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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID,查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度,最大 10000 bp

基因概览

TkAUNG039220
当前版本: TK1151 染色体: ChrUn 坐标: 10935525-10939988 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

1971 bp · TkAUNG039220|TK1151|cDNA

ATGGCTTCAGCAGTCAATAGTTTTGCGTTGTCGCCACCTTGTTTTGCTCTGAATTCAGAGAAAGCAGTTCATCCTGCGCATCCAATTAGATGTTTGGCCAGCAGGGATTCAACACCTGCAGTATCTGCTAATTCTGTCAAAATCAATGGGGCAGTGAATGGAGTTTCTTCTGCTGTGAAGGACGAGAGAGAAAAGGCTTCAGTTGATCTGGGAAATGGTCACGTCAGCTCAGTTGTTGAGAAGGAGAAGAGAGAGAAAGT...

1971 bp · TkAUNG039220|TK1151|CDS

ATGGCTTCAGCAGTCAATAGTTTTGCGTTGTCGCCACCTTGTTTTGCTCTGAATTCAGAGAAAGCAGTTCATCCTGCGCATCCAATTAGATGTTTGGCCAGCAGGGATTCAACACCTGCAGTATCTGCTAATTCTGTCAAAATCAATGGGGCAGTGAATGGAGTTTCTTCTGCTGTGAAGGACGAGAGAGAAAAGGCTTCAGTTGATCTGGGAAATGGTCACGTCAGCTCAGTTGTTGAGAAGGAGAAGAGAGAGAAAGT...

656 aa · TkAUNG039220|TK1151|PROTEIN

MASAVNSFALSPPCFALNSEKAVHPAHPIRCLASRDSTPAVSANSVKINGAVNGVSSAVKDEREKASVDLGNGHVSSVVEKEKREKVKLEPLWDDGYGTETVKDYLDYAKDIIKPDGGPARWFTPISCGPHIRDSPILLFLPGMDGLGLGLILHHKSLGKVFDVWCMHIPVEDRTPFEELVIWVEETLRAEHSSSPNKPIYLVGDSFGGCLALAVAARNPNIDLVLILANPATSFGRSQMQPLLPLLEALPDELHITVPY...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkAUNG039220
TK1151 IDTkAUNG039220
OH-1004 IDLXL04_029367
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)55.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 85.518 / OH-1004 79.232
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkAUNG039220
位置ChrUn:10935525-10939988 (-)
描述Similar to At1g54570: Acyltransferase-like protein At1g54570, chloroplastic
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g54570 酰基转移酶参与叶绿体中脂肪酸植酯的合成,这是在非生物胁迫和衰老期间维持光合膜完整性所需的过程。
At3g26840 参与叶绿体内脂肪酸植醇酯合成的酰基转移酶,该过程对于在非生物胁迫和衰老期间维持光合膜完整性是必需的。

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源:OH1004 · LXL04_029367 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释(OH1004 来源)
GO:0006995 cellular response to nitrogen starvation 生物过程
GO:0010150 leaf senescence 生物过程
GO:0010866 regulation of triglyceride biosynthetic process 生物过程
GO:0019432 triglyceride biosynthetic process 生物过程
GO:0033306 phytol metabolic process 生物过程
GO:0090693 plant organ senescence 生物过程
GO:1904963 regulation of phytol biosynthetic process 生物过程
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0010287 plastoglobule 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0004144 diacylglycerol O-acyltransferase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G54570
ath:AT3G26840
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号,不代表本基因已获得通路功能验证。

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究;参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时,不自动选择表达记录;缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释,不能替代定位实验。

质体0.960
排名 1 · TkAUNG039220 · TK1151
线粒体0.040
排名 2 · TkAUNG039220 · TK1151
细胞核0.027
排名 3 · TkAUNG039220 · TK1151
细胞质0.026
排名 4 · TkAUNG039220 · TK1151
过氧化物酶体0.017
排名 5 · TkAUNG039220 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测,非定位实验结果

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00561Abhydrolase_193-114 aa
PF12697Abhydrolase_6177-380 aa
PF00756Esterase178-221 aa
PF07859Abhydrolase_3183-221 aa
PF00975Thioesterase185-218 aa
PF12146Hydrolase_4190-380 aa
PF00561Abhydrolase_1191-381 aa
PF00326Peptidase_S9193-222 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkAUNG039220PF00561Abhydrolase_1931142.8e-0627.9
TkAUNG039220PF12697Abhydrolase_61773801.1e-0526.9
TkAUNG039220PF00756Esterase1782210.02215.3
TkAUNG039220PF07859Abhydrolase_31832210.005117.3
TkAUNG039220PF00975Thioesterase1852180.0514.5
TkAUNG039220PF12146Hydrolase_41903801.4e-0938.3
TkAUNG039220PF00561Abhydrolase_11913812.8e-0627.9
TkAUNG039220PF00326Peptidase_S91932220.1312.5
TkAUNG039220PF08840BAAT_C1972380.311.8
TkAUNG039220PF00326Peptidase_S93233770.1312.5
TkAUNG039220PF08840BAAT_C3333760.311.8
TkAUNG039220PF07859Abhydrolase_33363760.005117.3
TkAUNG039220PF03982DAGAT5125867.6e-0729.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻;Swiss-Prot 为人工审校条目,TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9ZVN2拟南芥sp|Q9ZVN2|PES1_ARATH Phytyl ester synthase 1, chloroplastic60.500%Swiss-Prot高置信
Q9LW26拟南芥sp|Q9LW26|PES2_ARATH Phytyl ester synthase 2, chloroplastic48.200%Swiss-Prot中等置信

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