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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G169940
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 44459851-44463145 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2766 bp · TkA08G169940|TK1151|cDNA

TTTTGGGTGGATTCATTGTATCTCCTTCTCTCTCTTTCCTCGTTTGTATAAATCAATTCAGTCAATCAAACCTGCCATCATACGTTTTCCTTTTCTCCATTCCCCTCTTTTTGCCCTAAACTTATATGGGTTTCTGCTTTCTTATGATCTCTTCAAGATCTTGATGCATTCATCGCTTACACATCTCTCAATTCTCTGCTTGTTGGTGGATCTGCTCTTTTTTGCTCTCGATCGAGGGTTTTTTGGGCTTTCAGGTCTCG...

CDS

下载 CDS FASTA

1878 bp · TkA08G169940|TK1151|CDS

ATGCAGAAACTCTTTGGGGAAGAGGTTCTTTACCATGGTATGCCAAAATACCATACTCCAGAAGAGTCAAATCTCTTCTTATCCCTTGGTCCTCATGTTGATGTCTACTTCCCTCCTCGCAAGAGGTCAAGAGTCAGTGCCCCTTTTGTCTTATTCTCTGAACAAATCTTCAAAAAACAGCAAACCACCATTGATGCCCTTCCTGATGAATGCCTCTTTGAGATCTTCACACGTGTCACTGGTACCCAAGAGAAAAACGC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

625 aa · TkA08G169940|TK1151|PROTEIN

MQKLFGEEVLYHGMPKYHTPEESNLFLSLGPHVDVYFPPRKRSRVSAPFVLFSEQIFKKQQTTIDALPDECLFEIFTRVTGTQEKNACASVSKRWLMLLSTIHKNEIKQNKIEDLEITNSLTRCLKGKKATDIRLAAISVGTSGHGGLGELSIYGNNASKVTNFGLKAVSRGCTSLTSLTLLNLPSINDEGVVEIANECHLLEKLQLSHCPKISDKSLIAIANNCPNLTSLSIESCSNIKNEGLQEIGKKCPNLKSILIK...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G169940
TK1151 IDTkA08G169940
OH-1004 IDLXL04_032368
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)90.400
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G169940
位置Chr08:44459851-44463145 (+)
描述Similar to EBF1: EIN3-binding F-box protein 1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g25490 SCF(EBF1)型E3泛素连接酶复合物的组分，可能介导靶蛋白（可能包括EIN3和EIL1）的泛素化及随后的蛋白酶体降解。
EIN3-dependent regulation of plant ethylene hormone signaling by two arabidopsis F box proteins: EBF1 and EBF2.2003 · DOI: 10.1016/s0092-8674(03)00968-1
At5g25350 SCF(EBF1)型E3泛素连接酶复合物的组分，可能介导靶蛋白（可能包括EIN3和EIL1）的泛素化及随后的蛋白酶体降解。
EIN3-dependent regulation of plant ethylene hormone signaling by two arabidopsis F box proteins: EBF1 and EBF2.2003 · DOI: 10.1016/s0092-8674(03)00968-1

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_032368 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006289 nucleotide-excision repair 生物过程
GO:0006511 ubiquitin-dependent protein catabolic process 生物过程
GO:0009723 response to ethylene 生物过程
GO:0009873 ethylene-activated signaling pathway 生物过程
GO:0010105 negative regulation of ethylene-activated signaling pathway 生物过程
GO:0010225 response to UV-C 生物过程
GO:0016567 protein ubiquitination 生物过程
GO:0031146 SCF-dependent proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0019005 SCF ubiquitin ligase complex 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G25490
ath:AT4G15475
ath:AT5G25350
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.820
排名 1 · TkA08G169940 · TK1151
细胞质0.134
排名 2 · TkA08G169940 · TK1151
细胞膜0.044
排名 3 · TkA08G169940 · TK1151
质体0.040
排名 4 · TkA08G169940 · TK1151
内质网0.018
排名 5 · TkA08G169940 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF12937F-box-like64-99 aa
PF00646F-box65-100 aa
PF12799LRR_4109-123 aa
PF24758LRR_At5g56370147-262 aa
PF25372LRR_FBXL15159-328 aa
PF24048LRR_NXF1-5162-210 aa
PF12799LRR_4163-183 aa
PF13855LRR_8171-185 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G169940PF12937F-box-like64998.7e-0522.9
TkA08G169940PF00646F-box651000.0009319.7
TkA08G169940PF12799LRR_41091231.2e-0629.2
TkA08G169940PF24758LRR_At5g563701472622.3e-0731.4
TkA08G169940PF25372LRR_FBXL151593284e-2795.5
TkA08G169940PF24048LRR_NXF1-51622100.0314.7
TkA08G169940PF12799LRR_41631831.2e-0629.2
TkA08G169940PF13855LRR_81711850.0116.3
TkA08G169940PF27094DUF83461742231e-0525.0
TkA08G169940PF12799LRR_41772151.2e-0629.2
TkA08G169940PF29594LRR_SKP21853651.8e-2383.9
TkA08G169940PF13516LRR_61871963.4e-1658.6
TkA08G169940PF28505DUF1699_N1892140.007516.7
TkA08G169940PF13516LRR_61992223.4e-1658.6
TkA08G169940PF23247LRR_RPS22012620.2911.8
TkA08G169940PF12799LRR_42022401.2e-0629.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9SKK0拟南芥sp|Q9SKK0|EBF1_ARATH EIN3-binding F-box protein 156.400%Swiss-Prot高置信
Q708Y0拟南芥sp|Q708Y0|EBF2_ARATH EIN3-binding F-box protein 253.200%Swiss-Prot高置信

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