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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkAUNG000480
当前版本: TK1151 染色体: ChrUn 坐标: 116421-121894 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3254 bp · TkAUNG000480|TK1151|cDNA

GTCATTTCTTCCAATATGGCGCACCACATTACACGTATAGTCGTATTTTATTATTACAGCATTCCCCACCTCCTGACTCCTCCTGACTCTCAATCTTTTTCTTCATCACACTACTATGTTTATGCTCTGCAAACACTTGAAGGCATCAAGCTTTCTCTTCGTCCCAAATCCTTGTTTCCTTTTACAAGATCTCGTATGGGTTCGCAATATGCCGCCATTAAAGCTCAATGCTCGAGCTCTGCTTTCATGGCGGAACATCG...

CDS

下载 CDS FASTA

1563 bp · TkAUNG000480|TK1151|CDS

ATGAAACTTGATTTAACTGGAAACCCATTGTTGCAATTGAATCCGTCTAAAACCCCTTCTCCTAAAACCAGTCCAGCGGCCGTACCTCCGACGAACAGCCACCAATCTCCGCCTATAACAGGGAAAGAGAAAAATCCGACACCTGGAACCAATAATACTCTCGTCCCTGGTGAAGATCCTGCACCTCAGAGTGGTAGACGTTCGAAGAAATCGAATATAGTCGCCATTATTGCTCCAATTGCAGGTTTTTTGAGTTTAAT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

520 aa · TkAUNG000480|TK1151|PROTEIN

MKLDLTGNPLLQLNPSKTPSPKTSPAAVPPTNSHQSPPITGKEKNPTPGTNNTLVPGEDPAPQSGRRSKKSNIVAIIAPIAGFLSLILLIIPLSIYLCRSKKVNSHQPPSSLVIHPRDPSDSDNTVKIAIANDTNTSIGSGSGSGSGMGESHVIESGNLIISVQVLKNVTKNFSHENELGRGGFGVVYKGQLHDGTKIAVKRMEAGVISNKALDEFQAEIAVLSKVRHRHLVSLIGYSAEGSERILVYEFMPQGALSRHL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkAUNG000480
TK1151 IDTkAUNG000480
OH-1004 IDLXL04_014428
关系 / 置信度序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)96.900
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 48.644
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkAUNG000480
位置ChrUn:116421-121894 (+)
描述Similar to TMK3: Receptor-like kinase TMK3
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g01820 参与生长素信号转导及细胞膨胀与增殖调控。 暂无已核实直接文献
At1g66150 跨膜激酶受体。
The TMK1 gene from Arabidopsis codes for a protein with structural and biochemical characteristics of a receptor protein kinase.1992 · DOI: 10.1105/tpc.4.10.1263
Receptor-like kinase activity in membranes of Arabidopsis thaliana.1993 · DOI: 10.1016/0014-5793(93)80676-l
At3g23750 参与生长素信号转导和细胞扩增增殖调节。
Identification of Arabidopsis BAK1-associating receptor-like kinase 1 (BARK1) and characterization of its gene expression and brassinosteroid-regulated root phenotypes.2013 · DOI: 10.1093/pcp/pct106
At1g24650 参与生长素信号转导及细胞膨胀与增殖调控。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os11g0448000 参与调控活性氧（ROS）稳态、叶绿体发育及叶片衰老的跨膜激酶受体。
WATER-SOAKED SPOT1 Controls Chloroplast Development and Leaf Senescence via Regulating Reactive Oxygen Species Homeostasis in Rice.2022 · DOI: 10.3389/fpls.2022.918673
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_014428 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006468 protein phosphorylation 生物过程
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0009555 pollen development 生物过程
GO:0009658 chloroplast organization 生物过程
GO:0010600 regulation of auxin biosynthetic process 生物过程
GO:0010928 regulation of auxin mediated signaling pathway 生物过程
GO:1900055 regulation of leaf senescence 生物过程
GO:2000377 regulation of reactive oxygen species metabolic process 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005794 Golgi apparatus 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G24650
ath:AT1G66150
ath:AT2G01820
ath:AT3G23750
dosa:Os11g0448000
osa:4350438
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.835
排名 1 · TkAUNG000480 · TK1151
细胞质0.121
排名 2 · TkAUNG000480 · TK1151
细胞核0.095
排名 3 · TkAUNG000480 · TK1151
内质网0.063
排名 4 · TkAUNG000480 · TK1151
高尔基体0.024
排名 5 · TkAUNG000480 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF02439Adeno_E3_CR273-104 aa
PF03109ABC1166-214 aa
PF00069Pkinase174-446 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr176-447 aa
PF03109ABC1288-333 aa
PF02439Adeno_E3_CR2420-425 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkAUNG000480PF02439Adeno_E3_CR2731040.4211.1
TkAUNG000480PF03109ABC11662141.1e-0628.7
TkAUNG000480PF00069Pkinase1744467.4e-45154.1
TkAUNG000480PF07714PK_Tyr_Ser-Thr1764479e-47160.3
TkAUNG000480PF03109ABC12883331.1e-0628.7
TkAUNG000480PF02439Adeno_E3_CR24204250.4211.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9SIT1拟南芥sp|Q9SIT1|TMK3_ARATH Receptor-like kinase TMK355.700%Swiss-Prot高置信
P43298拟南芥sp|P43298|TMK1_ARATH Receptor protein kinase TMK154.600%Swiss-Prot高置信
Q9LK43拟南芥sp|Q9LK43|TMK4_ARATH Receptor-like kinase TMK462.900%Swiss-Prot高置信
Q9FYK0拟南芥sp|Q9FYK0|TMK2_ARATH Receptor-like kinase TMK252.900%Swiss-Prot高置信
Q2R560水稻sp|Q2R560|WSS1_ORYSJ Receptor protein kinase WSS155.000%Swiss-Prot中等置信

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