exocyst interactor ROH1 are involved in the localized deposition of seed coat pectin.2010 · DOI: 10.1111/j.1469-8137.2010.03372.x
The Arabidopsis exocyst complex is involved in cytokinesis and cell plate maturation.2010 · DOI: 10.1105/tpc.110.074351
The exocyst complex contributes to PIN auxin efflux carrier recycling and polar auxin transport in Arabidopsis.2013 · DOI: 10.1111/tpj.12074
EXO70A1-mediated vesicle trafficking is critical for tracheary element development in Arabidopsis.2013 · DOI: 10.1105/tpc.113.112144
Microtubule-dependent targeting of the exocyst complex is necessary for xylem development in Arabidopsis.2017 · DOI: 10.1111/nph.14267

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_000681 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0000919 cell plate assembly 生物过程
GO:0002237 response to molecule of bacterial origin 生物过程
GO:0002238 response to molecule of fungal origin 生物过程
GO:0006887 exocytosis 生物过程
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0006955 immune response 生物过程
GO:0009414 response to water deprivation 生物过程
GO:0009617 response to bacterium 生物过程
GO:0009620 response to fungus 生物过程
GO:0009789 positive regulation of abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0009832 plant-type cell wall biogenesis 生物过程
GO:0010089 xylem development 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G07000
ath:AT5G03540
ath:AT5G13150
ath:AT5G13990
ath:AT5G58430
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.520
排名 1 · LXL04_000681 · OH-1004
细胞膜0.384
排名 2 · LXL04_000681 · OH-1004
细胞核0.291
排名 3 · LXL04_000681 · OH-1004
高尔基体0.041
排名 4 · LXL04_000681 · OH-1004
溶酶体／液泡0.038
排名 5 · LXL04_000681 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF20669.4Exo70_N63-138 aa
PF03081.23Exo70_C256-607 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_000681PF20669.4Exo70_N631381.3e-0835.7
LXL04_000681PF03081.23Exo70_C2566077.9e-116387.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9FGH9拟南芥Exocyst complex component EXO70B162.282%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q9LMJ4拟南芥Exocyst complex component EXO70B248.341%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q9FY95拟南芥Exocyst complex component EXO70C134.507%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q9FFX6拟南芥Exocyst complex component EXO70C232.399%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q9LZD3拟南芥Exocyst complex component EXO70A132.217%Swiss-Prot中等数据库同源证据

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