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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G241000
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 62858956-62859711 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

726 bp · TkA08G241000|TK1151|cDNA

ATGGTGAAATCTCACGAAGATTTCGATCGAGAGGTTCGAGTTTTGTCAAAAGCAAGACACCCTAATCTCGTATCCGTCAAAGGGTATTTCTGGAAACCCGAGTTACAGCTTCTAGTAACAGAGTATGTATCAAACAGTAGCTTACAGTCCAAACTCCATAACCAGTCAACTTCAAGTCAACTTTCATGGTCAACGCGTTTCAATATCTTGTTAGGAACCGCAAATGGGTTAGCCCATTTACACCATTCGTTTCGCCCACC...

CDS

下载 CDS FASTA

726 bp · TkA08G241000|TK1151|CDS

ATGGTGAAATCTCACGAAGATTTCGATCGAGAGGTTCGAGTTTTGTCAAAAGCAAGACACCCTAATCTCGTATCCGTCAAAGGGTATTTCTGGAAACCCGAGTTACAGCTTCTAGTAACAGAGTATGTATCAAACAGTAGCTTACAGTCCAAACTCCATAACCAGTCAACTTCAAGTCAACTTTCATGGTCAACGCGTTTCAATATCTTGTTAGGAACCGCAAATGGGTTAGCCCATTTACACCATTCGTTTCGCCCACC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

241 aa · TkA08G241000|TK1151|PROTEIN

MVKSHEDFDREVRVLSKARHPNLVSVKGYFWKPELQLLVTEYVSNSSLQSKLHNQSTSSQLSWSTRFNILLGTANGLAHLHHSFRPPLVHYNLKANNILLDENLNPKISDFGLTRIMAKHDKQGYVAPELACQSLRVNEKCDVYGFGVLILEVVTGKRAIEYGDDNVLILSEEVRGMLEEGNVLECVDLRMGEYREDEVLPVLKLALVCTSQIPSSRPSMAEVVQILQVIRTPVRHRMEAY

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G241000
TK1151 IDTkA08G241000
OH-1004 IDLXL04_033208
关系 / 置信度序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)95.600
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 25.150
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G241000
位置Chr08:62858956-62859711 (-)
描述Similar to At3g28040: Probably inactive leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At3g28040
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g28040 可能失活的富亮氨酸重复受体样蛋白激酶 At3g28040。 暂无已核实直接文献
At3g56370 可能的LRR受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶IRK。 暂无已核实直接文献
At5g01890 富含亮氨酸重复的受体样蛋白激酶，可能参与维管组织发育。 暂无已核实直接文献
At1g12460 可能的LRR受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶At1g12460。 暂无已核实直接文献
At4g28650 参与调控维管组织发育过程中原形成层的维持和极性。
A receptor heteromer mediates the male perception of female attractants in plants.2016 · DOI: 10.1038/nature16975

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_033208 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006468 protein phosphorylation 生物过程
GO:0009755 hormone-mediated signaling pathway 生物过程
GO:0009934 regulation of meristem structural organization 生物过程
GO:0010067 procambium histogenesis 生物过程
GO:0010075 regulation of meristem growth 生物过程
GO:0010087 phloem or xylem histogenesis 生物过程
GO:0010183 pollen tube guidance 生物过程
GO:0030154 cell differentiation 生物过程
GO:0046777 protein autophosphorylation 生物过程
GO:0048229 gametophyte development 生物过程
GO:0048364 root development 生物过程
GO:0048437 floral organ development 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G28040
ath:AT3G49670
ath:AT3G56370
ath:AT4G28650
ath:AT5G01890
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.491
排名 1 · TkA08G241000 · TK1151
细胞膜0.400
排名 2 · TkA08G241000 · TK1151
细胞核0.295
排名 3 · TkA08G241000 · TK1151
高尔基体0.042
排名 4 · TkA08G241000 · TK1151
内质网0.037
排名 5 · TkA08G241000 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF07714PK_Tyr_Ser-Thr3-227 aa
PF00069Pkinase5-225 aa
PF12260PIP49_C37-113 aa
PF12330Haspin_kinase61-121 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G241000PF07714PK_Tyr_Ser-Thr32273.8e-31109.1
TkA08G241000PF00069Pkinase52259.7e-29101.3
TkA08G241000PF12260PIP49_C371130.0314.6
TkA08G241000PF12330Haspin_kinase611210.02514.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LRT1拟南芥sp|Q9LRT1|Y3804_ARATH Probably inactive leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At3g2804065.700%Swiss-Prot高置信
Q9LY03拟南芥sp|Q9LY03|IRK_ARATH Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase IRK49.400%Swiss-Prot中等置信
Q9LZV7拟南芥sp|Q9LZV7|PXC2_ARATH Leucine-rich repeat receptor-like protein kinase PXC250.200%Swiss-Prot高置信
C0LGE4拟南芥sp|C0LGE4|Y1124_ARATH Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g1246045.000%Swiss-Prot中等置信
Q9M0G7拟南芥sp|Q9M0G7|MIK1_ARATH MDIS1-interacting receptor like kinase 139.300%Swiss-Prot中等置信

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