TkAUNG028130 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkAUNG028130

当前版本: TK1151 染色体: ChrUn 坐标: 7578528-7583165 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

923 bp · TkAUNG028130|TK1151|cDNA

CTAGTGTGTGTTTTTTCTTGAAAGAAATGCGATCTTATAGGTGTTATGTGGTTGTCATCTTATGGGTTTTGACATTGAACAATGAAGGTTTGTTGTTGTTCTCTAATGGAGGGATTACAAGCTCTTTTGTTAGAAACGAAGAAAAAAGCATAGACATGCCTTTTGATAGTGATGTGTTTACGGTTCCTTCCGGATATAATGCACCTCAACAGGTTCATATAACACAAGGAGATCATGTGGGAAAAGCAATGATAGTGTCA...

CDS

下载 CDS FASTA

1407 bp · TkAUNG028130|TK1151|CDS

ATGCGATCTTATAGGTGTTATGTGGTTGTCATCTTATGGGTTTTGACATTGAACAATGAAGGTTTGTTGTTGTTCTCTAATGGAGGGATTACAAGCTCTTTTGTTAGAAACGAAGAAAAAAGCATAGACATGCCTTTTGATAGTGATGTGTTTACGGTTCCTTCCGGATATAATGCACCTCAACAGGTTCATATAACACAAGGAGATCATGTGGGAAAAGCAATGATAGTGTCATGGGTGACAATGGATGAACCGGGTTC...

蛋白

下载蛋白 FASTA

468 aa · TkAUNG028130|TK1151|PROTEIN

MRSYRCYVVVILWVLTLNNEGLLLFSNGGITSSFVRNEEKSIDMPFDSDVFTVPSGYNAPQQVHITQGDHVGKAMIVSWVTMDEPGSSMVVYWRQNSTQKSQSTGQIYTYKYYNYTSGYIHHCTIKNLEFNTKYYYEVGIGHTTRTFWFVTPPEIGPDVPYTFGIIGDLGQTYDSNSTLTHYEMNPVKGESVLYVGDLSYADHYEFHDNRRWDSWGRFVERSVAYQPWIWTVGNHELDYSPTIGENKPFKPFLHRYHVPF...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkAUNG028130`
TK1151 ID	TkAUNG028130
OH-1004 ID	LXL04_038222
关系 / 置信度	序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)	99.800
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 94.658 / OH-1004 48.205 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkAUNG028130

位置 ChrUn:7578528-7583165 (+)

描述 Similar to PAP2: Purple acid phosphatase 2

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At2g16430`	紫色酸性磷酸酶 10。	暂无已核实直接文献
`At2g27190`	Fe³⁺-Zn²⁺ 紫色酸性磷酸酶12。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_038222 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0016036 cellular response to phosphate starvation 生物过程

GO:0005576 extracellular region 细胞组分

GO:0005615 extracellular space 细胞组分

GO:0005737 cytoplasm 细胞组分

GO:0009505 plant-type cell wall 细胞组分

GO:0009506 plasmodesma 细胞组分

GO:0003993 acid phosphatase activity 分子功能

GO:0030145 manganese ion binding 分子功能

GO:0046872 metal ion binding 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT2G16430

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

溶酶体／液泡0.312

排名 1 · TkAUNG028130 · TK1151

细胞外0.225

排名 2 · TkAUNG028130 · TK1151

细胞膜0.217

排名 3 · TkAUNG028130 · TK1151

细胞质0.154

排名 4 · TkAUNG028130 · TK1151

内质网0.109

排名 5 · TkAUNG028130 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF16656Pur_ac_phosph_N60-151 aa

PF07356DUF148186-109 aa

PF00149Metallophos162-360 aa

PF07356DUF1481269-312 aa

PF14008Metallophos_C386-443 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkAUNG028130	`PF16656`	Pur_ac_phosph_N	60	151	3.4e-20	73.1
TkAUNG028130	`PF07356`	DUF1481	86	109	0.21	12.0
TkAUNG028130	`PF00149`	Metallophos	162	360	1.2e-22	82.0
TkAUNG028130	`PF07356`	DUF1481	269	312	0.21	12.0
TkAUNG028130	`PF14008`	Metallophos_C	386	443	3.2e-21	76.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9SIV9`	拟南芥	sp\|Q9SIV9\|PPA10_ARATH Purple acid phosphatase 10	74.800%	Swiss-Prot	高置信
`Q38924`	拟南芥	sp\|Q38924\|PPA12_ARATH Fe(3+)-Zn(2+) purple acid phosphatase 12	69.600%	Swiss-Prot	高置信

JBrowse

在基因组浏览器中查看

基因详情