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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkAUNG034270
当前版本: TK1151 染色体: ChrUn 坐标: 9263181-9265794 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1287 bp · TkAUNG034270|TK1151|cDNA

ATTATTGGGTCGGAATTGTTTGAATGTTTACGCGAAAAACATGGGAGGTCATACGAGGAATTTGCTCGAACAAAGTTGATACCAGTTGTTGGAAATATATGTGAACCCAATATAGGAATGGATGCATATTCTGCAAATAAAATCATGGAAGATGTTGATGTCATTATAGAATCTGCAGCTAGCACAACCCTAAATGACAGATATGATTTCTTACTCGATATAAACGTGAGTGCGCCTCAAAGGCTGATGAGGTTTGCTAA...

CDS

下载 CDS FASTA

1287 bp · TkAUNG034270|TK1151|CDS

ATTATTGGGTCGGAATTGTTTGAATGTTTACGCGAAAAACATGGGAGGTCATACGAGGAATTTGCTCGAACAAAGTTGATACCAGTTGTTGGAAATATATGTGAACCCAATATAGGAATGGATGCATATTCTGCAAATAAAATCATGGAAGATGTTGATGTCATTATAGAATCTGCAGCTAGCACAACCCTAAATGACAGATATGATTTCTTACTCGATATAAACGTGAGTGCGCCTCAAAGGCTGATGAGGTTTGCTAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

428 aa · TkAUNG034270|TK1151|PROTEIN

IIGSELFECLREKHGRSYEEFARTKLIPVVGNICEPNIGMDAYSANKIMEDVDVIIESAASTTLNDRYDFLLDINVSAPQRLMRFAKRCKNLKLFVHISTAYVNGRKEGIIYEKPLIMGENGRKHDEDEISSLSLFPLDLTDEMSLAMKSCMASTDCEVNKNMKRLGLERAAYYGWYNAYHMTKAMGEMALNEIREDVPVLIMRPSVIESCFKEPIPGWIQGNRMYDPVIASYGKGLLPAYLADPNLHTDIVPVDMVANT...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkAUNG034270
TK1151 IDTkAUNG034270
OH-1004 IDLXL04_032909
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)44.200
蛋白覆盖度 (%)TK1151 99.065 / OH-1004 47.740
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkAUNG034270
位置ChrUn:9263181-9265794 (-)
描述Similar to FAR2: Fatty acyl-CoA reductase 2, chloroplastic
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g11980 催化脂肪酰辅酶A和-ACP底物还原为脂肪醇。
Biochemical characteristics of AtFAR2, a fatty acid reductase from Arabidopsis thaliana that reduces fatty acyl-CoA and -ACP substrates into fatty alcohols.2016 · DOI: 10.18388/abp.2016_1245
At3g56700 催化脂酰辅酶A（fatty acyl-CoA）和脂酰载体蛋白（ACP）底物还原为脂肪醇。
Biochemical characterization of a chloroplast localized fatty acid reductase from Arabidopsis thaliana.2012 · DOI: 10.1016/j.bbalip.2011.10.019
At3g44540 催化脂酰辅酶A还原为脂肪醇。
Three Arabidopsis fatty acyl-coenzyme A reductases, FAR1, FAR4, and FAR5, generate primary fatty alcohols associated with suberin deposition.2010 · DOI: 10.1104/pp.110.158238
Identification of an Arabidopsis fatty alcohol:caffeoyl-Coenzyme A acyltransferase required for the synthesis of alkyl hydroxycinnamates in root waxes.2012 · DOI: 10.1104/pp.112.201822
At4g33790 催化脂肪酰辅酶A还原为脂肪醇。
CER4 encodes an alcohol-forming fatty acyl-coenzyme A reductase involved in cuticular wax production in Arabidopsis.2006 · DOI: 10.1104/pp.106.086785

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_032909 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009556 microsporogenesis 生物过程
GO:0009611 response to wounding 生物过程
GO:0009635 response to herbicide 生物过程
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0010345 suberin biosynthetic process 生物过程
GO:0010584 pollen exine formation 生物过程
GO:0035336 long-chain fatty-acyl-CoA metabolic process 生物过程
GO:1903175 fatty alcohol biosynthetic process 生物过程
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0016628 oxidoreductase activity, acting on the CH-CH group of donors, NAD or NADP as acceptor 分子功能
GO:0080019 alcohol-forming very long-chain fatty acyl-CoA reductase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G11980
ath:AT3G44540
ath:AT3G44550
ath:AT3G56700
ath:AT5G22500
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.287
排名 1 · TkAUNG034270 · TK1151
过氧化物酶体0.211
排名 2 · TkAUNG034270 · TK1151
内质网0.112
排名 3 · TkAUNG034270 · TK1151
线粒体0.105
排名 4 · TkAUNG034270 · TK1151
质体0.100
排名 5 · TkAUNG034270 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF07993NAD_binding_417-260 aa
PF01370Epimerase32-110 aa
PF04321RmlD_sub_bind41-107 aa
PF01370Epimerase151-212 aa
PF04321RmlD_sub_bind178-204 aa
PF04321RmlD_sub_bind264-283 aa
PF07993NAD_binding_4275-338 aa
PF03015Sterile361-426 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkAUNG034270PF07993NAD_binding_4172601.7e-52178.8
TkAUNG034270PF01370Epimerase321101.7e-0525.1
TkAUNG034270PF04321RmlD_sub_bind411070.00516.7
TkAUNG034270PF01370Epimerase1512121.7e-0525.1
TkAUNG034270PF04321RmlD_sub_bind1782040.00516.7
TkAUNG034270PF04321RmlD_sub_bind2642830.00516.7
TkAUNG034270PF07993NAD_binding_42753381.7e-52178.8
TkAUNG034270PF03015Sterile3614261.6e-1351.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q08891拟南芥sp|Q08891|FACR2_ARATH Fatty acyl-CoA reductase 2, chloroplastic46.700%Swiss-Prot中等置信
B9TSP7拟南芥sp|B9TSP7|FACR6_ARATH Fatty acyl-CoA reductase 6, chloroplastic41.900%Swiss-Prot中等置信
Q9LXN3拟南芥sp|Q9LXN3|FACR4_ARATH Probable fatty acyl-CoA reductase 435.500%Swiss-Prot中等置信
Q93ZB9拟南芥sp|Q93ZB9|FACR3_ARATH Fatty acyl-CoA reductase 333.000%Swiss-Prot中等置信

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