RubberDandelionOmics 橡胶草多组学网站
更多
转录组数据查询 注释 橡胶合成 转录因子预测 靶基因 蛋白关联网络 重测序 工具 下载
ZH EN

本页使用教程

基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G173960
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 45494529-45494918 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

390 bp · TkA08G173960|TK1151|cDNA

ATGGTGGACGCGAAGAAGATGAAGAGGATGATATCGAACAGGGAATCTGCAAGGAAGTCTAGAATGAAGAAAGAAAAACACATGAACGATCTAAATCAGCAAATCTTCTATTTCAGGAAAAGGAGAGACGAAATGGTTATGAAAATCGAAGGAATTGCGAAAGGGCATTCTGAGTTGGAAATGGAGAACGTAGTTTTGAGAACACAGAAACAAGAGTTGGAAAATAGATTAGAATATGCAAATAGTGTTTGTGATTGGTA...

CDS

下载 CDS FASTA

390 bp · TkA08G173960|TK1151|CDS

ATGGTGGACGCGAAGAAGATGAAGAGGATGATATCGAACAGGGAATCTGCAAGGAAGTCTAGAATGAAGAAAGAAAAACACATGAACGATCTAAATCAGCAAATCTTCTATTTCAGGAAAAGGAGAGACGAAATGGTTATGAAAATCGAAGGAATTGCGAAAGGGCATTCTGAGTTGGAAATGGAGAACGTAGTTTTGAGAACACAGAAACAAGAGTTGGAAAATAGATTAGAATATGCAAATAGTGTTTGTGATTGGTA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

129 aa · TkA08G173960|TK1151|PROTEIN

MVDAKKMKRMISNRESARKSRMKKEKHMNDLNQQIFYFRKRRDEMVMKIEGIAKGHSELEMENVVLRTQKQELENRLEYANSVCDWYENDGVSRSSMGVVQEPWLRPLEQQQQQPTNSMPMFMGFISSK

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G173960
TK1151 IDTkA08G173960
OH-1004 IDLXL04_032424
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.200
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 94.853
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G173960
位置Chr08:45494529-45494918 (+)
描述Similar to BZIP44: bZIP transcription factor 44
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g75390 与 MAN7 启动子的 DNA G-box 基序 5'- CACGTG-3' 结合的转录因子。
Arabidopsis thaliana bZIP44: a transcription factor affecting seed germination and expression of the mannanase-encoding gene AtMAN7.2013 · DOI: 10.1111/tpj.12162
At3g62420 可能结合靶基因启动子中的特定序列并激活转录。
A novel subgroup of bZIP proteins functions as transcriptional activators in hypoosmolarity-responsive expression of the ProDH gene in Arabidopsis.2004 · DOI: 10.1093/pcp/pch036
Combinatorial control of Arabidopsis proline dehydrogenase transcription by specific heterodimerisation of bZIP transcription factors.2006 · DOI: 10.1038/sj.emboj.7601206
A pivotal role of the basic leucine zipper transcription factor bZIP53 in the regulation of Arabidopsis seed maturation gene expression based on heterodimerization and protein complex formation.2009 · DOI: 10.1105/tpc.108.062968
Heterodimers of the Arabidopsis transcription factors bZIP1 and bZIP53 reprogram amino acid metabolism during low energy stress.2011 · DOI: 10.1105/tpc.110.075390
A novel method to identify the DNA motifs recognized by a defined transcription factor.2014 · DOI: 10.1007/s11103-014-0234-5
At4g34590 转录因子，可结合靶基因启动子中的 DNA 序列 5'-ACTCAT-3'。
A novel subgroup of bZIP proteins functions as transcriptional activators in hypoosmolarity-responsive expression of the ProDH gene in Arabidopsis.2004 · DOI: 10.1093/pcp/pch036
The sucrose regulated transcription factor bZIP11 affects amino acid metabolism by regulating the expression of ASPARAGINE SYNTHETASE1 and PROLINE DEHYDROGENASE2.2008 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2007.03385.x
The sucrose-regulated Arabidopsis transcription factor bZIP11 reprograms metabolism and regulates trehalose metabolism.2011 · DOI: 10.1111/j.1469-8137.2011.03735.x
The Arabidopsis transcription factor bZIP11 activates auxin-mediated transcription by recruiting the histone acetylation machinery.2014 · DOI: 10.1038/ncomms4883
At2g18160 转录因子，可结合靶基因启动子中的特定DNA序列。 暂无已核实直接文献
At5g38800 可能参与体细胞胚胎发生的转录因子。
Stress-related function of bHLH109 in somatic embryo induction in Arabidopsis.2016 · DOI: 10.1016/j.jplph.2016.02.012

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_032424 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006971 hypotonic response 生物过程
GO:0009267 cellular response to starvation 生物过程
GO:0009744 response to sucrose 生物过程
GO:0009845 seed germination 生物过程
GO:0017148 negative regulation of translation 生物过程
GO:0045893 positive regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0080149 sucrose induced translational repression 生物过程
GO:2000693 positive regulation of seed maturation 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0000976 transcription cis-regulatory region binding 分子功能
GO:0003700 DNA-binding transcription factor activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G75390
ath:AT2G18160
ath:AT3G62420
ath:AT4G34590
zma:542394
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.973
排名 1 · TkA08G173960 · TK1151
细胞质0.090
排名 2 · TkA08G173960 · TK1151
细胞膜0.020
排名 3 · TkA08G173960 · TK1151
内质网0.010
排名 4 · TkA08G173960 · TK1151
线粒体0.009
排名 5 · TkA08G173960 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF07716bZIP_23-40 aa
PF00170bZIP_14-63 aa
PF06156YabA5-31 aa
PF29997SPC25_N6-78 aa
PF28733PII1_coiled_coil10-80 aa
PF10224DUF220511-67 aa
PF30381CEP135_N22-83 aa
PF06156YabA29-78 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G173960PF07716bZIP_23405.2e-0523.9
TkA08G173960PF00170bZIP_14633.2e-0834.3
TkA08G173960PF06156YabA5310.2312.8
TkA08G173960PF29997SPC25_N6780.01116.8
TkA08G173960PF28733PII1_coiled_coil10800.04113.0
TkA08G173960PF10224DUF220511670.1113.3
TkA08G173960PF30381CEP135_N22830.006316.2
TkA08G173960PF06156YabA29780.2312.8
TkA08G173960PF00170bZIP_138783.2e-0834.3
TkA08G173960PF07716bZIP_247755.2e-0523.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
C0Z2L5拟南芥sp|C0Z2L5|BZP44_ARATH bZIP transcription factor 4440.400%Swiss-Prot中等置信
Q9LZP8拟南芥sp|Q9LZP8|BZP53_ARATH bZIP transcription factor 5335.900%Swiss-Prot中等置信
O65683拟南芥sp|O65683|BZP11_ARATH bZIP transcription factor 1136.800%Swiss-Prot中等置信
Q9SI15拟南芥sp|Q9SI15|BZIP2_ARATH bZIP transcription factor 236.100%Swiss-Prot中等置信
Q9FMC2拟南芥sp|Q9FMC2|BZP43_ARATH Basic leucine zipper 4334.200%Swiss-Prot中等置信

JBrowse

在基因组浏览器中查看