TkAUNG003620 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkAUNG003620

当前版本: TK1151 染色体: ChrUn 坐标: 1099465-1105378 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

3427 bp · TkAUNG003620|TK1151|cDNA

TAGCTCACTTGGTAAGAGCTCTGGTCTCCCTCTGGAGGTCCAGAGTTCGAACCTTGCTGTGGCTGGCCTGATGCATGGGTTTTATAACCCACATGGGAGTGAAGGTACTGGGTAGTCCAATGCCACGTAAATCCTTCGCGCTAATCCCCTTGTGGCGTGAATTTCGCCCTGGGCTCCCTATAGGTTCCTGACTGCCCTGATGGATGCTCGAACCTGGGACGTCTCCTGAAATAATGGAGGCGTGGTTCCGTTGCACCACC...

CDS

下载 CDS FASTA

1647 bp · TkAUNG003620|TK1151|CDS

ATGTCTGTACTAAAACAGTTCGAACACCTCAAAATAAAACTAGAAGCTATAGAATCAGCAACCAACAACTTTGCTGGAGACAGTTGCATCGGAAAAGGGGGCTTCGGGAAAGTATACAAGGGAGATCTCCTCCACTCAAACGGGCTTACCACAGTTGCTATAAAACGTTTAGATCGTGCATTTGGACAAGGAGATTCCGAGTTTTGGAAAGAGGTAATTATGCTTTCAGTTTACAGGCATGAAAATATCGTCTCCCTCTT...

蛋白

下载蛋白 FASTA

548 aa · TkAUNG003620|TK1151|PROTEIN

MSVLKQFEHLKIKLEAIESATNNFAGDSCIGKGGFGKVYKGDLLHSNGLTTVAIKRLDRAFGQGDSEFWKEVIMLSVYRHENIVSLLGFCDEKDEKILVYEYASRRSLDLHLDNKDLTWVRRLEICIGAARGLAYLHNPAGTQQRVLHRDIKSSNILLDENWNARIADLGLSKFGPANQIFTFIVTNNRAGTIGYCDPLYLECGILTKESDVYSFGVVLFEVLCGRLCFGRNDNKPQSFTQLVRKHYKHDSLYEIIWGNI...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkAUNG003620`
TK1151 ID	TkAUNG003620
OH-1004 ID	LXL04_015586
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	99.600
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkAUNG003620

位置 ChrUn:1099465-1105378 (+)

描述 Similar to At5g39000: Putative receptor-like protein kinase At5g39000

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At5g39000`	推测的受体样蛋白激酶At5g39000。	暂无已核实直接文献
`At3g46290`	营养生长过程中细胞伸长所需的受体样蛋白激酶，主要以油菜素甾醇独立的方式进行。	Three related receptor-like kinases are required for optimal cell elongation in Arabidopsis thaliana.2009 · DOI: 10.1073/pnas.0812346106
`At5g28680`	类受体蛋白激酶，通过在适当时间引导花粉管破裂来释放精细胞，从而控制花粉管行为。	暂无已核实直接文献
`At5g59700`	可能的受体样蛋白激酶 At5g59700。	暂无已核实直接文献
`At5g38990`	可能的受体样蛋白激酶At5g38990。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_015586 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0009741 response to brassinosteroid 生物过程

GO:0009826 unidimensional cell growth 生物过程

GO:0010038 response to metal ion 生物过程

GO:0010183 pollen tube guidance 生物过程

GO:0010483 pollen tube reception 生物过程

GO:0005576 extracellular region 细胞组分

GO:0005886 plasma membrane 细胞组分

GO:0009506 plasmodesma 细胞组分

GO:0009536 plastid 细胞组分

GO:0016324 apical plasma membrane 细胞组分

GO:0043680 filiform apparatus 细胞组分

GO:0090404 pollen tube tip 细胞组分

KEGG 基因交叉引用

ath:AT3G46290

ath:AT5G28680

ath:AT5G38990

ath:AT5G39000

ath:AT5G59700

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.510

排名 1 · TkAUNG003620 · TK1151

细胞质0.294

排名 2 · TkAUNG003620 · TK1151

细胞核0.228

排名 3 · TkAUNG003620 · TK1151

内质网0.078

排名 4 · TkAUNG003620 · TK1151

高尔基体0.060

排名 5 · TkAUNG003620 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00069Pkinase28-295 aa

PF07714PK_Tyr_Ser-Thr29-297 aa

PF01636APH137-176 aa

PF14381EDR1_CTR1_ARMC3_pept300-352 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkAUNG003620	`PF00069`	Pkinase	28	295	3.4e-40	138.8
TkAUNG003620	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	29	297	8.4e-40	137.4
TkAUNG003620	`PF01636`	APH	137	176	0.2	12.1
TkAUNG003620	`PF14381`	EDR1_CTR1_ARMC3_pept	300	352	7.5e-19	69.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9FID8`	拟南芥	sp\|Q9FID8\|Y5900_ARATH Putative receptor-like protein kinase At5g39000	46.100%	Swiss-Prot	中等置信
`Q9LX66`	拟南芥	sp\|Q9LX66\|HERK_ARATH Receptor-like protein kinase HERK 1	47.000%	Swiss-Prot	中等置信
`Q3E8W4`	拟南芥	sp\|Q3E8W4\|ANX2_ARATH Receptor-like protein kinase ANXUR2	46.400%	Swiss-Prot	中等置信
`Q9FN92`	拟南芥	sp\|Q9FN92\|Y5597_ARATH Probable receptor-like protein kinase At5g59700	46.600%	Swiss-Prot	中等置信
`Q9FID9`	拟南芥	sp\|Q9FID9\|Y5389_ARATH Probable receptor-like protein kinase At5g38990	44.900%	Swiss-Prot	中等置信

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