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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G175920
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 46007634-46012842 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3217 bp · TkA08G175920|TK1151|cDNA

TCATACCTTACCCCTCTCTTCTCCTTCTCAATAGTTGTTCTGGTTAATTGATGATCATGACCTTTGATCTTTCAAATCCTTAATCGTTAATTTTGAAAGCGATTGATCAACTGTTGCTTCCGGTGGTGGAGTCTCATACTTCTTTTTCACCGATTAAAGACTTTCAGTTCCGTTTTCCAATTCGAATTTCAATGGAGAAGACAAGAGAAAGAAACACGCAGGAAATATGCTTCATGTTCTTGTTTCTATTCTTCTTTTCT...

CDS

下载 CDS FASTA

2871 bp · TkA08G175920|TK1151|CDS

ATGGAGAAGACAAGAGAAAGAAACACGCAGGAAATATGCTTCATGTTCTTGTTTCTATTCTTCTTTTCTTTTACTTGTAATGGCTTCCAAACTGTCAATGAGCATGAAATACTTTTTTCCATCAAAGCATCCCTCCATGATCCTTCAACCTTCCTCTCCAACTGGAAGAACACTTCTCTATTTTGCACGTGGAATGGCGTTTCATGCAACTCCGATTCCACCCATGTCACCGGACTTCACCTTTCCGGGAAGAATCTCTC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

956 aa · TkA08G175920|TK1151|PROTEIN

MEKTRERNTQEICFMFLFLFFFSFTCNGFQTVNEHEILFSIKASLHDPSTFLSNWKNTSLFCTWNGVSCNSDSTHVTGLHLSGKNLSGRISESFFQFSHVETIDLSSNQLSGGIPGNVFSCSSLVHLNLSNNNLTGWIPEGSIPKLEKLDLSNNFLDGEIPAEIGSFSGLLYLDLGGNALVGQIPKSMSNLTRLKDLTLASNQLVGGVPSELGFMKSLNFIYLGYNNLSGEIPKEIGGLSSLNHLNLAFNNLTGEIPASL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G175920
TK1151 IDTkA08G175920
OH-1004 IDLXL04_032442
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.900
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G175920
位置Chr08:46007634-46012842 (+)
描述Similar to At2g25790: Probably inactive leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At2g25790
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g25790 具有丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶活性的受体（通过相似性）。
A novel pollen-pistil interaction conferring high-temperature tolerance during reproduction via CLE45 signaling.2013 · DOI: 10.1016/j.cub.2013.06.060
Arabidopsis MAKR5 is a positive effector of BAM3-dependent CLE45 signaling.2016 · DOI: 10.15252/embr.201642450
At5g63930 可能是富含亮氨酸重复的受体样蛋白激酶 At5g63930。 暂无已核实直接文献
At5g16590 可能参与生长促进真菌的早期识别。
A leucine-rich repeat protein is required for growth promotion and enhanced seed production mediated by the endophytic fungus Piriformospora indica in Arabidopsis thaliana.2007 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2007.03028.x
At1g17750 充当 PEP 防御肽的受体。 暂无已核实直接文献
At1g73080 充当 PEP 防御肽的受体。
The cell surface leucine-rich repeat receptor for AtPep1, an endogenous peptide elicitor in Arabidopsis, is functional in transgenic tobacco cells.2006 · DOI: 10.1073/pnas.0603729103
BIK1 interacts with PEPRs to mediate ethylene-induced immunity.2013 · DOI: 10.1073/pnas.1215543110

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_032442 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006468 protein phosphorylation 生物过程
GO:0009266 response to temperature stimulus 生物过程
GO:0009755 hormone-mediated signaling pathway 生物过程
GO:0009934 regulation of meristem structural organization 生物过程
GO:0010067 procambium histogenesis 生物过程
GO:0010075 regulation of meristem growth 生物过程
GO:0010087 phloem or xylem histogenesis 生物过程
GO:0010183 pollen tube guidance 生物过程
GO:0030154 cell differentiation 生物过程
GO:0035556 intracellular signal transduction 生物过程
GO:0046777 protein autophosphorylation 生物过程
GO:0048229 gametophyte development 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G08590
ath:AT2G25790
ath:AT3G49670
ath:AT4G28650
ath:AT5G65700
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.874
排名 1 · TkA08G175920 · TK1151
内质网0.089
排名 2 · TkA08G175920 · TK1151
细胞质0.062
排名 3 · TkA08G175920 · TK1151
细胞核0.043
排名 4 · TkA08G175920 · TK1151
溶酶体／液泡0.025
排名 5 · TkA08G175920 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF08263LRRNT_236-70 aa
PF13516LRR_673-83 aa
PF13855LRR_875-134 aa
PF12799LRR_475-110 aa
PF00560LRR_177-96 aa
PF24141LRR_ComC94-140 aa
PF23211LRR_LRWD195-154 aa
PF12799LRR_499-134 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G175920PF08263LRRNT_236702.5e-1041.2
TkA08G175920PF13516LRR_673830.001519.2
TkA08G175920PF13855LRR_8751341.1e-39134.8
TkA08G175920PF12799LRR_4751102e-34117.5
TkA08G175920PF00560LRR_177961.6e-55173.7
TkA08G175920PF24141LRR_ComC941405.3e-1040.2
TkA08G175920PF23211LRR_LRWD1951540.06113.8
TkA08G175920PF12799LRR_4991342e-34117.5
TkA08G175920PF13516LRR_6991110.001519.2
TkA08G175920PF00560LRR_11001201.6e-55173.7
TkA08G175920PF23598LRR_141031511.9e-28100.0
TkA08G175920PF24141LRR_ComC1091905.3e-1040.2
TkA08G175920PF24758LRR_At5g563701121541.4e-1042.0
TkA08G175920PF23952LRR_EndoS1181540.4411.5
TkA08G175920PF13516LRR_61211350.001519.2
TkA08G175920PF00560LRR_11231401.6e-55173.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
O82318拟南芥sp|O82318|SKM1_ARATH Leucine-rich repeat receptor-like serine/threonine-protein kinase SKM139.400%Swiss-Prot低置信
Q9LVP0拟南芥sp|Q9LVP0|Y5639_ARATH Probable leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At5g6393030.500%Swiss-Prot低置信
Q9FMD7拟南芥sp|Q9FMD7|Y5659_ARATH Probable inactive receptor kinase At5g1659029.700%Swiss-Prot低置信
Q9FZ59拟南芥sp|Q9FZ59|PEPR2_ARATH Leucine-rich repeat receptor-like protein kinase PEPR230.800%Swiss-Prot低置信
Q9SSL9拟南芥sp|Q9SSL9|PEPR1_ARATH Leucine-rich repeat receptor-like protein kinase PEPR128.400%Swiss-Prot低置信

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