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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID,查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度,最大 10000 bp

基因概览

TkA08G204600
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 53474349-53477396 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

2643 bp · TkA08G204600|TK1151|cDNA

ATGGCGGCCGTGCGGAAGCTCATTGTAGAAGTAGTTGACGCCCGAAATCTTCTCCCAAAAGACGGTCATGGCACATCAAGTCCCTACGTGATTCTTGATTTCTACGGCCAGCGGCGGAAGACCCGGGTGGTGGCTAGGGATTTGAACCCGGTTTGGAATGAGGTTTTGGAATTTAATGTCGGAAAGCCGTCGGATGTGTTCGGTGATATGCTTGAAGTCGATGTTAATCACGATAAGAGTCTTGGGCCGACGACCAGAAC...

2643 bp · TkA08G204600|TK1151|CDS

ATGGCGGCCGTGCGGAAGCTCATTGTAGAAGTAGTTGACGCCCGAAATCTTCTCCCAAAAGACGGTCATGGCACATCAAGTCCCTACGTGATTCTTGATTTCTACGGCCAGCGGCGGAAGACCCGGGTGGTGGCTAGGGATTTGAACCCGGTTTGGAATGAGGTTTTGGAATTTAATGTCGGAAAGCCGTCGGATGTGTTCGGTGATATGCTTGAAGTCGATGTTAATCACGATAAGAGTCTTGGGCCGACGACCAGAAC...

880 aa · TkA08G204600|TK1151|PROTEIN

MAAVRKLIVEVVDARNLLPKDGHGTSSPYVILDFYGQRRKTRVVARDLNPVWNEVLEFNVGKPSDVFGDMLEVDVNHDKSLGPTTRTNFLGRVRLNSQQFVKKGEEALIYYPLEKKHLFSWIQGEIGLKIYFVDDVAPPPAPPSPPSSEEVKAETKSSEVADAARAGDSEDPPATGKYKPNDEPPPPPPVPEAAPTEPVPPSEASNQDHDSDPDDSGDDHVQPSNPMKQERFDFDQLRTSRSMPNIKISDVSDRFPIERS...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G204600
TK1151 IDTkA08G204600
OH-1004 IDLXL04_032783
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)85.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G204600
位置Chr08:53474349-53477396 (+)
描述Similar to QKY: Protein QUIRKY
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g17980 可能通过调节其他调控因子的运输发挥信号分子的功能。 暂无已核实直接文献
At1g74720 可能参与 Ca 2(+)-依赖的信号传导和膜转运。 暂无已核实直接文献
At4g11610 可能通过调节其他调控因子的运输发挥信号分子的功能。 暂无已核实直接文献
At3g03680 可能通过调节其他调控因子的运输发挥信号分子的功能。 暂无已核实直接文献
At5g48060 可能通过调节其他调控因子的运输发挥信号分子的功能。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源:OH1004 · LXL04_032783 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释(OH1004 来源)
GO:0009911 positive regulation of flower development 生物过程
GO:0010497 plasmodesmata-mediated intercellular transport 生物过程
GO:0048467 gynoecium development 生物过程
GO:0048729 tissue morphogenesis 生物过程
GO:0051211 anisotropic cell growth 生物过程
GO:0099402 plant organ development 生物过程
GO:0000139 Golgi membrane 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分
GO:0005789 endoplasmic reticulum membrane 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G74720
ath:AT3G03680
ath:AT4G11610
ath:AT5G17980
ath:AT5G48060
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号,不代表本基因已获得通路功能验证。

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究;参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时,不自动选择表达记录;缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释,不能替代定位实验。

细胞膜0.415
排名 1 · TkA08G204600 · TK1151
内质网0.320
排名 2 · TkA08G204600 · TK1151
细胞质0.172
排名 3 · TkA08G204600 · TK1151
高尔基体0.150
排名 4 · TkA08G204600 · TK1151
细胞核0.103
排名 5 · TkA08G204600 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测,非定位实验结果

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00168C26-109 aa
PF11696DUF3292140-160 aa
PF11696DUF3292183-210 aa
PF08372PRT_C253-280 aa
PF00168C2270-376 aa
PF00168C2426-458 aa
PF00168C2477-578 aa
PF11696DUF3292662-748 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G204600PF00168C261091e-45155.0
TkA08G204600PF11696DUF32921401600.0001820.8
TkA08G204600PF11696DUF32921832100.0001820.8
TkA08G204600PF08372PRT_C2532801.1e-68230.7
TkA08G204600PF00168C22703761e-45155.0
TkA08G204600PF00168C24264581e-45155.0
TkA08G204600PF00168C24775781e-45155.0
TkA08G204600PF11696DUF32926627480.0001820.8
TkA08G204600PF04842DUF6396737280.01115.9
TkA08G204600PF02453Reticulon6967350.02115.4
TkA08G204600PF08372PRT_C6987161.1e-68230.7
TkA08G204600PF08372PRT_C7248801.1e-68230.7
TkA08G204600PF11696DUF32928108440.0001820.8
TkA08G204600PF04842DUF6398108520.01115.9
TkA08G204600PF02453Reticulon8118460.02115.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻;Swiss-Prot 为人工审校条目,TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9FJG3拟南芥sp|Q9FJG3|MCT16_ARATH Multiple C2 domain and transmembrane region protein 1655.400%Swiss-Prot高置信
B8XCH5拟南芥sp|B8XCH5|QKY_ARATH Protein QUIRKY42.600%Swiss-Prot中等置信
Q84TJ7拟南芥sp|Q84TJ7|MCTP7_ARATH Multiple C2 domain and transmembrane region protein 737.600%Swiss-Prot中等置信
Q9SS68拟南芥sp|Q9SS68|MCT14_ARATH Multiple C2 domain and transmembrane region protein 1438.500%Swiss-Prot中等置信
Q9FI32拟南芥sp|Q9FI32|MCTP2_ARATH Multiple C2 domain and transmembrane region protein 237.800%Swiss-Prot中等置信

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