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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkAUNG091870
当前版本: TK1151 染色体: ChrUn 坐标: 26006297-26012179 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3782 bp · TkAUNG091870|TK1151|cDNA

CTCTTATAGACTTATACTCTTATTGAATTATATTTCCCTTTCTCAAACGATGCATTTTGCATCTGGGAAAGAAACATTTACCTACTTTTTTTTTCTAGTTGGCATATATTAACTTTGCTTTGAAGATAGGATAGCATCCATTTGACTGTAACAGTAGCACGTGCTGAGTCACGTGCATCTCTGTCTCATCTTGACGGAACCAAACTAACGACGCCGAAGCATCACAGCGGACCGAGTTCACCCACTCACTCGCTGACTCA...

CDS

下载 CDS FASTA

2139 bp · TkAUNG091870|TK1151|CDS

ATGGCTTCGACGGTGGCTCAACGAGCTGAACTCGCCAAGTTTTGTAGTTCTCGTGACTGGTCTAAAGCTATTCGCGTTCTCGATTCTCTCCTCTCTCAATCATGCGTTATTCAGGATATTTGTAATCGTGCGTACTGTTATAGTCAATTGGAGCTTCACAAACATGTGATTAAGGACTGTGACAAGGCTCTTCAGCTCGATCCTACGCTTCTTCAAGCCTATATCCTCAAAGGCCATGCGTATTCTGCATTGGGAAGAAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

712 aa · TkAUNG091870|TK1151|PROTEIN

MASTVAQRAELAKFCSSRDWSKAIRVLDSLLSQSCVIQDICNRAYCYSQLELHKHVIKDCDKALQLDPTLLQAYILKGHAYSALGRKDDAVMVWEQGYEHAVHLSVDLKQVLELEELLTAAKQSMAEAKQLSEWSVSKPEPTNSVIKSSETFNNHTMSNLGYGPCGDSKEIESKQNDSSSNGNQQNGTHNISVDFGARSSSSSDNRNKSDLSTKISLVPSKSSDKSDMDSEQSNKGNKKFSVTRISKAKSINVDFRLSRG...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkAUNG091870
TK1151 IDTkAUNG091870
OH-1004 IDLXL04_013599
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)87.400
蛋白覆盖度 (%)TK1151 93.539 / OH-1004 67.030
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkAUNG091870
位置ChrUn:26006297-26012179 (-)
描述Similar to SRFR1: Suppressor of RPS4-RLD 1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g37460 与 EDS1 抵抗途径相关的效应子触发免疫的负调节剂。
Two Arabidopsis srfr (suppressor of rps4-RLD) mutants exhibit avrRps4-specific disease resistance independent of RPS4.2004 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2004.02213.x
SRFR1, a suppressor of effector-triggered immunity, encodes a conserved tetratricopeptide repeat protein with similarity to transcriptional repressors.2009 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2008.03669.x
Resistance to the Pseudomonas syringae effector HopA1 is governed by the TIR-NBS-LRR protein RPS6 and is enhanced by mutations in SRFR1.2009 · DOI: 10.1104/pp.109.139238
Regulation of defense gene expression by Arabidopsis SRFR1.2009 · DOI: 10.4161/psb.4.2.7682
The Arabidopsis resistance-like gene SNC1 is activated by mutations in SRFR1 and contributes to resistance to the bacterial effector AvrRps4.2010 · DOI: 10.1371/journal.ppat.1001172
Pathogen effectors target Arabidopsis EDS1 and alter its interactions with immune regulators.2011 · DOI: 10.1126/science.1211592

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_013599 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006493 protein O-linked glycosylation 生物过程
GO:0009910 negative regulation of flower development 生物过程
GO:0010228 vegetative to reproductive phase transition of meristem 生物过程
GO:0031348 negative regulation of defense response 生物过程
GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程
GO:0045892 negative regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0046813 receptor-mediated virion attachment to host cell 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0048471 perinuclear region of cytoplasm 细胞组分
GO:0016757 glycosyltransferase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G04240
ath:AT4G37460
hsa:79573
syn:slr0751
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.433
排名 1 · TkAUNG091870 · TK1151
细胞质0.417
排名 2 · TkAUNG091870 · TK1151
细胞膜0.092
排名 3 · TkAUNG091870 · TK1151
线粒体0.062
排名 4 · TkAUNG091870 · TK1151
内质网0.060
排名 5 · TkAUNG091870 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF13176TPR_714-32 aa
PF13371TPR_916-73 aa
PF13428TPR_1417-33 aa
PF14853Fis1_TPR_C18-32 aa
PF14559TPR_1919-32 aa
PF12895ANAPC319-93 aa
PF13174TPR_619-33 aa
PF21170FAN1_TPR20-82 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkAUNG091870PF13176TPR_714321e-0938.4
TkAUNG091870PF13371TPR_916739.4e-2277.6
TkAUNG091870PF13428TPR_1417332e-1968.8
TkAUNG091870PF14853Fis1_TPR_C18324.6e-0524.2
TkAUNG091870PF14559TPR_1919322.2e-2176.7
TkAUNG091870PF12895ANAPC319936.2e-1246.4
TkAUNG091870PF13174TPR_619332.3e-1144.3
TkAUNG091870PF21170FAN1_TPR20820.8510.3
TkAUNG091870PF00515TPR_141692.2e-53176.7
TkAUNG091870PF07719TPR_241691.1e-38128.8
TkAUNG091870PF13181TPR_841695e-35117.4
TkAUNG091870PF30484ETO1_C42694.7e-0523.4
TkAUNG091870PF13428TPR_1443782e-1968.8
TkAUNG091870PF12569NatA_aux_su44960.001917.9
TkAUNG091870PF13371TPR_946919.4e-2277.6
TkAUNG091870PF03704BTAD481000.01216.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
F4JS25拟南芥sp|F4JS25|SRFR1_ARATH Suppressor of RPS4-RLD 165.500%Swiss-Prot高置信

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