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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkAUNG097510
当前版本: TK1151 染色体: ChrUn 坐标: 27534655-27537770 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2323 bp · TkAUNG097510|TK1151|cDNA

ACAAAACGTTTTCCCAAATACTATATAATATTCTTAGAGATTGGGCGCGTTAGGTAGGCAGGGTGAAGAAGGTGAGTCGAAGTCGAGTGCACGGCAGATAGCGTGAAGACATAAATTAGCATCAGTGGCAGGCAATACGACCGCTGCTACTGTTTTGTGTTGTAAAGACTCAAAATCACGTGCACCACCTCAGTCATCCCTTCAGATTTCCTCCATCAATGATGATTAAGATTGTTGATGAAATCAAACGGGTGTGTGAA...

CDS

下载 CDS FASTA

1296 bp · TkAUNG097510|TK1151|CDS

ATGGGAAAAAAGAGAAGAGGAGTCGAGACCTTACAATCACAACACAAGTCAACTGATTTCAAACAACCCACCAATCACAAACGTTTCATAACCGAAATAGCAACCGCCCCACCTTTCGTCCACGTGTCATCCGACCCACATACCAGGGGCCTAAAACGTAAAATCGGGTGCATCGATGTTCTAACTCAAACCGGCCGAAAGAAAAAAATCGATCAAGATTTCGAAAAAGGCGAAACAATCGGAAACGGGAAATTTGGGTC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

431 aa · TkAUNG097510|TK1151|PROTEIN

MGKKRRGVETLQSQHKSTDFKQPTNHKRFITEIATAPPFVHVSSDPHTRGLKRKIGCIDVLTQTGRKKKIDQDFEKGETIGNGKFGSVVKCINKVTGEQFACKILRKGDEIVHKEVEIMQHLSGHPGVVTLKAVYEDSQSFHLVMELCSGGRLLDRMWEDGLFSEQKAANLIKELMLVLKYCHDMGVIHRDIKPENILLSANGTIKLADFGLAARIANGQSLYGVVGSPAYVAPEVLSGGYTEKVDIWSAGVVLHAVLVG...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkAUNG097510
TK1151 IDTkAUNG097510
OH-1004 IDLXL04_031130
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)58.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 92.111 / OH-1004 84.421
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkAUNG097510
位置ChrUn:27534655-27537770 (-)
描述Similar to PEPKR2: Serine/threonine-protein kinase PEPKR2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g12680 丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 PEPKR2。 暂无已核实直接文献
At1g76040 可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用。 暂无已核实直接文献
At2g35890 可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用。 暂无已核实直接文献
At4g04720 可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os03g0788500 可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_031130 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0035556 intracellular signal transduction 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0004683 calcium/calmodulin-dependent protein kinase activity 分子功能
GO:0005509 calcium ion binding 分子功能
GO:0005516 calmodulin binding 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0009931 calcium-dependent protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0106310 protein serine kinase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G12680
ath:AT1G50700
ath:AT1G76040
dosa:Os03g0788500
gmx:547825
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.540
排名 1 · TkAUNG097510 · TK1151
细胞核0.519
排名 2 · TkAUNG097510 · TK1151
细胞膜0.079
排名 3 · TkAUNG097510 · TK1151
线粒体0.046
排名 4 · TkAUNG097510 · TK1151
内质网0.045
排名 5 · TkAUNG097510 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF14531Kinase-like68-121 aa
PF00069Pkinase74-322 aa
PF07387Seadorna_VP774-135 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr76-315 aa
PF01636APH99-146 aa
PF03109ABC1134-218 aa
PF12330Haspin_kinase137-217 aa
PF06293Kdo143-210 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkAUNG097510PF14531Kinase-like681214.8e-0626.7
TkAUNG097510PF00069Pkinase743221.7e-74251.3
TkAUNG097510PF07387Seadorna_VP7741350.1411.9
TkAUNG097510PF07714PK_Tyr_Ser-Thr763154e-32112.3
TkAUNG097510PF01636APH991460.004817.4
TkAUNG097510PF03109ABC11342182.6e-0627.5
TkAUNG097510PF12330Haspin_kinase1372170.06413.0
TkAUNG097510PF06293Kdo1432100.02314.9
TkAUNG097510PF07387Seadorna_VP71722100.1411.9
TkAUNG097510PF14531Kinase-like1752704.8e-0626.7
TkAUNG097510PF01636APH1842040.004817.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8W490拟南芥sp|Q8W490|PEPK2_ARATH Serine/threonine-protein kinase PEPKR260.100%Swiss-Prot高置信
Q8RWL2拟南芥sp|Q8RWL2|CDPKT_ARATH Calcium-dependent protein kinase 2945.200%Swiss-Prot中等置信
Q9SJ61拟南芥sp|Q9SJ61|CDPKP_ARATH Calcium-dependent protein kinase 2543.900%Swiss-Prot中等置信
Q9ZSA2拟南芥sp|Q9ZSA2|CDPKL_ARATH Calcium-dependent protein kinase 2145.600%Swiss-Prot中等置信
Q6F3A6水稻sp|Q6F3A6|CDPKA_ORYSJ Calcium-dependent protein kinase 1042.400%Swiss-Prot中等置信

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