本页使用教程

基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID,查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度,最大 10000 bp

基因概览

TkAUNG096060
当前版本: TK1151 染色体: ChrUn 坐标: 27166941-27169049 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

1120 bp · TkAUNG096060|TK1151|cDNA

ATTCGTTCAGAAGCTGTATCCGGCGTCCGGCGGTATAAACAGTCGAGGATCCGTCTCGCCTAAATCCATCGACTGAGAAGGAAAAGTCCATAAATTTATTTGAAGAGTGAAAAAACTCAGGCTGCCATGGCTACACTTCCCTTTGGAGATGACAAACGCCCGATTACAACGGTTCTCATTTTTGCTGCCATGGATTCAGAAGCGCTTCCGATTGTCGAACACTTTAAACTTTCACGGGATGATGGTTCTTTGTTTCCATT...

765 bp · TkAUNG096060|TK1151|CDS

ATGGCTACACTTCCCTTTGGAGATGACAAACGCCCGATTACAACGGTTCTCATTTTTGCTGCCATGGATTCAGAAGCGCTTCCGATTGTCGAACACTTTAAACTTTCACGGGATGATGGTTCTTTGTTTCCATTAAGTGTCCCTTGGATCAGATATCATGGTAGCTACAAGGATCTTAATATAAATGTCATTTATCCTGGGAAGGACCCCGAATTTGGTATCAATAGTGTAGGTACAGTTCCTGCATCTCTTGTGACTTA...

254 aa · TkAUNG096060|TK1151|PROTEIN

MATLPFGDDKRPITTVLIFAAMDSEALPIVEHFKLSRDDGSLFPLSVPWIRYHGSYKDLNINVIYPGKDPEFGINSVGTVPASLVTYASIQALKPDLVINAGTAGAFKVKGACIFDVYLVSDLAFHDRRIPIPGPDRYGVGLRKSFPTPNLVRELSLKVCKLSTGDSLDMCPQDETCILANDATIVDMEGAALAYVCSLMKVPVIFIKGVSNFVDGEKSIPEEFKENLQTTVVAIRKVVAQVVEFINGKCLSEL

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkAUNG096060
TK1151 IDTkAUNG096060
OH-1004 IDLXL04_032962
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkAUNG096060
位置ChrUn:27166941-27169049 (-)
描述Similar to MTN2: 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g34840 蛋氨酸循环酶,在较小程度上催化 5'-甲硫腺苷 和 S-腺苷高半胱氨酸 中的糖苷键分别不可逆裂解为腺嘌呤和相应的硫核糖、5'-甲基硫核糖和 S-核糖基高半胱氨酸。
At4g38800 蛋氨酸循环中的酶,催化5'-甲硫腺苷(MTA)不可逆裂解成腺嘌呤和5'-甲硫核糖。

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源:OH1004 · LXL04_032962 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释(OH1004 来源)
GO:0009116 nucleoside metabolic process 生物过程
GO:0009164 nucleoside catabolic process 生物过程
GO:0010087 phloem or xylem histogenesis 生物过程
GO:0019284 L-methionine salvage from S-adenosylmethionine 生物过程
GO:0019509 L-methionine salvage from methylthioadenosine 生物过程
GO:0046124 purine deoxyribonucleoside catabolic process 生物过程
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0008782 adenosylhomocysteine nucleosidase activity 分子功能
GO:0008930 methylthioadenosine nucleosidase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT4G34840
ath:AT4G38800
bas:BUsg_204
hip:CGSHiEE_05950
ppr:PBPRA0538
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号,不代表本基因已获得通路功能验证。

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究;参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时,不自动选择表达记录;缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释,不能替代定位实验。

细胞质0.700
排名 1 · TkAUNG096060 · TK1151
细胞核0.322
排名 2 · TkAUNG096060 · TK1151
线粒体0.074
排名 3 · TkAUNG096060 · TK1151
过氧化物酶体0.061
排名 4 · TkAUNG096060 · TK1151
内质网0.061
排名 5 · TkAUNG096060 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测,非定位实验结果

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF01048PNP_UDP_116-243 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkAUNG096060PF01048PNP_UDP_1162437.4e-2588.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻;Swiss-Prot 为人工审校条目,TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q7XA67拟南芥sp|Q7XA67|MTN2_ARATH 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase58.900%Swiss-Prot高置信
Q9T0I8拟南芥sp|Q9T0I8|MTN1_ARATH 5'-methylthioadenosine nucleosidase60.200%Swiss-Prot高置信

JBrowse

在基因组浏览器中查看