TkAUNG097700 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkAUNG097700

当前版本: TK1151 染色体: ChrUn 坐标: 27585851-27588731 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

2051 bp · TkAUNG097700|TK1151|cDNA

ATTTACTTCAACGTCCAAAAACGCCAAAAATAACAGCTTCAAAAATCTCTCCATCACAAAATCGCTGCAACGTCAATGGCTTGCAGCTCGATCGCCATGGATAGAAGAGCACTTCCGATATCTCTGCACTCTATCCCTAAGCGCCAGCGTCCGCCGGACACTTTGGTTTCCAGAAACTCCGGCTCGAATACGAACTCAAAACTTCACTTCAGAGTTAGGGTTCAGTTCCTGTCTGGTTCGTATGTTCATGTTCATCTGAA...

CDS

下载 CDS FASTA

1611 bp · TkAUNG097700|TK1151|CDS

ATGGCTTGCAGCTCGATCGCCATGGATAGAAGAGCACTTCCGATATCTCTGCACTCTATCCCTAAGCGCCAGCGTCCGCCGGACACTTTGGTTTCCAGAAACTCCGGCTCGAATACGAACTCAAAACTTCACTTCAGAGTTAGGGTTCAGTTCCTGTCTGGTTCGTATGTTCATGTTCATCTGAATAGTTCATGTGGGAGGAATCAGTTATGGAAGGTCAGGTCGGATGTCAAATCGGACCCGTACGAACTTTCCCAGTC...

蛋白

下载蛋白 FASTA

536 aa · TkAUNG097700|TK1151|PROTEIN

MACSSIAMDRRALPISLHSIPKRQRPPDTLVSRNSGSNTNSKLHFRVRVQFLSGSYVHVHLNSSCGRNQLWKVRSDVKSDPYELSQSAPESFKFKEKLGVGAMTKDDDGDEFVDNALPWWEEFPKRWTIVILCFSAFLLCNMDRVNMSIAILPMSSEFHWNSTTVGLVQSSFFWGYLLTQIAGGIWADTVGGKRVLAFGVIWWSVATILTPIAAKLGLPFLLIVRAFMGIGEGVAMPAMNNLLSKWVPVAERSRSLALVY...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkAUNG097700`
TK1151 ID	TkAUNG097700
OH-1004 ID	LXL04_000615
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	99.800
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkAUNG097700

位置 ChrUn:27585851-27588731 (-)

描述 Similar to ANTR1: Sodium-dependent phosphate transport protein 1, chloroplastic

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At2g29650`	特异性用于通过类囊体膜的无机磷酸盐转运，依赖钠离子。	Arabidopsis ANTR1 is a thylakoid Na+-dependent phosphate transporter: functional characterization in Escherichia coli.2008 · DOI: 10.1074/jbc.m709371200
`At4g00370`	无机磷酸盐和可能的阴离子转运蛋白。	AtPHT4;4 is a chloroplast-localized ascorbate transporter in Arabidopsis.2015 · DOI: 10.1038/ncomms6928
`At2g38060`	无机磷酸盐和可能的阴离子转运蛋白。	暂无已核实直接文献
`At5g20380`	无机磷酸盐和可能的阴离子转运蛋白。	暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`Os01g0279700`	可能的阴离子转运蛋白。	暂无已核实直接文献
`Os09g0570400`	可能的阴离子转运蛋白。	暂无已核实直接文献

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_000615 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006811 monoatomic ion transport 生物过程

GO:0006814 sodium ion transport 生物过程

GO:0009416 response to light stimulus 生物过程

GO:0009624 response to nematode 生物过程

GO:0010028 xanthophyll cycle 生物过程

GO:0015882 L-ascorbic acid transmembrane transport 生物过程

GO:0005739 mitochondrion 细胞组分

GO:0009507 chloroplast 细胞组分

GO:0009535 chloroplast thylakoid membrane 细胞组分

GO:0009536 plastid 细胞组分

GO:0009579 thylakoid 细胞组分

GO:0009706 chloroplast inner membrane 细胞组分

KEGG 基因交叉引用

ath:AT2G29650

ath:AT2G38060

ath:AT4G00370

dosa:Os01g0279700

dosa:Os09g0570400

osa:4326905

osa:4347913

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

质体0.944

排名 1 · TkAUNG097700 · TK1151

线粒体0.039

排名 2 · TkAUNG097700 · TK1151

高尔基体0.032

排名 3 · TkAUNG097700 · TK1151

过氧化物酶体0.029

排名 4 · TkAUNG097700 · TK1151

细胞质0.026

排名 5 · TkAUNG097700 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF07690MFS_1133-495 aa

PF05977MFS_3134-304 aa

PF06779MFS_4152-293 aa

PF00083Sugar_tr161-289 aa

PF12420DUF3671354-379 aa

PF05977MFS_3425-475 aa

PF00083Sugar_tr478-523 aa

PF07690MFS_1480-526 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkAUNG097700	`PF07690`	MFS_1	133	495	2.9e-61	208.0
TkAUNG097700	`PF05977`	MFS_3	134	304	0.00047	19.5
TkAUNG097700	`PF06779`	MFS_4	152	293	0.29	11.1
TkAUNG097700	`PF00083`	Sugar_tr	161	289	5.8e-05	22.9
TkAUNG097700	`PF12420`	DUF3671	354	379	0.64	10.2
TkAUNG097700	`PF05977`	MFS_3	425	475	0.00047	19.5
TkAUNG097700	`PF00083`	Sugar_tr	478	523	5.8e-05	22.9
TkAUNG097700	`PF07690`	MFS_1	480	526	2.9e-61	208.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`O82390`	拟南芥	sp\|O82390\|ANTR1_ARATH Sodium-dependent phosphate transport protein 1, chloroplastic	71.600%	Swiss-Prot	高置信
`Q8GX78`	拟南芥	sp\|Q8GX78\|ANTR2_ARATH Ascorbate transporter, chloroplastic	80.200%	Swiss-Prot	高置信
`Q7XJR2`	拟南芥	sp\|Q7XJR2\|ANTR3_ARATH Probable anion transporter 3, chloroplastic	43.300%	Swiss-Prot	中等置信
`Q3E9A0`	拟南芥	sp\|Q3E9A0\|ANTR6_ARATH Probable anion transporter 6, chloroplastic	47.800%	Swiss-Prot	中等置信
`Q9SDI4`	水稻	sp\|Q9SDI4\|PHT41_ORYSJ Probable anion transporter 1, chloroplastic	84.100%	Swiss-Prot	高置信
`Q652N5`	水稻	sp\|Q652N5\|PHT44_ORYSJ Probable anion transporter 4, chloroplastic	73.000%	Swiss-Prot	高置信

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