TkAUNG094780 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkAUNG094780

当前版本: TK1151 染色体: ChrUn 坐标: 26805284-26810248 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

679 bp · TkAUNG094780|TK1151|cDNA

TTCCAATCAATCATGACGAGATATTAGCACTAATCTGCTAACGTAAGCCTCGTGAAAACTTTCCGTGCTAACATAAGCGACGGGTGCGCACCCTATTTAATCCTCCCACCCACACCTCACCATGCCCTTCACCCTCCTCAAACTCACAACCGTATATTCGATTTCCCTCCACCACCGGCGTCAATACTGGTGGCTAGGTCGCGCAATCGCCACCGGGAGGTCTAAGACGCCACCTCCGATGTGCTCGAGCTGGTGGAGGA...

CDS

下载 CDS FASTA

732 bp · TkAUNG094780|TK1151|CDS

ATGCCCTTCACCCTCCTCAAACTCACAACCGTATATTCGATTTCCCTCCACCACCGGCGTCAATACTGGTGGCTAGGTCGCGCAATCGCCACCGGGAGGTCTAAGACGCCACCTCCGATGTGCTCGAGCTGGTGGAGGACAACAACCTGTGTGACCCCAGCGCACGATAATAATAGCAACGAAAATAACAGTAATAACAGACTAGGGTTTCGTGGTCAGAAAAATTTGAGATATACGTCTAAAGATAAAGTAGGAGGAAA...

蛋白

下载蛋白 FASTA

243 aa · TkAUNG094780|TK1151|PROTEIN

MPFTLLKLTTVYSISLHHRRQYWWLGRAIATGRSKTPPPMCSSWWRTTTCVTPAHDNNSNENNSNNRLGFRGQKNLRYTSKDKVGGNAFNGGRVSMGSVNNDNRDDKRTTENDRGSGVASTLSSDNHRHLKPAPSKQNPSTKLLTLPTILTIGRVAAIPVIVCTFYMNSRLGTTVTTGIFIAAAITDWLDGYLARKMNLGTAFGAFLDPVADKVHCFTYLHLSILKIYIFFHSHFLLCSLSRK

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkAUNG094780`
TK1151 ID	TkAUNG094780
OH-1004 ID	LXL04_021999
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	99.500
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 88.066 / OH-1004 63.314 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkAUNG094780

位置 ChrUn:26805284-26810248 (+)

描述 Similar to PGPS2: CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase 2

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At3g55030`	催化合成酸性磷脂的关键步骤。	暂无已核实直接文献
`At2g39290`	催化合成酸性磷脂（包括磷脂基甘油 (PG)）的关键步骤。	暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`Os03g0283600`	通过将磷脂酰基从CDP-二酰甘油特异性转移至磷脂酰甘油（PG），催化心磷脂（CL，二磷脂酰甘油）的合成。	暂无已核实直接文献

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_021999 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006655 phosphatidylglycerol biosynthetic process 生物过程

GO:0006661 phosphatidylinositol biosynthetic process 生物过程

GO:0008654 phospholipid biosynthetic process 生物过程

GO:0009658 chloroplast organization 生物过程

GO:0009772 photosynthetic electron transport in photosystem II 生物过程

GO:0010027 thylakoid membrane organization 生物过程

GO:0045995 regulation of embryonic development 生物过程

GO:0046474 glycerophospholipid biosynthetic process 生物过程

GO:0005739 mitochondrion 细胞组分

GO:0005743 mitochondrial inner membrane 细胞组分

GO:0005789 endoplasmic reticulum membrane 细胞组分

GO:0005794 Golgi apparatus 细胞组分

KEGG 基因交叉引用

ath:AT2G39290

ath:AT3G55030

dosa:Os03g0283600

sec:SCH_1948

stm:STM1945

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

线粒体0.905

排名 1 · TkAUNG094780 · TK1151

细胞质0.048

排名 2 · TkAUNG094780 · TK1151

细胞核0.043

排名 3 · TkAUNG094780 · TK1151

质体0.025

排名 4 · TkAUNG094780 · TK1151

细胞膜0.020

排名 5 · TkAUNG094780 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF01066CDP-OH_P_transf145-241 aa

PF09527ATPase_gene1169-206 aa

PF09527ATPase_gene1199-217 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkAUNG094780	`PF01066`	CDP-OH_P_transf	145	241	9.8e-21	75.5
TkAUNG094780	`PF09527`	ATPase_gene1	169	206	0.099	13.4
TkAUNG094780	`PF09527`	ATPase_gene1	199	217	0.099	13.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9M2W3`	拟南芥	sp\|Q9M2W3\|PGPS2_ARATH CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase 2	60.600%	Swiss-Prot	低置信
`O80952`	拟南芥	sp\|O80952\|PGPS1_ARATH CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase 1, chloroplastic/mitochondrial	77.000%	Swiss-Prot	低置信
`Q8H8U0`	水稻	sp\|Q8H8U0\|CRLS1_ORYSJ Cardiolipin synthase (CMP-forming)	71.800%	Swiss-Prot	低置信

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