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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkAUNG061890
当前版本: TK1151 染色体: ChrUn 坐标: 17938513-17941947 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2671 bp · TkAUNG061890|TK1151|cDNA

TCTTCTTGCCAACGTTCAAATGTTCTTTACTCTATCGCGGCGAAGAAGAACACTAGGATAGCCGGATCTGCTTCTTTTCTCAACTTTCATTAGTCAATTCGAAGAACATGGAATCTCGTCAATGGTGTCGTATTTTAATTTTTTAGAACATCTCATCAGGAGTCAATCAGTTAAGTTACTTGCATATCAAAATCAAAATCCAAGATTCAAGCTCTGAGTATTTCTTTGAAATCATTTATTGAATAAGCAAGGAGTTCTCA...

CDS

下载 CDS FASTA

1440 bp · TkAUNG061890|TK1151|CDS

ATGATTCTTCACCTCCTCCTTTTCTCTGTGATTCTGGTACTCGCATCCTCATCAGTATCTGTCGGAGCAAATTGCAATCGCGTTTGTAAAGGAAGTAGTCGCGATATCGCAGTTCCTTTCCCGTTTGGATTCTCCGACGATTGCGAAGTTAGTATTGAATGTACGGATACCGGACAATTCCGTATTGCCAACTACACGGTTCTGAATCTAACCAGAGACCATATAGTGATTAATTTACCAGCTAAATGCGACCGCCCGTT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

479 aa · TkAUNG061890|TK1151|PROTEIN

MILHLLLFSVILVLASSSVSVGANCNRVCKGSSRDIAVPFPFGFSDDCEVSIECTDTGQFRIANYTVLNLTRDHIVINLPAKCDRPFGEIRRLIRNRNYALTSRNGLLLGNCSESLNNCSVSTRIIQGYFNLSTCGLANNSLHCYSDDNLGHEFINLLDFKAAGCRVLYSSITVVLEESSTQRSSLMMGFQSVELGWWVPGDCHCHHHAGCKNISYNNARVGYRCHCNNGYDGDGFVNGDGCRRVSNCNATKYISGECGG...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkAUNG061890
TK1151 IDTkAUNG061890
OH-1004 IDLXL04_024270
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)63.600
蛋白覆盖度 (%)TK1151 99.791 / OH-1004 67.938
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkAUNG061890
位置ChrUn:17938513-17941947 (-)
描述Similar to WAKL14: Wall-associated receptor kinase-like 14
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g23450 丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶，可能充当细胞外基质成分的信号传导受体。 暂无已核实直接文献
At5g66790 丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶，可能充当细胞外基质成分的信号传导受体。 暂无已核实直接文献
At3g53840 推定的丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶，可能作为细胞外基质组分的信号受体。 暂无已核实直接文献
At5g02070 丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶，可能充当细胞外基质成分的信号传导受体。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_024270 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0007166 cell surface receptor signaling pathway 生物过程
GO:0010089 xylem development 生物过程
GO:0042631 cellular response to water deprivation 生物过程
GO:0048573 photoperiodism, flowering 生物过程
GO:0071215 cellular response to abscisic acid stimulus 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0030247 polysaccharide binding 分子功能
GO:0044589 pectin binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G18390
ath:AT1G25390
ath:AT2G23450
ath:AT5G02070
ath:AT5G66790
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.863
排名 1 · TkAUNG061890 · TK1151
内质网0.077
排名 2 · TkAUNG061890 · TK1151
细胞质0.075
排名 3 · TkAUNG061890 · TK1151
细胞核0.046
排名 4 · TkAUNG061890 · TK1151
溶酶体／液泡0.029
排名 5 · TkAUNG061890 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF13947GUB_WAK_bind29-74 aa
PF12947EGF_346-59 aa
PF12947EGF_3112-121 aa
PF13947GUB_WAK_bind130-157 aa
PF12947EGF_3204-236 aa
PF00008EGF205-234 aa
PF12662cEGF222-235 aa
PF12947EGF_3238-258 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkAUNG061890PF13947GUB_WAK_bind29740.01516.4
TkAUNG061890PF12947EGF_346590.003618.2
TkAUNG061890PF12947EGF_31121210.003618.2
TkAUNG061890PF13947GUB_WAK_bind1301570.01516.4
TkAUNG061890PF12947EGF_32042360.003618.2
TkAUNG061890PF00008EGF2052340.1213.4
TkAUNG061890PF12662cEGF2222350.04214.4
TkAUNG061890PF12947EGF_32382580.003618.2
TkAUNG061890PF15069FAM1632642860.7310.9
TkAUNG061890PF00069Pkinase3284751.4e-31110.6
TkAUNG061890PF07714PK_Tyr_Ser-Thr3314752.8e-31109.5
TkAUNG061890PF03109ABC13333590.01315.4
TkAUNG061890PF00008EGF3883940.1213.4
TkAUNG061890PF03109ABC13954750.01315.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8RY67拟南芥sp|Q8RY67|WAKLO_ARATH Wall-associated receptor kinase-like 1445.300%Swiss-Prot中等置信
Q8GYF5拟南芥sp|Q8GYF5|WAKLR_ARATH Wall-associated receptor kinase-like 2142.000%Swiss-Prot中等置信
Q9M342拟南芥sp|Q9M342|WAKLP_ARATH Wall-associated receptor kinase-like 1539.000%Swiss-Prot中等置信
Q9LZM4拟南芥sp|Q9LZM4|WAKLQ_ARATH Wall-associated receptor kinase-like 2031.800%Swiss-Prot中等置信

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