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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G175050
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 45798624-45806780 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

4665 bp · TkA08G175050|TK1151|cDNA

GAATGTGTTTACCTTAAAACCCCCACAATTCTCAACCGTCTTACCATGGTATTTTCAGTCATTTCTTTACTACAATGTGGGATTCTCTTGGAAACCTCTTCGTGAGGACGCAGGATAATGACCATGAAGCGCTCCAATTGGCTGCATTACAGAGGTCGCCAACGTTTGTTAGGGCTAGAACTTCCGTGTTCAGGAATTTCGGGGGTGAGTTTACTCTTGTTGATGTTAGTAAGCTTGATGCTGAAGAGAAGAAGGTAGTG...

CDS

下载 CDS FASTA

4254 bp · TkA08G175050|TK1151|CDS

ATGTGGGATTCTCTTGGAAACCTCTTCGTGAGGACGCAGGATAATGACCATGAAGCGCTCCAATTGGCTGCATTACAGAGGTCGCCAACGTTTGTTAGGGCTAGAACTTCCGTGTTCAGGAATTTCGGGGGTGAGTTTACTCTTGTTGATGTTAGTAAGCTTGATGCTGAAGAGAAGAAGGTAGTGTTGGATAAATTGGTGCACTCAGTGAATTCAAACCCGGAGCTGTTTTTTGATAGGATTCGACAGCGATTCGATAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

1417 aa · TkA08G175050|TK1151|PROTEIN

MWDSLGNLFVRTQDNDHEALQLAALQRSPTFVRARTSVFRNFGGEFTLVDVSKLDAEEKKVVLDKLVHSVNSNPELFFDRIRQRFDNVDLKFPKVEVRFENLEIDAFVHVGSRALPTLPNSIYNMSEALLRKLRIFPGRRKKLSILNDVSGIIKPSRLTLLLGPPSSGKTTLLLALAGRLGHGLKSSGKITYNGHELNEFVPQRTSSYVSQKDCHMAEMTVRETLQFAECCQGFGYKQDMIMELLRREKNAGIRPDEDLD...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G175050
TK1151 IDTkA08G175050
OH-1004 IDLXL04_002604
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)68.600
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 97.726
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G175050
位置Chr08:45798624-45806780 (-)
描述Similar to ABCG32: ABC transporter G family member 32
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g26910 可能是一种通用防御蛋白（通过相似性推测）。
A member of the PLEIOTROPIC DRUG RESISTANCE family of ATP binding cassette transporters is required for the formation of a functional cuticle in Arabidopsis.2011 · DOI: 10.1105/tpc.111.083121

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os01g0177900 可能是一种一般防御蛋白。 暂无已核实直接文献
Os01g0609300 可能是一种一般防御蛋白。 暂无已核实直接文献
Os09g0332700 可能是一种一般防御蛋白。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_002604 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009914 hormone transport 生物过程
GO:0080051 cutin transport 生物过程
GO:2000032 regulation of secondary shoot formation 生物过程
GO:0005777 peroxisome 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0016887 ATP hydrolysis activity 分子功能
GO:0140359 ABC-type transporter activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G26910
dosa:Os01g0177900
dosa:Os01g0609900
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.388
排名 1 · TkA08G175050 · TK1151
溶酶体／液泡0.237
排名 2 · TkA08G175050 · TK1151
内质网0.200
排名 3 · TkA08G175050 · TK1151
细胞质0.125
排名 4 · TkA08G175050 · TK1151
高尔基体0.112
排名 5 · TkA08G175050 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF14510ABC_trans_N68-120 aa
PF13191AAA_16136-182 aa
PF25199nSTAND_NTPase5141-181 aa
PF00005ABC_tran146-327 aa
PF09818ABC_ATPase147-177 aa
PF03193RsgA_GTPase148-180 aa
PF13481AAA_25149-181 aa
PF20720nSTAND3149-179 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G175050PF14510ABC_trans_N681204.2e-0627.8
TkA08G175050PF13191AAA_161361827.7e-0730.5
TkA08G175050PF25199nSTAND_NTPase51411810.04614.3
TkA08G175050PF00005ABC_tran1463274.8e-37128.3
TkA08G175050PF09818ABC_ATPase1471770.939.2
TkA08G175050PF03193RsgA_GTPase1481800.06913.7
TkA08G175050PF13481AAA_251491810.0001122.6
TkA08G175050PF20720nSTAND31491790.04314.2
TkA08G175050PF02367TsaE1511820.1612.6
TkA08G175050PF13555AAA_291541765.1e-0523.7
TkA08G175050PF13604AAA_301551770.008216.6
TkA08G175050PF03215Rad171551860.113.3
TkA08G175050PF13476AAA_231561960.0006121.2
TkA08G175050PF13401AAA_221571810.0116.9
TkA08G175050PF13173AAA_141571810.05814.1
TkA08G175050PF05729NACHT1571830.06413.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
O81016拟南芥sp|O81016|AB32G_ARATH ABC transporter G family member 3267.500%Swiss-Prot高置信
Q8GU87水稻sp|Q8GU87|AB31G_ORYSJ ABC transporter G family member 3166.400%Swiss-Prot高置信
Q0JLC5水稻sp|Q0JLC5|AB36G_ORYSJ ABC transporter G family member 3656.300%Swiss-Prot高置信
A3BXL8水稻sp|A3BXL8|AB53G_ORYSJ ABC transporter G family member 5355.900%Swiss-Prot高置信

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