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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkAUNG016530
当前版本: TK1151 染色体: ChrUn 坐标: 4422027-4423955 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1245 bp · TkAUNG016530|TK1151|cDNA

AATTCAGCCAACTCAACTTAACTCATGTTATTTTCCCCTTTTTTTTCCCAATCTCTTGTTGCTCGACACACTCCCGCAGCATCAGAAACGCCTCTCGATCGGAGAATCAGCATAACCCAGCTCAGAATATAGGGTTCTTCCGTTGATAGATAATGGGGACTTTAGGAAGAGCAATCTACGTCGTCGGATCCTGGATCCGTGGAGCCGGCCAAGCAGTTGATCGTGTCGGCTGCAGTCTCCAAGGCAGTCACCTCTTTGAA...

CDS

下载 CDS FASTA

738 bp · TkAUNG016530|TK1151|CDS

ATGGGGACTTTAGGAAGAGCAATCTACGTCGTCGGATCCTGGATCCGTGGAGCCGGCCAAGCAGTTGATCGTGTCGGCTGCAGTCTCCAAGGCAGTCACCTCTTTGAAGAACATGTGTCTAGGCATCGGACACTGATGAATGTATTTGATAAAGACCCTGTGGTTGACAAAGATGCATTTGTGGCTCCTGGTGCTTCTGTCATCGGAGATGTTCAAGTGGGGCGTGGTTCCTCTATTTGGTATGGATGTGTTCTTAGAGG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

245 aa · TkAUNG016530|TK1151|PROTEIN

MGTLGRAIYVVGSWIRGAGQAVDRVGCSLQGSHLFEEHVSRHRTLMNVFDKDPVVDKDAFVAPGASVIGDVQVGRGSSIWYGCVLRGDVNSISVGSGTNIQDNALVHVAKTNISGNVLPTTIGNNVTIGHGAVLHGCTVEDEAFVGMGATLLDGTHVEKNAMVAAGSLVRKNTRIPLGEVWGGNPARYMRKLTEEEIAFIAESARNYANLAMVHGAENKKGFEEIEMEKKLRKKKFARRDEEMIP

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkAUNG016530
TK1151 IDTkAUNG016530
OH-1004 IDLXL04_024599
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)93.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 98.776 / OH-1004 87.319
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkAUNG016530
位置ChrUn:4422027-4423955 (+)
描述Similar to GAMMACA2: Gamma carbonic anhydrase 2, mitochondrial
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g47260 可能参与碳酸分解，但不介导二氧化碳的可逆水合。
Disruption of a nuclear gene encoding a mitochondrial gamma carbonic anhydrase reduces complex I and supercomplex I + III2 levels and alters mitochondrial physiology in Arabidopsis.2005 · DOI: 10.1016/j.jmb.2005.04.062
Recombinant plant gamma carbonic anhydrase homotrimers bind inorganic carbon.2009 · DOI: 10.1016/j.febslet.2009.09.055
At1g19580 参与H(2)CO(3)分解代谢的酶，但不介导二氧化碳的可逆水化反应。 暂无已核实直接文献
At5g66510 参与H(2)CO(3)分解代谢的酶，但不介导二氧化碳的可逆水化反应。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_024599 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009853 photorespiration 生物过程
GO:0009901 anther dehiscence 生物过程
GO:0070207 protein homotrimerization 生物过程
GO:2000377 regulation of reactive oxygen species metabolic process 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0009536 plastid 细胞组分
GO:0031966 mitochondrial membrane 细胞组分
GO:0045271 respiratory chain complex I 细胞组分
GO:0004089 carbonate dehydratase activity 分子功能
GO:0042802 identical protein binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G19580
ath:AT1G47260
ath:AT5G66510
ddi:DDB_G0288155
mja:MJ_0304
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

线粒体0.683
排名 1 · TkAUNG016530 · TK1151
细胞质0.213
排名 2 · TkAUNG016530 · TK1151
细胞核0.092
排名 3 · TkAUNG016530 · TK1151
质体0.072
排名 4 · TkAUNG016530 · TK1151
过氧化物酶体0.057
排名 5 · TkAUNG016530 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00132Hexapep53-87 aa
PF24894Hexapep_GlmU53-67 aa
PF25087GMPPB_C54-107 aa
PF25084LbH_EIF2B59-85 aa
PF14602Hexapep_271-79 aa
PF21711DCTN580-204 aa
PF14602Hexapep_290-106 aa
PF25084LbH_EIF2B91-175 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkAUNG016530PF00132Hexapep53875.7e-1864.5
TkAUNG016530PF24894Hexapep_GlmU53670.01416.2
TkAUNG016530PF25087GMPPB_C541074e-0627.3
TkAUNG016530PF25084LbH_EIF2B59852.9e-0731.2
TkAUNG016530PF14602Hexapep_271799.1e-0935.6
TkAUNG016530PF21711DCTN5802040.009716.3
TkAUNG016530PF14602Hexapep_2901069.1e-0935.6
TkAUNG016530PF25084LbH_EIF2B911752.9e-0731.2
TkAUNG016530PF00132Hexapep921065.7e-1864.5
TkAUNG016530PF24894Hexapep_GlmU931470.01416.2
TkAUNG016530PF00132Hexapep1191515.7e-1864.5
TkAUNG016530PF14602Hexapep_21191519.1e-0935.6
TkAUNG016530PF25087GMPPB_C1211744e-0627.3
TkAUNG016530PF00132Hexapep1361715.7e-1864.5
TkAUNG016530PF14602Hexapep_21381699.1e-0935.6
TkAUNG016530PF24894Hexapep_GlmU1491880.01416.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9C6B3拟南芥sp|Q9C6B3|GCA2_ARATH Gamma carbonic anhydrase 2, mitochondrial74.000%Swiss-Prot高置信
Q9FWR5拟南芥sp|Q9FWR5|GCA1_ARATH Gamma carbonic anhydrase 1, mitochondrial71.500%Swiss-Prot高置信
Q94AU7拟南芥sp|Q94AU7|GCA3_ARATH Gamma carbonic anhydrase 3, mitochondrial68.800%Swiss-Prot高置信

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