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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G171940
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 44949155-44954398 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3150 bp · TkA08G171940|TK1151|cDNA

ATGTTTTCTTCATCTTCCTCCGACCTATTTACTCACTTACGAATCCCACACAGAGACATAGTAAACGCCACCAACCACTTTTCCGACGCCAACCTCATCCGCGGAAATAACATCCGAAAGGAGTACAAAGGTCAACTCTTGCACTCCGGTCAATTGATCGATGTTGTTGTCCGGAGACAGAGGTTCAAAAGAATGCAAAAAGATGCATACAGAGAGCACTGGATGGAGGTTTCGATGCTTTCTAAACTAAACCATAAAAA...

CDS

下载 CDS FASTA

3150 bp · TkA08G171940|TK1151|CDS

ATGTTTTCTTCATCTTCCTCCGACCTATTTACTCACTTACGAATCCCACACAGAGACATAGTAAACGCCACCAACCACTTTTCCGACGCCAACCTCATCCGCGGAAATAACATCCGAAAGGAGTACAAAGGTCAACTCTTGCACTCCGGTCAATTGATCGATGTTGTTGTCCGGAGACAGAGGTTCAAAAGAATGCAAAAAGATGCATACAGAGAGCACTGGATGGAGGTTTCGATGCTTTCTAAACTAAACCATAAAAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

1049 aa · TkA08G171940|TK1151|PROTEIN

MFSSSSSDLFTHLRIPHRDIVNATNHFSDANLIRGNNIRKEYKGQLLHSGQLIDVVVRRQRFKRMQKDAYREHWMEVSMLSKLNHKNIVSIVGCCDENMEMIVVNKHEAIGSLDNFLRDPTLTWMRRLQICVGIARALSFIYYDPGRDFSVIHRDIKSFNILLGDNWEAKLSGFEHSMNQTAARRNHLFLTDVCGTEGYIDPTYTKSGSVTHKSDIYSFGVVLFEVLCGKEAASMADDVDDPDRYLLASSVRSEYEGGRL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G171940
TK1151 IDTkA08G171940
OH-1004 IDLXL04_032398
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)68.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 97.998 / OH-1004 73.223
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G171940
位置Chr08:44949155-44954398 (+)
描述Similar to At5g24010: Probable receptor-like protein kinase At5g24010
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g59700 可能的受体样蛋白激酶 At5g59700。 暂无已核实直接文献
At3g51550 可能通过调节雌配子体助细胞中 MLO7 的极性定位，参与受精时对花粉管生长及雄配子递送的调控。
FERONIA receptor-like kinase regulates RHO GTPase signaling of root hair development.2010 · DOI: 10.1073/pnas.1005366107
At3g46290 营养生长过程中细胞伸长所需的受体样蛋白激酶，主要以油菜素甾醇 独立的方式进行。
Three related receptor-like kinases are required for optimal cell elongation in Arabidopsis thaliana.2009 · DOI: 10.1073/pnas.0812346106
At5g24010 可能的受体样蛋白激酶 At5g24010。 暂无已核实直接文献
At2g23200 可能的受体样蛋白激酶At2g23200。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_032398 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009723 response to ethylene 生物过程
GO:0009738 abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0009741 response to brassinosteroid 生物过程
GO:0009742 brassinosteroid mediated signaling pathway 生物过程
GO:0009788 negative regulation of abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0009791 post-embryonic development 生物过程
GO:0009873 ethylene-activated signaling pathway 生物过程
GO:0010118 stomatal movement 生物过程
GO:0010483 pollen tube reception 生物过程
GO:0030308 negative regulation of cell growth 生物过程
GO:0032922 circadian regulation of gene expression 生物过程
GO:0046777 protein autophosphorylation 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G51550
ath:AT5G24010
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.501
排名 1 · TkA08G171940 · TK1151
细胞质0.373
排名 2 · TkA08G171940 · TK1151
细胞核0.235
排名 3 · TkA08G171940 · TK1151
内质网0.049
排名 4 · TkA08G171940 · TK1151
高尔基体0.041
排名 5 · TkA08G171940 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF07714PK_Tyr_Ser-Thr43-304 aa
PF00069Pkinase63-301 aa
PF29315BUD8_BUD9_C94-138 aa
PF15942DUF4751123-174 aa
PF01636APH147-167 aa
PF17667Pkinase_fungal150-166 aa
PF03109ABC1263-293 aa
PF17748VID27_N271-297 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G171940PF07714PK_Tyr_Ser-Thr433041e-113379.6
TkA08G171940PF00069Pkinase633013.4e-110368.3
TkA08G171940PF29315BUD8_BUD9_C941380.02715.7
TkA08G171940PF15942DUF47511231740.8410.4
TkA08G171940PF01636APH1471673.7e-0524.3
TkA08G171940PF17667Pkinase_fungal1501660.0009818.7
TkA08G171940PF03109ABC12632930.06913.0
TkA08G171940PF17748VID27_N2712970.001918.8
TkA08G171940PF17275DUF53402843190.01116.5
TkA08G171940PF12330Haspin_kinase3335380.03913.7
TkA08G171940PF00069Pkinase3603753.4e-110368.3
TkA08G171940PF07714PK_Tyr_Ser-Thr3626021e-113379.6
TkA08G171940PF00069Pkinase3966023.4e-110368.3
TkA08G171940PF29500SMIM24645030.1113.3
TkA08G171940PF15942DUF47514725250.8410.4
TkA08G171940PF17667Pkinase_fungal4915310.0009818.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9FN92拟南芥sp|Q9FN92|Y5597_ARATH Probable receptor-like protein kinase At5g5970041.200%Swiss-Prot低置信
Q9SCZ4拟南芥sp|Q9SCZ4|FERON_ARATH Receptor-like protein kinase FERONIA36.500%Swiss-Prot低置信
Q9LX66拟南芥sp|Q9LX66|HERK_ARATH Receptor-like protein kinase HERK 138.500%Swiss-Prot低置信
Q9FLW0拟南芥sp|Q9FLW0|Y5241_ARATH Probable receptor-like protein kinase At5g2401038.200%Swiss-Prot低置信
O22187拟南芥sp|O22187|Y2232_ARATH Probable receptor-like protein kinase At2g2320042.400%Swiss-Prot低置信

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