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基因概览

TkAUNG066020

当前版本: TK1151 染色体: ChrUn 坐标: 19190848-19192082 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

465 bp · TkAUNG066020|TK1151|cDNA

ATGAAGCTTGATTTTAGTGGGTTTGAACCCTCAGCTCCAGTTAAGGGAAATAGAGATGATTTGGATGATGAGATTCTGGCCGTACCATCTTTTGCACTTCCTACCACTGCTGATTTTGATGGGTTTCAGAAAGCCGCAGTACAGATGGTGAAGCCTGCAAAGGGAACGACAACTCTGGCTTTTATATTCAAAGGTGGCGTTATGGTTGCAGCTGATTCCCGTGCAAGCATGGGAGGGTACATATCATCACAAACCGTCAA...

CDS

下载 CDS FASTA

465 bp · TkAUNG066020|TK1151|CDS

ATGAAGCTTGATTTTAGTGGGTTTGAACCCTCAGCTCCAGTTAAGGGAAATAGAGATGATTTGGATGATGAGATTCTGGCCGTACCATCTTTTGCACTTCCTACCACTGCTGATTTTGATGGGTTTCAGAAAGCCGCAGTACAGATGGTGAAGCCTGCAAAGGGAACGACAACTCTGGCTTTTATATTCAAAGGTGGCGTTATGGTTGCAGCTGATTCCCGTGCAAGCATGGGAGGGTACATATCATCACAAACCGTCAA...

蛋白

下载蛋白 FASTA

154 aa · TkAUNG066020|TK1151|PROTEIN

MKLDFSGFEPSAPVKGNRDDLDDEILAVPSFALPTTADFDGFQKAAVQMVKPAKGTTTLAFIFKGGVMVAADSRASMGGYISSQTVKKIIEINPYMLGTMAGGAADCQFWHRNLGIKCRLHELANKRRISVAGASKMLANLLYSYRGMVCPLEL

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkAUNG066020`
TK1151 ID	TkAUNG066020
OH-1004 ID	LXL04_025798
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	32.600
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 61.688 / OH-1004 11.021 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkAUNG066020

位置 ChrUn:19190848-19192082 (-)

描述 Similar to PBB2: Proteasome subunit beta type-7-B

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At1g13060`	蛋白酶体是一种多催化蛋白酶复合物，其特点是能够在中性或微碱性 pH 条件下裂解与离去基团相邻的 Arg、Phe、Tyr、Leu 和 Glu 肽。	暂无已核实直接文献
`At3g26340`	蛋白酶体是一种多催化蛋白酶复合物，其特点是能够在中性或微碱性 pH 条件下裂解与离去基团相邻的 Arg、Phe、Tyr、Leu 和 Glu 肽。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_025798 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006511 ubiquitin-dependent protein catabolic process 生物过程

GO:0006631 fatty acid metabolic process 生物过程

GO:0010345 suberin biosynthetic process 生物过程

GO:0042761 very long-chain fatty acid biosynthetic process 生物过程

GO:0043161 proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process 生物过程

GO:0071555 cell wall organization 生物过程

GO:0000502 proteasome complex 细胞组分

GO:0005634 nucleus 细胞组分

GO:0005737 cytoplasm 细胞组分

GO:0005739 mitochondrion 细胞组分

GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分

GO:0005789 endoplasmic reticulum membrane 细胞组分

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G01600

ath:AT1G63710

ath:AT3G27430

ath:AT5G23190

ath:AT5G40580

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.711

排名 1 · TkAUNG066020 · TK1151

细胞核0.471

排名 2 · TkAUNG066020 · TK1151

线粒体0.064

排名 3 · TkAUNG066020 · TK1151

过氧化物酶体0.052

排名 4 · TkAUNG066020 · TK1151

内质网0.047

排名 5 · TkAUNG066020 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF04209HgmA_C33-74 aa

PF00227Proteasome54-148 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkAUNG066020	`PF04209`	HgmA_C	33	74	0.081	13.4
TkAUNG066020	`PF00227`	Proteasome	54	148	9.8e-26	91.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`O23717`	拟南芥	sp\|O23717\|PSB5A_ARATH Proteasome subunit beta type-5-A	81.300%	Swiss-Prot	高置信
`Q9LIP2`	拟南芥	sp\|Q9LIP2\|PSB5B_ARATH Proteasome subunit beta type-5-B	80.700%	Swiss-Prot	高置信

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